Microarray 類型和資訊

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組織Microarrays

組織Microarrays 簡介:

組織microarrays (TMAs) 被使用同時分析基因表達式在多個各自的組織樣品在一張幻燈片。TMAs 由組織小0.6 - 3.0 毫米核心組成從排列在高密在幻燈片的施主組織石蠟塊。

組織microarray

技術洞察: biomarkers 的確定以組織microarray 技術耶拿M Giltnane 和大衛L Rimm 本質臨床實踐腫瘤學(2004) 1, 104-111

組織Microarrays 允許組織對常規histologic 石蠟塊的傳統分析成為miniturized 和高生產量。

Histochemical 和分子檢測技術可能被使用在TMA 幻燈片, 和因而允許TMAs 是強有力的工具審查基因表達描出在疾病狀態橫跨各種各樣的患者和疾病情況。

組織Microarray 內容

TMA 簡介

組織列陣的特性

組織Microarray 綜合

申請

TMAs 好處

類型組織列陣

分析軟體

組織芯片參考

組織Microarrays 的特性:

 

組織Microarray 綜合:

組織Microarrays 被生產使用區分組織入4 個- 5 個測微表部分的切片機(參見圖1 上面) 。這些挖出果核組織切片檢查法部分被採取從特定興趣範圍從石蠟嵌入組織塊。  組織這些cynlindrical 核心re 被埋置入排列的空白的接收塊。運用這個方法, 超過500 個組織核心可能排列在一張唯一幻燈片! 主要資料塊由Konenen 等開發了。

 

組織Microarrays 的申請:

tma

組織列陣或組織芯片好處:

 

類型組織Microarrays:

Cryo - 組織Microarrays: Cryo-TMAs 使用被埋置在一種優選的剪切溫度化合物的凍結組織。這些cryo-TMAs 由於他們凍結在甲醛水被修理的組織是優越為核糖核酸和蛋白質分析。並且, 抗體運作betterl 與凍結組織。

多腫瘤組織Microarrays : 多腫瘤TMAs 有許多不同的類型組織被排列在幻燈片。技術由Kononen 等1998 年第一次使用。 Kononen 使用這類型TMA 檢測6 基因放大作用表達式並且被審查在乳腺癌組織的p53 。

累進組織Microarrays: 這類型組織microarray 審查腫瘤(或疾病) 累進不同的階段在一種指定的器官之內。例如, 腫瘤的考試在乳房。這些幻燈片可能然後被檢驗為標記利益, 或對範例的生物化學的分析可能完成。

預測組織Microarrays: 疾病範例譬如腫瘤切片檢查法可能被採取從患者和被審查。這些範例可能被使用為臨床跟催監控患者的累進。資料被分析和然後與其它臨床資料比較。

 

組織Microarray 軟體和Bioinformatics:

為對組織Microarrays 的高生產量分析的軟體工具: 圖像存檔和資料分析

包含以下軟體:

TMA-Deconvoluter 和Stainfinder 。deconvoluter 轉換未加工的計分的工作表從3-D 組織Microarray 格式成第2 被製成表的表格式化適當為進一步資料分析。

組織列陣資料分析 : 軟體對創建一個交互選擇資料庫為TMA 圖像觀察和資料輸入。

TAD: 組織列陣資料庫 軟體為下載。

TMAJ : 套軟體工具□去□常管理組織MicroArray (TMA) 資料和資訊。

原始組織Microarray 參考紙:

Battifora H: multitumor (香腸) 組織塊: 新穎的方法為immunohistochemical 抗體測試。實驗室投資1986 年, 55:244-248 。

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi 操作: 組織microarrays 為高生產量分子描出腫瘤標本。Nat Med 1998 年, 4:844-847 。