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組織微陣列
菜單

組織微陣列

組織微陣列簡介:

組織微陣列(TMAs)在一張幻燈片的多個各自的組織樣品被用於同時分析基因表達式。 TMAs由組織的小的0.6 - 3.0 mm核心從排列在幻燈片的高密的施主組織石蠟塊的組成。

組織微陣列

技術答案: biomarkers的確定與組織微陣列技術耶拿M Giltnane和大衛L Rimm本質臨床實踐腫瘤學(2004) 1, 104-111的

組織微陣列允許組織對常規組織的石蠟塊的傳統分析變得miniturized和高處理量。

組織化學和分子檢測技術在TMA幻燈片可以使用和因而允許TMAs是檢查基因表達的強大的工具描出在各種各樣的患者和疾病情況間的疾病狀態。

組織微陣列內容

TMA簡介

組織列陣的特性

組織微陣列綜合

應用

TMAs的好處

組織列陣的類型

分析軟件

組織芯片參考

組織微陣列的特性:

  • 50個- 500個組織或可以每個幻燈片塊更被分析
  • 高處理量
  • 相對地低成本
  • 能弄髒與各種各樣的汙點例如被弄髒的H & E
  • 幻燈片可以分析以技術寬種類
  • 自動分析和與許多技術的數據收集

 

組織微陣列綜合:

組織微陣列導致使用區分組織到4個- 5個測微表部分的切片機(參見上述的圖1)。 這些挖出果核組織切片檢查法部分從特定興趣範圍從石蠟嵌入組織塊的被採取。  組織的這些cynlindrical核心再被埋置到排列的空白接收塊。 使用此方法,超過500個組織核心在一張唯一幻燈片可以排列! 主要資料塊由Konenen等開發。

 

組織微陣列的應用:

  • Immunohistochemistry
  • 弄髒: H & E, HC, ISH,
  • 在原處雜交
  • 螢光在原處雜交(魚)
  • 在原處PCR
  • 核糖核酸或脫氧核糖核酸表達式分析
  • apoptosis的TUNEL檢驗
  • 許多耐心的組織的形態和臨床描述特性

tma

組織列陣或組織芯片的好處:

  • 實驗均一
  • 允許放大作用(和保護)缺乏組織樣品
  • 保存檢驗數量
  • 減少被檢查的幻燈片的數量(常規幻燈片組織石蠟)
  • 高處理量
  • 分析可以被自動化,并且數據可以計算機化

 

組織微陣列的類型:

Cryo -組織微陣列: Cryo-TMAs使用在一種最佳的切削溫度化合物被埋置的凍結組織。 這些cryo-TMAs由於他們凍結在甲醛水核糖核酸和蛋白質分析的被修理的組織是優越。 並且,抗體運作與凍結組織的betterl。

多腫瘤組織微陣列: 多腫瘤TMAs有在幻燈片對齊的組織的許多不同的類型。 kononen等首先使用技術, 1998年。 Kononen使用此種TMA檢測6基因放大作用。 p53表達式在乳腺癌組織也被檢查。

累進組織微陣列: 此種組織微陣列檢查腫瘤(或疾病)累進不同的階段在一種特定器官之內的。 例如,腫瘤的考試在乳房的。 這些幻燈片可能為標記利益然後被檢驗,或者對範例的生物化學的分析可以完成。

預測組織微陣列: 疾病範例例如腫瘤切片檢查法可以從患者被採取和被檢查。 這些範例可以被用於為了臨床後續能監控患者的累進。 數據然後分析并且與其他臨床數據比較。

 

組織微陣列軟件和分析複雜生物資料的學科:

為對組織微陣列的高處理量分析的軟件工具: 存檔的圖像和數據分析

包含下列軟件:

TMA-Deconvoluter和Stainfinder。 deconvoluter轉換從三維組織微陣列格式的原始的計分的工作表成第2個被製成表的表格式適用於進一步數據分析。

組織列陣數據分析: 對創建一個交互選擇數據庫的軟件的TMA圖像查看和數據輸入。

TAD : 組織列陣下載的數據庫軟件。

TMAJ : 套被用於的軟件工具管理組織微陣列(TMA)數據和信息。

原始組織微陣列參考紙張:

Battifora H : multitumor (香腸)組織塊: immunohistochemical抗體測試的新穎的方法。 實驗室投資1986年, 55:244 - 248。

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G,操作的Kallioniemi : 高處理量分子描出的組織微陣列腫瘤標本。 nat Med 1998年, 4:844 - 847。