短的Oligonucleotide 列陣


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DNA Microarray 協議

短的Oligonucleotide 列陣被創建使用原地photolithographic 綜合

25-mer oligos 化工被綜合載玻片運用photolithographic 方法由Affymetrix 原始作早期工作在。 Digitally-controlled 微鏡子現在被使用在photolithographic 列印的技術。

載玻片給套上外套按包含相片易變的化工組的綜合連接器。屏蔽被使用指揮光對被預先決定的位置在幻燈片並且這去除被暴露的組。無保護的組可能然後被耦合與bi 功能deoxy nucleotide triphosphates dNTPs 。

新建屏蔽是被使用的為了直接聯結在其它站點直到oligos 的渴望的順序和長度被綜合。

Affymetrix 芯片可能有500,000 根25-mer oligo 探針排列在1.25x1.25 cm 幻燈片!

從任何地方10 根到20 根不同oligo 探針被綜合使各個基因鋪磁磚從mRNA 的3' 結尾。有被綜合作為完善的符合的oligos (被選定PM), 並且配錯成對(毫米) 。

各毫米成對有一基礎成對配錯在oligo 的中心, 允許一個控制為背景噪聲和允許交叉雜交的正常化。

- 短的oligos 有交叉雜交問題

- 必須因此使用許多oligo 控制為各個基因目標