Microarray 类型和信息

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组织Microarrays

组织Microarrays 简介:

组织microarrays (TMAs) 被使用同时分析基因表达式在多个各自的组织样品在一张幻灯片。TMAs 由组织小0.6 - 3.0 毫米核心组成从排列在高密在幻灯片的施主组织石蜡块。

组织microarray

技术洞察: biomarkers 的确定以组织microarray 技术耶拿M Giltnane 和大卫L Rimm 本质临床实践肿瘤学(2004) 1, 104-111

组织Microarrays 允许组织对常规histologic 石蜡块的传统分析成为miniturized 和高生产量。

Histochemical 和分子检测技术可能被使用在TMA 幻灯片, 和因而允许TMAs 是强有力的工具审查基因表达描出在疾病状态横跨各种各样的患者和疾病情况。

组织Microarray 内容

TMA 简介

组织列阵的特性

组织Microarray 综合

申请

TMAs 好处

类型组织列阵

分析软件

组织芯片参考

组织Microarrays 的特性:

 

组织Microarray 综合:

组织Microarrays 被生产使用区分组织入4 个- 5 个测微表部分的切片机(参见图1 上面) 。这些挖出果核组织切片检查法部分被采取从特定兴趣范围从石蜡嵌入组织块。  组织这些cynlindrical 核心re 被埋置入排列的空白的接收块。运用这个方法, 超过500 个组织核心可能排列在一张唯一幻灯片! 主要资料块由Konenen 等开发了。

 

组织Microarrays 的申请:

tma

组织列阵或组织芯片好处:

 

类型组织Microarrays:

Cryo - 组织Microarrays: Cryo-TMAs 使用被埋置在一种优选的剪切温度化合物的冻结组织。这些cryo-TMAs 由于他们冻结在甲醛水被修理的组织是优越为核糖核酸和蛋白质分析。并且, 抗体运作betterl 与冻结组织。

多肿瘤组织Microarrays : 多肿瘤TMAs 有许多不同的类型组织被排列在幻灯片。技术由Kononen 等1998 年第一次使用。 Kononen 使用这类型TMA 检测6 基因放大作用表达式并且被审查在乳腺癌组织的p53 。

累进组织Microarrays: 这类型组织microarray 审查肿瘤(或疾病) 累进不同的阶段在一种指定的器官之内。例如, 肿瘤的考试在乳房。这些幻灯片可能然后被检验为标记利益, 或对范例的生物化学的分析可能完成。

预测组织Microarrays: 疾病范例譬如肿瘤切片检查法可能被采取从患者和被审查。这些范例可能被使用为临床跟催监控患者的累进。数据被分析和然后与其它临床数据比较。

 

组织Microarray 软件和Bioinformatics:

为对组织Microarrays 的高生产量分析的软件工具: 图象存档和数据分析

包含以下软件:

TMA-Deconvoluter 和Stainfinder 。deconvoluter 转换未加工的计分的工作表从3-D 组织Microarray 格式成第2 被制成表的表格式化适当为进一步数据分析。

组织列阵数据分析 : 软件对创建一个交互选择数据库为TMA 图象观察和数据输入。

TAD: 组织列阵数据库 软件为下载。

TMAJ : 套软件工具过去经常管理组织MicroArray (TMA) 数据和信息。

原始组织Microarray 参考纸:

Battifora H: multitumor (香肠) 组织块: 新颖的方法为immunohistochemical 抗体测试。实验室投资1986 年, 55:244-248 。

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi 操作: 组织microarrays 为高生产量分子描出肿瘤标本。Nat Med 1998 年, 4:844-847 。