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组织微阵列
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组织微阵列

组织微阵列简介:

组织微阵列(TMAs)在一张幻灯片的多个各自的组织样品被用于同时分析基因表达式。 TMAs由组织的小的0.6 - 3.0 mm核心从排列在幻灯片的高密的施主组织石蜡块的组成。

组织微阵列

技术答案: biomarkers的确定与组织微阵列技术耶拿M Giltnane和大卫L Rimm本质临床实践肿瘤学(2004) 1, 104-111的

组织微阵列允许组织对常规组织的石蜡块的传统分析变得miniturized和高处理量。

组织化学和分子检测技术在TMA幻灯片可以使用和因而允许TMAs是检查基因表达的强大的工具描出在各种各样的患者和疾病情况间的疾病状态。

组织微阵列内容

TMA简介

组织列阵的特性

组织微阵列综合

应用

TMAs的好处

组织列阵的类型

分析软件

组织芯片参考

组织微阵列的特性:

  • 50个- 500个组织或可以每个幻灯片块更被分析
  • 高处理量
  • 相对地低成本
  • 能弄脏与各种各样的污点例如被弄脏的H & E
  • 幻灯片可以分析以技术宽种类
  • 自动分析和与许多技术的数据收集

 

组织微阵列综合:

组织微阵列导致使用区分组织到4个- 5个测微表部分的切片机(参见上述的图1)。 这些挖出果核组织切片检查法部分从特定兴趣范围从石蜡嵌入组织块的被采取。  组织的这些cynlindrical核心再被埋置到排列的空白接收块。 使用此方法,超过500个组织核心在一张唯一幻灯片可以排列! 主要资料块由Konenen等开发。

 

组织微阵列的应用:

  • Immunohistochemistry
  • 弄脏: H & E, HC, ISH,
  • 在原处杂交
  • 萤光在原处杂交(鱼)
  • 在原处PCR
  • 核糖核酸或脱氧核糖核酸表达式分析
  • apoptosis的TUNEL检验
  • 许多耐心的组织的形态和临床描述特性

tma

组织列阵或组织芯片的好处:

  • 实验均一
  • 允许放大作用(和保护)缺乏组织样品
  • 保存检验数量
  • 减少被检查的幻灯片的数量(常规幻灯片组织石蜡)
  • 高处理量
  • 分析可以被自动化,并且数据可以计算机化

 

组织微阵列的类型:

Cryo -组织微阵列: Cryo-TMAs使用在一种最佳的切削温度化合物被埋置的冻结组织。 这些cryo-TMAs由于他们冻结在甲醛水核糖核酸和蛋白质分析的被修理的组织是优越。 并且,抗体运作与冻结组织的betterl。

多肿瘤组织微阵列: 多肿瘤TMAs有在幻灯片对齐的组织的许多不同的类型。 kononen等首先使用技术, 1998年。 Kononen使用此种TMA检测6基因放大作用。 p53表达式在乳腺癌组织也被检查。

累进组织微阵列: 此种组织微阵列检查肿瘤(或疾病)累进不同的阶段在一种特定器官之内的。 例如,肿瘤的考试在乳房的。 这些幻灯片可能为标记利益然后被检验,或者对范例的生物化学的分析可以完成。

预测组织微阵列: 疾病范例例如肿瘤切片检查法可以从患者被采取和被检查。 这些范例可以被用于为了临床后续能监控患者的累进。 数据然后分析并且与其他临床数据比较。

 

组织微阵列软件和分析复杂生物资料的学科:

为对组织微阵列的高处理量分析的软件工具: 存档的图象和数据分析

包含下列软件:

TMA-Deconvoluter和Stainfinder。 deconvoluter转换从三维组织微阵列格式的原始的计分的工作表成第2个被制成表的表格式适用于进一步数据分析。

组织列阵数据分析: 对创建一个交互选择数据库的软件的TMA图象查看和数据输入。

TAD : 组织列阵下载的数据库软件。

TMAJ : 套被用于的软件工具管理组织微阵列(TMA)数据和信息。

原始组织微阵列参考纸张:

Battifora H : multitumor (香肠)组织块: immunohistochemical抗体测试的新颖的方法。 实验室投资1986年, 55:244 - 248。

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G,操作的Kallioniemi : 高处理量分子描出的组织微阵列肿瘤标本。 nat Med 1998年, 4:844 - 847。