短的低聚核苷酸列阵


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DNA Microarray 协议

短的低聚核苷酸列阵被创建使用原地photolithographic 综合

25-mer oligos 化工被综合载玻片运用photolithographic 方法由Affymetrix 原始作早期工作在。 Digitally-controlled 微镜子现在被使用在photolithographic 打印的技术。

载玻片给套上外套按包含相片易变的化工组的综合连接器。屏蔽被使用指挥光对被预先决定的位置在幻灯片并且这去除被暴露的组。无保护的组可能然后被耦合与bi 功能deoxy 核苷酸triphosphates dNTPs 。

新建屏蔽是被使用的为了直接联结在其它站点直到oligos 的渴望的顺序和长度被综合。

Affymetrix 芯片可能有500,000 根25-mer oligo 探针排列在1.25x1.25 cm 幻灯片!

从任何地方10 根到20 根不同oligo 探针被综合使各个基因铺磁砖从mRNA 的3' 结尾。有被综合作为完善的符合的oligos (被选定PM), 并且配错成对(毫米) 。

各毫米成对有一基础成对配错在oligo 的中心, 允许一个控制为背景噪声和允许交叉杂交的正常化。

- 短的oligos 有交叉杂交问题

- 必须因此使用许多oligo 控制为各个基因目标