底漆和Oligo 设计工具
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更加雷管的设计工具和Oligo 软件:
软件、程序, 和为底漆和低聚核苷酸设计的联机bioinformatic 工具。
我们推荐以下:
列阵设计员 Premier Biosoft International 。可能设计底漆为DNA 或oligo 列阵的软件。
烽火台设计员 Premier Biosoft International 。
OligoArray2.1 OligoArray 2.0 和新版本2.1 是计算基因特定低聚核苷酸的免费软件程序包
染色体称低聚核苷酸microarray 建筑。参考[PubMed] 自由
Oligodb - Oligodb 是一个基于互联网的程序为DNA oligos 交互选择人的基因的设计为副本描出和杂交。oligodb 程序确定oligos 使用人的DNA 抄本数据从ENSEMBL 。参考[PubMed] [pdf]
OligoPicker - OligoPicker 可能选择五根oligo 探针为您为microarray 察觉提供的每个DNA 顺序。参考[PubMed] 自由
PrimerQuest 任意
可能设计千位更加雷管的成对 放大一套未结读取框架的染色体宽自动化的更加雷管的定位程序服务器(空白) 软件(ORFs) 包括一条整体染色体。 自由
染色体自豪感 GenomePRIDE 是设计PCR 底漆或长式oligos 根据附注的顺序的一个更加雷管的设计软件工具。
GenomePRIDE 被使用了为设计许多DNA arrays/chips 。 自由
染色体研究的Primer3 Whitehead Institute/MIT 中心, 自由
更加雷管的Premier Premier Biosoft International 。
PRIMEGENS- Primegens (更加雷管的设计使用基因特定片段) 是您使用所选的基因特定片段的计算机程序并且它然后设计更加雷管的成对为PCR 放大作用。参考[PubMed]
ProbeWiz 服务器 - CBS ProbeWiz 万维网服务器预言优选的PCR 底漆成对为探针的生成为DNA 列阵。参考[PubMed]
ProMide - ProMide 是指令线路为探针选择和Microarray 设计的工具的一件收藏品。 自由
Sarani - Sarani 金子(染色体Oligo 设计员) 是一个软件为优选的低聚核苷酸探针自动大规模设计为microarray 实验。千位基因顺序可能一起被分析并且最佳的可利用的低聚核苷酸探针以统一热力学属性和最小的相似性对未指明的基因可能被选择。子线Genomics 产品。
STACKdb - STACKdb 、顺序货签对准线和公众舆论Knowledgebase, 由处理EST 和mRNA 顺序生成被获得从Genbank 通过管道包括的屏蔽, 使成群, 对准线和差异分析步骤。STACKdb 数据库被创建使用工具叫做"stackPACK" 。并且可利用的通过 电遗传学。 自由
视觉OMP - 视觉OMP 采摘底漆并且不横渡杂交互相的oligo 探针并且其它目标。使用OMP (低聚核苷酸塑造平台) 引擎, 根据科学研究由核酸热力学专家, 约翰·SantaLucia 博士。 DNA 软件, 公司。
WebPrimer 任意
Xpression 底漆 Premier Biosoft International 。
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