Protein Microarrays Protein microarrays
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Besök Molecular Station för en stor artikel om antikroppar och protein microarrays
Protein Chips: Protein Marker:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Protein microarrays kan baseras på någon ligand-binding assay som bygger på bildandet av produkt med ett immobilized fånga molekyl och en målmolekylen närvarande i lösningen. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Dessa analyser kan miniturized och placeras på ett protein microarray chip.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Protein microarrays nu börjar bli väldigt populär på grund av deras eventuella framtida ansökningar i studien av nukleinsyra-protein, protein-protein, ligand-receptor-, narkotika-protein-målet och enzym-substrat interaktioner.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Typer av Capture molekyler för Protein Microarray Chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. För att analysera protein interaktioner med andra molekyler, protein microarrays kan ha olika typer av molekyler immobilisering på bilden ovan att agera som fångst molekyler i det protein microarray analysen.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Figur 1 visar de vanligaste protein array, antibody microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Antikroppar är fläckig på ett glas slide. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. Två cell lysates med protein som heter med Cy3 och Cy5 (till exempel cancer vs normalt) läggs till som en lösning på protein array. Signals are detected from the two different signals. Signaler upptäcks från två olika signaler. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Data beräknas möjliggör en analys av hur mycket dye-märkt protein antikropparna på varje plats är bindande. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Denna information tillåter en att avgöra om det protein expression är upp-reglerade i cancer, ned-reglerade eller oförändrade.
Figure 2. Figur 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) visar protein arrayer som är baserade på microarray analys av antigen-antikropp interaktioner. Antigens are spotted onto glass slides. Antigener är fläckig på glasskivor. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Antikroppar som är märkta binder till antigener och avger fluorescerande signal (visas som den gula stjärnan) som sedan kan detekteras från platsen på matrisen.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) Visar ett protein microarray bestå av inslag som fungerar som smörgås immunoassays. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Antikroppar är fläckig på chips och cell lysate eller en lösning tillämpas på bilden. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Antikroppar inkuberas med lösningen, med senare tvätt för att avlägsna icke-specifik bindning. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. Den smörgås komplex bildas avger detekterbar signal från platsen.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) Ett protein-proteininteraktion protein microarray där proteiner är fläckig på ett protein chip, och som heter proteiner läggs till de marker och inkuberas för att avgöra om de kan binda och interagera. A detectable signal is emitted from binding spots. Detekterbar signal släpps ut från bindande fläckar.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) Nucleic Acid-proteininteraktion matris, (här en DNA-protein interaktioner marker). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Nukleinsyror såsom DNA är fläckig på ett glas slide. This could be transcriptional binding sites for example. Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. Detta skulle kunna transcriptional bindningsställen till exempel. Proteiner som fluorescently märkt DNA-bindande transkriptionsfaktorer i lösning skall läggas till de marker och ruvade på matrisen. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. Detekterbar signal släpps ut från DNA-inslag där den binder.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed. Receptor proteins are spotted on glass slides. e) Om du har en uppsättning ligands och du vill hitta de receptorer de binder till kan du använda en receptor-ligand protein chip som visas. Receptor protein är fläckig på glasskivor. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescently heter ligands läggs till chipet. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Bindning av ligand till receptorer orsakar utsläpp av detekterbar signal som ringar in de interagerar spots (dvs. som protein gjorde ligand binder till).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) För att testa för enzym-subrates specificitet arbetar man med ett enzym-substrat protein microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Detta chip består av descrete nano-brunnar i vilka enzymer är bundna. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Substrate läggas in i nano-brunnar och signal utsläpp upptäcks från nano-brunnar för att analysen för enzymet fungera.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
