Among 23 databases, 4 were evaluated precisely (BASE, GeneTraffic, MaxD, RAD ). Bland 23 databaser, 4 utvärderades just (bas, GeneTraffic, MaxD, RAD). Analysed according ot MGED standards. Analyseras med hänsyn ot MGED standarder. Review. Granska. Transcriptome.ens.fr. Sophie Lemoine - [ Read more ] Sophie Lemoine - [Läs mer]

Acuity 4.0 - Enterprise Microarray Informatics. Acuity 4,0 - Enterprise Microarray informatik. cross-platform support, data warehousing, and new enabling analysis and visualization tools. cross-platform support, data warehouse, och nya som möjliggör analys och visualisering verktyg. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Agilent Data Analysis. Agilent dataanalys. Software. ChIP Analytics Software • CGH Analytics Software • Feature Extraction Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring Workgroup • Rosetta Resolver® System - [ Read more ] ChIP Analytics Software • CGH Analytics Software • Feature Extraction Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring Workgroup • Rosetta Resolver ® System - [Läs mer]

The Automated Microarray Pipeline is a series of programs that allow the automated normalization and web publication of microarray data. Den automatiska Microarray Pipeline är en serie program som gör det möjligt för automatiserad normalisering och webb-publicering av microarray-data. Data stored in a MADAM-compliant database, like that provided with MADAM, can be automatically downloaded, normalized - [ Read more ] Data lagras i en MADAM-kompatibel databas, precis som förses med Madam, kan hämtas automatiskt, normaliserade - [Läs mer]

Argus - a microarray database software system which functions to process, analyze, manage, and publish microarray data. Argus - en microarray databasprogramvara system som fungerar för att bearbeta, analysera, hantera och publicera microarray data. Comander et al. Commander et al. A new database system for web-based analysis of multiple microarray datasets. En ny databas för webbaserade analys av flera microarray dataset. Genome Research 2001 11(9):1603-1610. Genome Research 2001 11 (9) :1603-1610. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Arrayplot allows for rapid graphical visalisuation and normalisation of microarray data. Arrayplot möjliggör snabba grafiska visalisuation och normalisering av microarray-data. Also provides a user-friendly interface to visualise data distribution and to view most variant genes. Ger också ett användarvänligt gränssnitt för att visualisera data distribution och för att visa mest variant gener. Permits to calculate normalisation factor based on overall median intensity. Tillstånd att beräkna normalisering faktor baseras på totala median intensitet. Arrayplot. Free software! Gratis programvara! - [ Read more ] -- [Läs mer]

Microarray Image Analysis Software. Microarray Image Analysis Software. A software package developed for the quantification of gene expression arrays. Ett programpaket utvecklat för kvantifiering av genuttryck arrayer. AlphaInnotech - [ Read more ] AlphaInnotech - [Läs mer]

Michael Eisen's software at Stanford - includes ScanAlyze, Cluster and TreeView. Michael Eisen's mjukvara vid Stanford - inkluderar ScanAlyze, Cluster och TreeView. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Doelan is an automated tool which checks the quality of produced DNA microarrays. Doelan är ett automatiserat verktyg som kontrollerar kvaliteten på producerad DNA microarrays. Software is based on the execution of TestSuites on quality control data to validate batches of chips. Mjukvaran bygger på genomförandet av TestSuites om kvalitetskontroll data för att godkänna partier av marker. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Enterprise wide solution for automating and repeating tasks in data processing, analysis and interpretation from diverse data formats (all microarray formats, Mass Spectrometry, 2D Gel). Enterprise bred lösning för att automatisera och upprepa uppgifter i databehandling, analys och tolkning från olika dataformat (alla microarray format, Mass Spectrometry, 2D gel). - [ Read more ] -- [Läs mer]

GenePix Pro 6.0 for Microarray Image Analysis for microarrays, tissue arrays and cell arrays. GenePix Pro 6,0 till Microarray bildanalys för microarrays, tissue arrays och cell-array. New spot-finding algorithms, full spot finding automation, Automatic balancing of PMT gain for all GenePix scanners, Batch Analysis tab for browsing and analyzing batches of images, Morphological background subtraction, support for opening and analyzing third-party images. Ny plats-hitta algoritmer, full platsen hitta automatisering, automatiska balansering av PMT vinst för alla GenePix skannrar, Batch Analys fliken för surfning och analysera serier av bilder, morfologiska bakgrund subtraktion, stöd för att öppna och analysera tredje part bilder. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Läs mer]

GeneTraffic Version 3.2. GeneTraffic Version 3,2. Centralized data management for all microarray platforms, Powerful, easy-to-use microarray data analysis tools, Seamless Affymetrix™ integration and analysis (PLIER, GC-RMA, RMA), Rich MIAME-compliant experiment annotation. Centraliserad datahantering för alla microarray plattformar, kraftfull, lättanvänd microarray data analysis tools, Seamless Affymetrix ™ integration och analys (PLIER, GC-RMA, RMA), Rich MIAME-kompatibel experiment notering. - [ Read more ] -- [Läs mer]

GEPAS - Gene Expression Pattern Analysis Suite - [ Read more ] GEPAS - genuttryck Pattern Analysis Suite - [Läs mer]

The Microarray Data Manager, implemented in Java, facilitates the entry of data into a relational database. Den Microarray Data Manager, genomförs i Java, underlättar inresa för data i en relationsdatabas. MADAM guides users through the microarray process from RNA procurement to data analysis, offering intelligent forms to simplify the tracking of exp - [ Read more ] MADAM guidar användarna genom microarray processen från RNA upphandling för dataanalys, erbjuder intelligenta former för att förenkla spårning av exp - [Läs mer]

MAGE Software Toolkit: MAGE-stk. Mage Software Toolkit: Mage-stk. MAGE Object Model. Mage Object Model. Sourceforge. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Micovito - Microarray Comparison Visualization Tool. Micovito - Microarray Jämförelse Visualization Tool. A tool enabling intuitive understanding of data as a first step into comparison of microarray experiments. Ett verktyg som möjliggör intuitiv förståelse av data som ett första steg i jämförelse av microarray experiment. Visualization of groups of genes whose expression profiles are similar in both microarray experiments, but also genes whose expression profiles are similar in one microarray experiment but not in the other. Visualisering av grupper av gener vars uttryck profiler är likartade i båda microarray experiment, men även gener vars uttryck profiler är liknande i en microarray experiment men inte i andra. Micovito - [ Read more ] Micovito - [Läs mer]

Microarray Explorer (MAExplorer) is a Java-based data-mining facility for cDNA or oligonucleiotide microarray databases. Microarray Explorer (MAExplorer) är en Java-baserade data-mining anläggning för cDNA eller oligonucleiotide microarray databaser. MAExplorer - [ Read more ] MAExplorer - [Läs mer]

TIGR?s Microarray Data Analysis System, a Java application, provides users an intuitive interface to design analysis protocols combining one or more normalization and filtering steps. TIGR? Ar Microarray Data Analysis System, ett Java-program, ger användare ett intuitivt gränssnitt till konstruktionsanalys protokoll kombinera en eller flera normalisering och filtrering steg. In this way, data from many individual hybridizations can be treated - [ Read more ] På detta sätt kan data från många enskilda hybridizations kan behandlas - [Läs mer]

PARTISAN arrayLIMS. Partisan arrayLIMS. Clondiag chip technologies. Clondiag chip teknik. arrayLIMS is designed to manage all pertinent issues in the microarray life cycle, including array design, microarray production, biochemical reactions (hybridization), chip detection (image scanning/acquisition), data analysis and data mining. arrayLIMS är utformat för att hantera alla relevanta frågor i microarray livscykel, bland annat array design, microarray produktion, biokemiska reaktioner (hybridisering), chip detection (bilden skanning / förvärv), data analys och data mining. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Rosetta Resolver System. Rosetta Resolver System. Includes the Rosetta Syllego system for the management of genetic data and analysis. Omfattar Rosetta Syllego system för hantering av genetisk information och analys. For drug discovery - Determine and validate targets, Prioritize compounds, Pinpoint on- and off- target treatment effects, Determine underlying treatment mechanisms of action. För läkemedelsutveckling - Fastställa och utvärdera mål, Prioritera föreningar, Precisera on-och off-target behandling effekter, Bestäm underliggande behandling verkningsmekanismer. Rosetta Inpharmatics - [ Read more ] Rosetta Inpharmatics - [Läs mer]

Signet Agilent. Signet Agilent. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Software Utilites for DNA Microarray. Software Utilites för DNA Microarray. ExpressConverter and SlideMap. ExpressConverter och SlideMap. - [ Read more ] -- [Läs mer]

Normalized and filtered expression files can be analyzed using TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). Normalized och filtreras uttryck filer kan analyseras med hjälp TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). MeV is a versatile microarray data analysis tool, incorporating sophisticated algorithms for clustering, visualization, classification, statistical analysis - [ Read more ] MeV är en mångsidig microarray data analysverktyg, som innehåller sofistikerade algoritmer för klustring, visualisering, klassificering, statistisk analys - [Läs mer]

VARAN - a tool for analyzing variability amongst DNA microarrays experiments. Varan - ett verktyg för att analysera variationen bland DNA microarrays experiment. Published in Bioinformatics : http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [ Read more ] Publicerad i bioinformatik: http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [Läs mer]

yMGV - Yeast Microarray Global Viewer - an on-line database, provides a synthetic view of the transcriptional expression profiles of yeast genes among most of the published expression datasets. yMGV - Jäst Microarray Global Viewer - en on-line databas som ger en syntetisk bild av den transcriptional expression profiler av jäst gener i de flesta av de publicerade uttryck datamängder. yMGV - [ Read more ] yMGV - [Läs mer]

yTAFNET is designed to help the characterization of connections between the different yeast regulatory networks. yTAFNET är utformad för att hjälpa en karakterisering av förbindelser mellan de olika jäst reglerande nätverk. - [ Read more ] -- [Läs mer]