Microarrays ткани
Microarrays ткани введение:
Microarrays ткани (TMAs) использованы для того чтобы проанализировать выражение генов одновременно в множественных индивидуальных образцах ткани на одном скольжении. TMAs составлено малых сердечников 0.6 до 3.0 mm ткани от donor блоков парафина ткани которые одеты на высокой плотности на скольжении.

Проницательность технологии: идентификация biomarkers с технологией Йен m Giltnane и Дэвид l онкологией microarray ткани практики природы Rimm клинической (2004) 1, 104-111
Microarrays ткани позволяли ткани традиционному анализу обычных histologic блоков парафина стать miniturized и высок-объём.
Гистохимические и молекулярные методы обнаружения можно использовать на скольжениях TMA, и таким образом позволяют TMAs быть мощными инструментами для того чтобы рассмотреть выражение гена профилируя в положениях заболеванием через разнообразие пациентов и условия заболеванием.
Содержание Microarray ткани
Характеристики Microarrays ткани:
- 50 до 500 тканей или больше можно проанализировать в блок скольжения
- высокое объём
- относительно низкая стоимость
- смогите быть запятнано с разнообразие пятнами как запятнанные h & e
- скольжения можно проанализировать с широк-разнообразием методов
- автоматизированный анализ и сбор данных с много методов
Синтез Microarray ткани:
Microarrays ткани произведены используя микротом который распределяет ткань в разделы 4 до 5 микрометров (см. диаграмму 1 вышеуказанную). Эти вырезают сердцевина из разделов биопсии ткани приняты от специфических сфер интересов от парафин-врезанных блоков ткани. Эти cynlindrical сердечники ткани re-врезаны в одетые пустые реципиентные блоки. Используя этот метод, больше чем 500 сердечников ткани можно одеть на одиночном скольжении! Мастерский блок был начат Konenen et al.
Применения Microarrays ткани:
- Immunohistochemistry
- Пятнать: H & E, HC, ISH,
- В гибридизации situ
- Дневно в гибридизации situ (РЫБЕ)
- В PCR situ
- Анализ выражения RNA или дна
- Assay TUNEL для apoptosis
- Морфологическая и клиническая характеризация много терпеливейших тканей

Преимущества блоков ткани или обломоков ткани:
- Экспириментально единообразие
- Позволяет амплификации (и консервации) вряд образцов ткани
- Сохранять том assay
- Уменьшает число расмотренных скольжений (обычный парафин ткани скольжений)
- Высок-объём
- Анализ можно автоматизировать и данные можно компьютеризировать
Типы Microarrays ткани:
Cryo - Microarrays ткани: Cryo-TMAs использует замороженные ткани которые врезаны в оптимальной смеси температуры вырезывания. Эти cryo-TMAs должные к их замерзать главны к тканям исправленным формалином для анализа RNA и протеина. Также, антитела работают много betterl с замороженными тканями.
Microarrays ткани Multi-туморов: multi-тумор TMAs имеет много разных видов тканей выровнянных на скольжении. Метод сперва был использован Kononen et al., 1998. Kononen использовало этот тип TMA для того чтобы обнаружить 6 амплификаций гена. выражение p53 также было расмотрено в ткани рака молочной железы.
Microarrays ткани прогрессирования: Этот тип microarray ткани рассматривает различные этапы прогрессирования тумора (или заболевания) внутри, котор дали орган. Например, рассмотрение туморов в груди. Эти скольжения можно после этого assayed для отметок интереса, или биохимический анализ образцов можно сделать.
Microarrays ткани прогноза: Образцы заболеванием как биопсии тумора можно принять от пациентов и рассмотреть. Эти образцы можно использовать для клинических прослеживаний для того чтобы контролировать прогрессирование пациента. Данные после этого проанализированы и сравнены с другими клиническими данными.
ПО и Bioinformatics Microarray ткани:
Содержит следующее ПО:
TMA-Deconvoluter и Stainfinder. Deconvoluter преобразовывает сырцовые ведя счет рабочие листы от 3-D плана Microarray ткани в 2-D приведенную форму таблицы соответствующую для более дальнеишего анализа данных.
Анализ данных блока ткани: ПО к создавать взаимодействующую базу данных для просмотра и ввода данных изображения TMA.
TAD: ПО базы данных блока ткани для загрузки.
TMAJ: комплект вспомогательных программ используемых для того чтобы управлять данными по и данными по MicroArray ткани (TMA).
Первоначально бумаги справки Microarray ткани:
Battifora h: Блок ткани multitumor (сосиски): романный метод для immunohistochemical испытания антитела. Лаборатория инвестирует 1986, 55:244 - 248.
Kononen j, Bubendorf l, Kallioniemi a, Barlund m, Schraml p, Leighton s, Torhorst j, Mihatsch MJ, Sauter g, Kallioniemi OP: Microarrays ткани для профилировать высок-объём молекулярный образцов тумора. Nat Med 1998, 4:844 - 847.