Warning: fopen(/home/microarr/cache/224d8d1d00e26ed2522f8826adcd86b8.cache) [function.fopen]: failed to open stream: Permission denied in /home/microarr/public_html/translate/cache-script.php on line 74

Warning: fwrite(): supplied argument is not a valid stream resource in /home/microarr/public_html/translate/cache-script.php on line 75

Warning: fclose(): supplied argument is not a valid stream resource in /home/microarr/public_html/translate/cache-script.php on line 75
Microarrays ткани
меню

Microarrays ткани

Microarrays ткани введение:

Microarrays ткани (TMAs) использованы для того чтобы проанализировать выражение генов одновременно в множественных индивидуальных образцах ткани на одном скольжении. TMAs составлено малых сердечников 0.6 до 3.0 mm ткани от donor блоков парафина ткани которые одеты на высокой плотности на скольжении.

microarray ткани

Проницательность технологии: идентификация biomarkers с технологией Йен m Giltnane и Дэвид l онкологией microarray ткани практики природы Rimm клинической (2004) 1, 104-111

Microarrays ткани позволяли ткани традиционному анализу обычных histologic блоков парафина стать miniturized и высок-объём.

Гистохимические и молекулярные методы обнаружения можно использовать на скольжениях TMA, и таким образом позволяют TMAs быть мощными инструментами для того чтобы рассмотреть выражение гена профилируя в положениях заболеванием через разнообразие пациентов и условия заболеванием.

Содержание Microarray ткани

Введение TMA

Характеристики блоков ткани

Синтез Microarray ткани

Применения

Преимущества TMAs

Типы блоков ткани

ПО анализа

Справки обломока ткани

Характеристики Microarrays ткани:

  • 50 до 500 тканей или больше можно проанализировать в блок скольжения
  • высокое объём
  • относительно низкая стоимость
  • смогите быть запятнано с разнообразие пятнами как запятнанные h & e
  • скольжения можно проанализировать с широк-разнообразием методов
  • автоматизированный анализ и сбор данных с много методов

 

Синтез Microarray ткани:

Microarrays ткани произведены используя микротом который распределяет ткань в разделы 4 до 5 микрометров (см. диаграмму 1 вышеуказанную). Эти вырезают сердцевина из разделов биопсии ткани приняты от специфических сфер интересов от парафин-врезанных блоков ткани.  Эти cynlindrical сердечники ткани re-врезаны в одетые пустые реципиентные блоки. Используя этот метод, больше чем 500 сердечников ткани можно одеть на одиночном скольжении! Мастерский блок был начат Konenen et al.

 

Применения Microarrays ткани:

  • Immunohistochemistry
  • Пятнать: H & E, HC, ISH,
  • В гибридизации situ
  • Дневно в гибридизации situ (РЫБЕ)
  • В PCR situ
  • Анализ выражения RNA или дна
  • Assay TUNEL для apoptosis
  • Морфологическая и клиническая характеризация много терпеливейших тканей

tma

Преимущества блоков ткани или обломоков ткани:

  • Экспириментально единообразие
  • Позволяет амплификации (и консервации) вряд образцов ткани
  • Сохранять том assay
  • Уменьшает число расмотренных скольжений (обычный парафин ткани скольжений)
  • Высок-объём
  • Анализ можно автоматизировать и данные можно компьютеризировать

 

Типы Microarrays ткани:

Cryo - Microarrays ткани: Cryo-TMAs использует замороженные ткани которые врезаны в оптимальной смеси температуры вырезывания. Эти cryo-TMAs должные к их замерзать главны к тканям исправленным формалином для анализа RNA и протеина. Также, антитела работают много betterl с замороженными тканями.

Microarrays ткани Multi-туморов: multi-тумор TMAs имеет много разных видов тканей выровнянных на скольжении. Метод сперва был использован Kononen et al., 1998. Kononen использовало этот тип TMA для того чтобы обнаружить 6 амплификаций гена. выражение p53 также было расмотрено в ткани рака молочной железы.

Microarrays ткани прогрессирования: Этот тип microarray ткани рассматривает различные этапы прогрессирования тумора (или заболевания) внутри, котор дали орган. Например, рассмотрение туморов в груди. Эти скольжения можно после этого assayed для отметок интереса, или биохимический анализ образцов можно сделать.

Microarrays ткани прогноза: Образцы заболеванием как биопсии тумора можно принять от пациентов и рассмотреть. Эти образцы можно использовать для клинических прослеживаний для того чтобы контролировать прогрессирование пациента. Данные после этого проанализированы и сравнены с другими клиническими данными.

 

ПО и Bioinformatics Microarray ткани:

Вспомогательные программы для анализа Высок-Объём Microarrays ткани: Помещать в архив и анализ данных изображения

Содержит следующее ПО:

TMA-Deconvoluter и Stainfinder. Deconvoluter преобразовывает сырцовые ведя счет рабочие листы от 3-D плана Microarray ткани в 2-D приведенную форму таблицы соответствующую для более дальнеишего анализа данных.

Анализ данных блока ткани: ПО к создавать взаимодействующую базу данных для просмотра и ввода данных изображения TMA.

TAD: ПО базы данных блока ткани для загрузки.

TMAJ: комплект вспомогательных программ используемых для того чтобы управлять данными по и данными по MicroArray ткани (TMA).

Первоначально бумаги справки Microarray ткани:

Battifora h: Блок ткани multitumor (сосиски): романный метод для immunohistochemical испытания антитела. Лаборатория инвестирует 1986, 55:244 - 248.

Kononen j, Bubendorf l, Kallioniemi a, Barlund m, Schraml p, Leighton s, Torhorst j, Mihatsch MJ, Sauter g, Kallioniemi OP: Microarrays ткани для профилировать высок-объём молекулярный образцов тумора. Nat Med 1998, 4:844 - 847.