Инструменты и базы данных Microarray Bioinformatic online
Microarray Bioinformatic Оборудует Online. Анализ информации online. Ген Ontology. ПОЙДИТЕ. Связывать. Средство программирования статистик online. Блок и db баз данных обломока.
Категории
Ткань Microarray Bioinformatics (3) |
Соединения сортируют мимо: Удары & Алфавитно
|
Гловальная оценка microarray преданного pdf
баз данных -
http://www.transcriptome.ens.fr/sgdb/tools/download/data_management_en.pdf Гловальная оценка microarray преданных баз данных. Pdf. Sophie Lemoine. - [прочитано больше] |
|
КИСЛОТА -
http://bioinfo.thep.lu.se/acid.html Базой данных данным по клона блока (КИСЛОТОЙ) будет searchable ресурс для информации о человеке, мыши, и крысе, котор ДНАО клонирует. Каждый клон содержит информацию о заданном cluster(s) UniGene, положение в полнометражном транскрипте, заданном ген ont - [прочитано больше] |
|
Центр анализа Affymetrix NetAffx - http://www.affymetrix.com/analysis/index.affx Позволяет корреляцию результатов блока GeneChip с конструкцией блока и данными по приписки; обеспечивает доступ к данным по содержания блока, включая последовательности зонда и приписки гена; свободно зарегистрирование необходимо. - [прочитано больше] |
|
ArrayExpress -
http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ Общественный архив для microarray основанных данных по выражения гена; содержит несколько curated datasets выражения гена. - [прочитано больше] |
|
ArrayPipe -
http://koch.pathogenomics.ca/cgi-bin/pub/arraypipe.pl ArrayPipe позволяет потребителям customize обрабатывая трубопровод для анализа microarray данных. Вклюает методы для оценки качества скольжений, визуализирования данных, нормированности, и обнаружения дифференциально выраженных генов. Выход состоит repor - [прочитано больше] |
|
ArrayProspector -
http://string.embl-heidelberg.de:8080/prophecies_html/prophecies.html ArrayProspector будет комплектом предсказанных функциональных ассоциаций между генами были inferred от microarray данных по выражения от базы данных Standford Microarray. Потребители могут искать для генов соединенных для того чтобы запросить или для соединений между 2 генами. - [прочитано больше] |
|
ArrayXPath -
http://www.snubi.org/software/ArrayXPath/ ArrayXPath будет стержн-osnovannym обслуживанием для сопрягать microarray профили ген-vyrajeni4 с знанными биологическими pathways. Входным сигналом будет связанный профиль ген-vyrajeni4 в плат-razmejevanny1 формата текста. Выход вклюает диаграммы pathway. - [прочитано больше] |
|
ОСНОВАНИЕ - среда программирования BioArray - http://base.thep.lu.se/ ОСНОВАНИЕ - Среда программирования BioArray. ОСНУЙТЕ свободно стержн-osnovannoe разрешение базы данных для массивнейших данных произведенных microarray анализом. Выпущено под лицензией широкаяа публика GNU. - [прочитано больше] |
|
BEARR -
http://giscompute.gis.a-star.edu.sg/~vega/BEARR1.0/ Извлечение серии и анализ чис-Reglamentaqionnyx зон (BEARR) принимают перечень обозначения гена (such as удостоверения личности RefSeq и Unigene), картины консенсуса, и (опционно) матрица веса положения как входной сигнал и возвращения перечень спички для картин в bot - [прочитано больше] |
|
BiNGO -
http://www.psb.ugent.be/cbd/papers/BiNGO/ BiNGO будет Жава-osnovannym инструментом для того чтобы обусловить которые категории Ontology гена (ПОЙДИТЕ) статистически overrepresented в комплекте генов или подграфе биологической сети. - [прочитано больше] |
|
Bioconductor -
http://www.bioconductor.org/ Bioconductor будет открытым источником и открытым проектом развития средств программирования направляет обеспечить доступ к широкийа ассортимент мощных статистически и графических методов для анализа genomic данных. - [прочитано больше] |
|
BioProspector -
http://robotics.stanford.edu/~xsliu/BioProspector/ Сервер просматривает upstream of гены в такой же группе выражения гена для регламентационных motifs последовательности использующ стратегию забора Gibbs. Модель предпосылки Markov использована для оснований нон-non-motif, улучшающ характерность предсказанных положений motif. - [прочитано больше] |
|
Построьте ваше собственное arrayer - http://cmgm.stanford.edu/pbrown/mguide/index.html MGuide (вариант 2.0). Коричневые лаборатории завершают направляющий выступ к microarraying для молекулярного biologist. - [прочитано больше] |
|
Канадские ресурсы Microarray - http://kinase.uhnres.utoronto.ca/CanArrays.html Контактируйте информацию, наличия и экспертизу канадских microarray центров; вклюает лаборатории поставляют ДНАО или запятнанные олигонуклеотидом блоки и другие обслуживания, и лаборатории которые могут проанализировать RNA с Affymetrix откалывают. - [прочитано больше] |
|
CARRIE -
http://zlab.bu.edu/CARRIE-web Сервер анализирует microarray и данные по последовательности promoter связали с реакцией к специфически стимулу. После анализа сеть потенциального transcriptional регламентационная создана. CARRIE также обусловливает которыми факторами транскрипции было правоподобное invol - [прочитано больше] |
|
CIBEX -
http://cibex.nig.ac.jp/ Центром для базы данных выражения гена биологии информации (CIBEX) будет общественный архив для данных по выражения гена экспириментально. Система базы данных уступчива с стандартом MIAME. - [прочитано больше] |
|
ОБХВАТИТЕ -
http://www.personal.psu.edu/faculty/n/h/nhs109/Clench/ Программа для высчитывать анализ обогащения группы и интегрированное визуализирование данных по связующего сайта фактора выражения, приписки и транскрипции использующ ген Ontology. - [прочитано больше] |
|
CompareProspector -
http://compareprospector.stanford.edu/ Сервер пытает определить любые motifs отнес к генам предсказанным к элементам доли регламентационным. Он изменяет забор Gibbs через склоняя поиски к сохраненным последовательностям через множественные виды. - [прочитано больше] |
|
CONFAC -
http://morenolab.whitehead.emory.edu/cgi-bin/confac/login.pl Сохраненный искатель связующего сайта фактора транскрипции (CONFAC) принимает перечень людские имена и обозначения гена как входной сигнал, и сравнивает их с их orthologues мыши для того чтобы определить сохраненные связующие сайты фактора транскрипции. Болееа подробная информация от т - [прочитано больше] |
|
ДАВИД -
http://david.niaid.nih.gov/ Базой данных для приписки, визуализирования и интегрированного открытия (ДАВИДА) будет стержн-osnovanny1 инструмент который обеспечивает комплексн решение проблемы для приписки и анализа геном-vycisl4et по маштабу datasets выведенные от технологий высок-high-throughput such as microarray и proteo - [прочитано больше] |
|
Определяющ программы Transcriptional в васкулярном
эндотелии -
http://www.vessels.bwh.harvard.edu/ Это website содержит microarray средство программирования анализа (argus и З-bassein), эндотелиальную базу данных выражения клетки, и другие ресурсы отнесенные к васкулярному исследованию эндотелия. См. конспекты PubMed для больше информации. - [прочитано больше] |
|
Doelan -
http://www.transcriptome.ens.fr/doelan/ Doelan будет инструментом конструированным для того чтобы контролировать качество продукции ДНАА microarray. - [прочитано больше] |
|
ЛЕГКОСТЬ -
http://david.niaid.nih.gov/david/ease.htm Полезно для суммировать большей частью биологическую "тему", котор дали списка гена. От перечня гены от microarray или другого геном-vycislite по маштабу эксперименты, ЛЕГКОСТЬ смогите быстро высчитать статистик над-predstavleni4 для каждого по возможности термина Ontology гена с re - [прочитано больше] |
|
ermineJ -
http://microarray.genomecenter.columbia.edu/ermineJ/ ermineJ будет инструмент для анализа комплектов гена (определенный потребитель или те определенные мимо ИДЕТ термины) в данных по выражения. Средство программирования конструировано быть использованным biologists с little or no предпосылкой informatics. Поверхность стыка команд-linii имеющяяся для потребителей - [прочитано больше] |
|
ExpressDB -
http://arep.med.harvard.edu/ExpressDB/ ExpressDB - реляционная база данных содержа данные по выражения дрождей и RNA E coli. - [прочитано больше] |
|
Profiler выражения -
http://www.ebi.ac.uk/expressionprofiler/ Profiler выражения будет платформой основанной стержнем для microarray анализ информации начатый на EBI. Этот ресурс интегрирован с базой данных ArrayExpress, общественным архивом для microarray данных. - [прочитано больше] |
|
Анализатор Данным по Выражения Гена - http://bioinformatics.upmc.edu/GE2/GEDA.html Анализатор данным по выражения гена (GEDA) будет инструментом для открывать дифференциальное выражение гена в подсовокупности пациентов. Он портняжничан к рак-rodstvennym microarray изучениям и предлагает обширные варианты для визуализирования, классифицирования и нормированности. - [прочитано больше] |
|
Выражение Lite гена GeneX-Lite :: - http://www.ncgr.org/research/genex/ GeneX-Lite - применение средства программирования клиента поверхность стыка системы managment реляционной базы данных (RDBMS). Поверхность стыка применения позволяет потребителю нагрузить, управить, проанализировать, визуализировать и запросить данные по выражения гена. RDBMS обеспечивает хранение данных и результатов analysis/visualization. Освободите download. NCGR.org - [прочитано больше] |
|
GenMAPP -
http://www.genmapp.org/ GenMAPP (profiler pathway MicroArray гена) будет microarray инструментом визуализирования данным по выражения, позволяющ данные быть осмотренным на картах представляя groupings гена и биологические pathways. - [прочитано больше] |
|
GEO - выражение гена omnibus - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/ Выражение Гена Omnibus: - GEO будет архивом обилия гена expression/molecular поддерживая представления сведений MIAME уступчивые, и а curated, online ресурс для данных по выражения гена browsing, query и возвращение. NCBI - [прочитано больше] |
|
GEO - выражение гена omnibus - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ Архив данным по блока выражения и гибридизации гена; online ресурс для возвращения данных по выражения гена от любых организма или искусственного источника. - [прочитано больше] |
|
GEPAS -
http://www.gepas.org/ Сюита анализа картины выражения гена (GEPAS) будет собранием инструментов для анализа microarray данных включая препроцессирование данных, связывая, сравнения образца, минирования данных основанного дальше ИДЕТ термины (FatiGO), и annnotation. Также включены инструменты - [прочитано больше] |
|
GFINDer -
http://www.medinfopoli.polimi.it/GFINDer/ Открыватель генома функциональный интегрированный (GFINDer) принимает перечень удостоверения личности gene/clone с данными по классифицирования как входной сигнал, и позволяет потребителю характеризовать по-разному типы гена в списке использующ приписки различных типов от несколько по-разному - [прочитано больше] |
|
ЦЕЛЬ -
http://microarrays.unife.it/ Лексиконом гена автоматизированным Ontology (ЦЕЛЬЮ) будет инструмент для функционального анализа данных от ШАЛФЕЙНЫХ и microarray экспериментов. Термины Ontology гена использованы за основа для статистическийа анализ. - [прочитано больше] |
|
GoMiner -
http://discover.nci.nih.gov/gominer/ GoMiner организует и позволяет визуализирование больших комплектов генов основанных на классифицированиях Ontology гена. - [прочитано больше] |
|
GoSurfer -
http://www.biostat.harvard.edu/complab/gosurfer/ GoSurfer будет инструментом для визуализировать и сравнивать комплекты гена путем составлять карту они на данные по Ontology гена (ПОЙДИТЕ) in the form of иерархический вал. Полезно для расследовать результаты microarray анализов или геном-wirokix вычислений. - [прочитано больше] |
|
GridGrinder -
http://gridgrinder.sourceforge.net/ Средство программирования для microarray анализа изображения. - [прочитано больше] |
|
База данных HuGEIndex -
http://www.biotechnologycenter.org/hio/databases/index.html База данных HuGEIndex. - [прочитано больше] |
|
KARMA -
http://biryani.med.yale.edu/karma/cgi-bin/mysql/karma.pl KARMA (менеджер и Annotator блока Keck) позволяет вас сравнивает и аннотирует ваши собственные microarrays против других имеющихся блоков. Сравнения блоков можно достигнуть в пределах такого же вида так же, как через вид (сравнение блока основано на UniGene Clu - [прочитано больше] |
|
M-CHiPS -
http://www.dkfz-heidelberg.de/mchips/ Мулти-Uslovno Системы обработки Интенсивности Гибридизации. Принципиальная схема данных warehousing та фокусы на обеспечивать структуру для статистическийа анализ всех компонентов microarray базы данных включая экспириментально приписки. - [прочитано больше] |
|
MatchMiner -
http://discover.nci.nih.gov/matchminer/ MatchMiner будет инструментом для того чтобы сравнить и преобразовать обозначения гена. Потребители могут перевести одиночную или перечни обозначения от одной формы к другим, или сравните 2 перечня обозначения для общих справок гена. - [прочитано больше] |
|
maxd -
http://www.bioinf.man.ac.uk/microarray/maxd/ maxd - пакгауз данных и окружающая среда визуализирования для genomic данных по maxdLoad2 выражения, maxdView. - [прочитано больше] |
|
MDscan -
http://robotics.stanford.edu/~xsliu/MDscan/ Сервер конструировал pinpoint места взаимодействия протеин-Dnaa на низкопробном уровне пары. Пользы Обломок-odevaht данные, обозначение слова и положени-speqificeski матрицу веса уточняя для того чтобы искать для motifs представляя эти места взаимодействия. - [прочитано больше] |
|
MedMiner -
http://discover.nci.nih.gov/textmining/ MedMiner можно использовать для того чтобы выбрать гены от microarray комплекта основанного на данных по GeneCards. Основано на генах выбрал одно смогите после этого искать конспекты PubMed использующ знанные синонимы гена и другие user-specified параметры поиска. Чонсервная банка поиска PubMed также - [прочитано больше] |
|
MIAMExpress -
http://www.ebi.ac.uk/microarray/MIAMExpress/miamexpress.html Инструмент представления сведений MIAME (минимальной информации о microarray эксперименте) уступчивый microarray. - [прочитано больше] |
|
База данных выражения гена Microarray - http://www.mged.org Группа облегчая развитие международного архива для данных по выражения гена и стандартов экспириментально и базы данных требуемых для такой работы. - [прочитано больше] |
|
Система проекта MicroArray (КАРТЫ) -
http://dir.niehs.nih.gov/microarray/software/maps/ Система Проекта MicroArray (КАРТЫ). КАРТЫ будут системой проекта MicroArray для управления и толкования microarray данных по эксперименту выражения гена. NIEHS - группа Microarray - [прочитано больше] |
|
Проект NHGRI Micorarray - http://www.nhgri.nih.gov/DIR/Microarray/main.html Протоколы, анализ и ресурсы; ВЗРЫВ против установленного архива ДНАА 15K клонирует (от 15.000 людских групп UniGene; клонирует будьте имеющимися). - [прочитано больше] |
|
НОМАД -
http://ucsf-nomad.sourceforge.net/ НОМАД. Открытая система источника средства программирования для хранить и запрашивать результаты microarray данных по эксперименту. Номад UCSF - [прочитано больше] |
|
Oligodb -
http://oligodb.charite.de/ Oligodb производит oligos целесообразные для экспериментов по выражения основанных на предсказанных транскриптах гена от проекта Ensembl. Одно может искать для транскриптов через keyword, или сделайте поиск серии путем обеспечивать перечень обозначения Ensembl. - [прочитано больше] |
|
На-Instrumenty -
http://vortex.cs.wayne.edu/Projects.html На-Instrumenty будут сюитой инструментов для минирования данных основанного на информации от гена Ontology (ПОЙДИТЕ). Функциональные groupings перечней дифференциально выраженные гены могут быть созданным использованием На-Vyrajaht. Содержит инструменты для определять функциональное смещение для комплектов - [прочитано больше] |
|
Данные по ген-vyrajeni4 Ontologizing
microarray: -
http://www.charite.de/ch/medgen/ontologizer/ ХМЛ-osnovannoe применение java описано предусматривает функци-orientirovanny1 обзор результатов анализа путем разбиения на группы данных по ген-vyrajeni4 microarray основанных на терминах и ассоциациях Ontology гена. Применение производит одно html page с listi - [прочитано больше] |
|
POBO -
http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi:9801/pobo Сервер для обнаружения, сравнения и проверки motifs связующего сайта фактора транскрипции в promoters. Анализ бутстрэпа POBO приложенный до один или два миллиона группа чо-otregulirovannyx генов обнаруживает motifs под весьма уровнями представления. - [прочитано больше] |
|
ProbeLynx -
http://www.pathogenomics.ca/probelynx Использующ текущие выпуски genomic данных по последовательности, ProbeLynx позволяет потребителям определить характерность последовательностей зонда используемых для microarray экспериментов. Потребитель обеспечивает последовательности зонда в FASTA или плат-razmejevanno1 форме, и ProbeLynx сообщает характерность внутри - [прочитано больше] |
|
RAB - база данных обилия RNA - http://www.cbil.upenn.edu/RAD/php/index.php RAB - база данных обилия RNA - [прочитано больше] |
|
ПРОЧИТАНО: База данных блока выражения
RIKEN - http://read.gsc.riken.go.jp/ Bono, H, Kasukawa, T, Hayashizaki, Y, и okazaki, ПРОЧИТАННОЕ Y: Исследование Нуклеиновых Кислот Базы данных Блока Выражения RIKEN, 30, 211-213 (2002). - [прочитано больше] |
|
Исследование Assistan II - http://chembank.broad.harvard.edu ChemBank будет публикой, стержн-osnovanno1 окружающей средой informatics созданной программой биологии обширного института химически. Эта окружающая среда знания вклюает свободно имеющиесяа данные выведенные от малых молекул и экранов мал-molekuly. ChemBank предназначено направить chemists синтезируя смеси или архивы романа, к biologists assist ища для малых молекул которые беспокоят специфически биологические pathways, и катализировать процесс которым охотники снадобья открывают новые и эффективные микстуры. - [прочитано больше] |
|
Resourcerer -
http://www.tigr.org/tigr-scripts/magic/r1.pl Инструмент для cross-referencing microarray данные вывел от по-разному вида и через по-разному платформы анализа выражения. Построено использующ анализ ESTs, индекса гена TIGR (TGI), и баз данных Orthologs гена Eukaryotic (ЭГА). - [прочитано больше] |
|
ScanAlyze, группа, TreeView - http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm Средство программирования лаборатории Eisen для microarry обработкаа изображений, анализа и визуализирования; имеющеся для download к платформам окон только; освободите с зарегистрированием для non-commercial пользы. - [прочитано больше] |
|
ИСТОЧНИК -
http://source.stanford.edu Ресурс stanford online всеобщий для клонирует и ESTs складывает общественно вместе имеющиесяа данные общ изыскиваемые для любых клона, воцарения GenBank, или гена от человека, мыши, крысы. - [прочитано больше] |
|
База данных Stanford Microarray (SMD) - http://genome-www5.stanford.edu/ SMD хранит сырцовые и normalized данные от microarray экспериментов, также,как их соответствуя архивы изображения. In addition, SMD обеспечивает поверхности стыка для поисков данных, анализа и визуализирования. - [прочитано больше] |
|
Инструменты средства программирования TIGR - http://www.tigr.org/software/ Перечень пакета программ раскрывать-istocnika имеющиеся для свободно от института для исследования Genomic (TIGR). - [прочитано больше] |