Типы Microarray и info

Использование Microarrays

меню

Протокол Microarray ДНАА

протоколы
microarray bioinformatics обломоков
выучьте
поставщики
обсуждение форума блока

Протоколы Microarray ДНАА

 

ДНАО Microarray Bioinformatics

Выучьте о обломоках ДНАА

Поставщики и продукты Microarray ДНАА

Форум Блока ДНАА

Весточка Microarray ДНАА

Основной Протокол Microarray ДНАА:

 

Этапы в эксперименте по Microarray:

1. Получите Обломок Microarray ДНАА  

В настоящее время, над 50.000 ДНААМИ зонды можно запятнать на скольжение 25X75mm робототехнический печатать. Таким образом по возможности одеть весь людской комплимент генома использующ этот high-density подход к блока (например блоки Affymetrix).

Тысячи определенных пятен знанных oligos или DNAS напечатаны на платформах матрицы расположенных на или кремнии, nylon листах, или стеклянных скольжениях.

2. Обозначать Cy3 и Cy5 образцов RNA использующ синтез ДНАА (RT-PCR)

RNA от 2 или больше образцов сравнен.  Транскрибированный RNA от каждого образца обратными использующ RT-PCR к ДНАУ (комплементарному ДНАУ). ДНАО обозначено с 2 по-разному дневными красками покрашены по-разному (красно и зелено), с Cy3 и Cy5.

3. Гибридизация зондов ДНАА к блоку ДНАА

Зонды ДНАА гибридизированы к ДНАУ microarray. Блок ДНАА после этого помыт.

4. Обнаружение сигнала гибридизации

Просмотрены и обнаружены дневные сигналы гибридизации использующ приспособления лазера confocal. Данные фильтрованы и после того как я обработаны.

5. Анализ информации Microarray ДНАА

Дирижирован анализ информации использующ инструменты Microarray ДНАА bioinformatic and/or средство программирования обработкаа изображений.

Intesities сигнала пятен сопоставлены с концентрацией образцов mRNA цели. Минирование данных также дирижировано использующ статистически программы и алгоритмы для того чтобы обусловить если вверх-otregulirovan ген интереса, после того как онotregulirovan, или неизменно.

Данные после этого организованы использующ базу данных. Приписку гена можно после этого выполнить на данных, с ИДЕТ (анализ ontology гена), анализа путем разбиения на группы (котором гены и pathways групп подобные совместно), и анализе pathways и сетях генов.