Protein Microarrays Protein Microarrays
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Vizitați Molecular Station pentru un mare articol cu Antibody și proteice Microarrays
Protein Chips: Protein Chips:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Protein Microarrays se poate baza pe orice ligand-test cu caracter obligatoriu care se bazează pe formarea de produs cu o captură de imobilizare și a unei molecule țintă molecule prezente în soluție. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Aceste expertize pot fi miniturized și plasate pe o proteină microarray chip.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Protein microarrays sunt acum devenind foarte popular din cauza lor posibile viitoare aplicații în studiul de acid nucleic de proteine, proteină-proteină, ligand-receptor, de droguri de proteine-țintă, precum și interacțiunile enzimă-substrat.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Tipuri de Captura molecule de proteine pentru Microarray chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. Pentru a analiza interacțiunile cu alte proteine moleculelor, proteine microarrays pot avea diferite tipuri de molecule imobilizate pe slide Suprafață să acționeze în calitate de captură de molecule de proteine în microarray test.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Figura 1 ilustrează cele mai comune matrice de proteine, anticorpi microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Anticorpi sunt identificat pe un diapozitiv de sticlă. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. Două celule lysates cu proteine etichetate cu Cy3 și Cy5 (de exemplu, cancer, față de normală) se adaugă ca o soluție pe matrice de proteine. Signals are detected from the two different signals. Semnale, sunt detectate de la cele două semnale diferite. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Data este calculat să permită o analiză a modului de mult vopsitorie proteină numită de anticorpi, pe fiecare loc sunt obligatorii. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Această informație permite de a determina dacă o proteină de exprimare este reglementată în sus-cancer, down-reglementate sau nemodificate.
Figure 2. Figura 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) demonstrează arrays de proteine care sunt bazate pe analiza microarray de antigen-anticorp interacțiuni. Antigens are spotted onto glass slides. Antigeni sunt identificat pe sticlă de diapozitive. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Anticorpi care se leagă de antigeni de etichetat si fluorescente emit semnal (indicate ca stele galbene), care pot fi apoi detectate de la fața locului cu privire la matrice.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) arată o proteină microarray compuse din pete care acționează ca immunoassays sandwich. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Anticorpi sunt identificat pe chips-uri și de celule lysate sau o soluție care este aplicată pe diapozitiv. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Anticorpi sunt incubate cu soluție, cu, mai târziu de spalat pentru a elimina non-specifice obligatorii. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. Complexele de sandwich format emit un semnal detectabil de la fața locului.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) o proteină-proteină proteină de interacțiune microarray unde proteinele sunt identificat pe un chip de proteine, proteine și etichetate se adaugă în chip și incubate pentru a determina în cazul în care acestea pot interacționa și de a uni. A detectable signal is emitted from binding spots. Un semnal detectabil este emis de la spoturi cu caracter obligatoriu.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) acid nucleic-proteină de interacțiune matrice, (aici o ADN-proteină de interacțiune chip). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Nucleic acizi, cum ar fi ADN-ului sunt identificat pe un diapozitiv de sticlă. This could be transcriptional binding sites for example. Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. Acest lucru ar putea fi transcriptional cu caracter obligatoriu pentru site-urile de exemplu. Proteins, cum ar fi etichetate fluorescently ADN-obligatorii, factori de transcriptie, în soluție se adaugă în chip și incubate pe matrice. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. Un semnal detectabil este emis de la spoturi de ADN în cazul în care se leagă de proteinele.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed. Receptor proteins are spotted on glass slides. e) dacă aveți un set de ligands și doriți să găsiți care se leagă de receptorii, puteți utiliza un receptor-ligand proteine chip ca afișate. Receptor proteine sunt identificat pe sticla diapozitive. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescently etichetate ligands sunt adăugate pe chip. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Obligatorii de ligand a cauzelor de receptorii de emisie a unui semnal detectabil pinpoints care interacționează cu pete (de exemplu proteine care nu a ligand obligati sa).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) Pentru a testa pentru enzima-subrates specificitatea o poate angaja o enzimă-substrat proteic microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Acest chip este compusă din nano-descrete fântâni în care enzimele sunt obligate. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Substrat se adaugă în puțuri și nano-emisie de semnal este detectat de la nano-puturi pentru a test pentru funcția de enzime.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
