Among 23 databases, 4 were evaluated precisely (BASE, GeneTraffic, MaxD, RAD ). Printre 23 de baze de date, 4 au fost evaluate cu precizie (Base, GeneTraffic, MaxD, RAD). Analysed according ot MGED standards. Ot MGED analizate conform standardelor. Review. Revizui. Transcriptome.ens.fr. Sophie Lemoine - [ Read more ] Sophie Lemoine - [Read more]

Acuity 4.0 - Enterprise Microarray Informatics. Acuitatea 4,0 - Enterprise Microarray informaticii. cross-platform support, data warehousing, and new enabling analysis and visualization tools. cross-platform de sprijin, date de depozitare, și să permită noilor instrumente de analiză și de vizualizare. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Read more]

Agilent Data Analysis. Agilent a analizelor de date. Software. ChIP Analytics Software • CGH Analytics Software • Feature Extraction Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring Workgroup • Rosetta Resolver® System - [ Read more ] Chip Analytics Produse de plastic • CGH Analytics Produse de plastic • Facilitate Extractia Produse de plastic • GeneSpring GT GeneSpring GX • • • GeneSpring Workgroup Rosetta resolver ® System - [Read more]

The Automated Microarray Pipeline is a series of programs that allow the automated normalization and web publication of microarray data. Automate Microarray Pipeline este o serie de programe care permit automat de normalizare și publicarea de web microarray de date. Data stored in a MADAM-compliant database, like that provided with MADAM, can be automatically downloaded, normalized - [ Read more ] Datele stocate într-o bază de date MADAM compatibil, cu condiția ca, atunci MADAM, poate fi descărcat în mod automat, normalizat - [Read more]

Argus - a microarray database software system which functions to process, analyze, manage, and publish microarray data. Argus - o microarray software de baze de date de sistem care functioneaza la proces, analiza, gestionarea și publică microarray de date. Comander et al. Comandor et al. A new database system for web-based analysis of multiple microarray datasets. Un nou sistem de baze de date bazate pe web pentru analiza microarray mai multe seturi de date. Genome Research 2001 11(9):1603-1610. Genome Research 2001 11 (9) :1603-1610. - [ Read more ] -- [Read more]

Arrayplot allows for rapid graphical visalisuation and normalisation of microarray data. Arrayplot permite rapidă visalisuation grafice și de normalizare microarray de date. Also provides a user-friendly interface to visualise data distribution and to view most variant genes. De asemenea oferă o interfață prietenoasă cu utilizatorul pentru a visualise de date și de distribuție pentru a vizualiza cele mai multe variante gene. Permits to calculate normalisation factor based on overall median intensity. Permise de a calcula factorul de normalizare bazat pe ansamblu de intensitate medie. Arrayplot. Free software! Free software-ului! - [ Read more ] -- [Read more]

Microarray Image Analysis Software. Microarray Image Analiza Software. A software package developed for the quantification of gene expression arrays. Un pachet software dezvoltat pentru cuantificarea expresie a genei Array. AlphaInnotech - [ Read more ] AlphaInnotech - [Read more]

Michael Eisen's software at Stanford - includes ScanAlyze, Cluster and TreeView. Michael Eisen a software-ului de la Stanford - ScanAlyze include, de cluster și TreeView. - [ Read more ] -- [Read more]

Doelan is an automated tool which checks the quality of produced DNA microarrays. Doelan este un instrument care verifică automat calitatea de producere a ADN-ului microarrays. Software is based on the execution of TestSuites on quality control data to validate batches of chips. Produse de plastic se bazează pe executarea TestSuites privind controlul calității datelor pentru a valida loturi de chips-uri. - [ Read more ] -- [Read more]

Enterprise wide solution for automating and repeating tasks in data processing, analysis and interpretation from diverse data formats (all microarray formats, Mass Spectrometry, 2D Gel). Enterprise largă soluție pentru automatizarea și se repetă în sarcinile de prelucrare a datelor, analiza si interpretarea datelor din diverse formate (toate microarray formate, spectrometria de masă, 2D Gel). - [ Read more ] -- [Read more]

GenePix Pro 6.0 for Microarray Image Analysis for microarrays, tissue arrays and cell arrays. GenePix Pro 6,0 pentru Microarray Image analiză pentru microarrays, țesut și celule arrays Array. New spot-finding algorithms, full spot finding automation, Automatic balancing of PMT gain for all GenePix scanners, Batch Analysis tab for browsing and analyzing batches of images, Morphological background subtraction, support for opening and analyzing third-party images. Noi algoritmi de constatare la fața locului, la fața locului a găsi complet de automatizare, automate de echilibrare a PMT câștig pentru toate GenePix scanere, Serie Analiza fila pentru loturi de navigare si analiza de imagini, morfologice fundal Navigare, sprijin pentru deschiderea si analiza de imagini ale terților. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Read more]

GeneTraffic Version 3.2. GeneTraffic Version 3,2. Centralized data management for all microarray platforms, Powerful, easy-to-use microarray data analysis tools, Seamless Affymetrix™ integration and analysis (PLIER, GC-RMA, RMA), Rich MIAME-compliant experiment annotation. Centralizată de management de date pentru toate platformele microarray, puternică, ușor de utilizat, microarray instrumente de analiză a datelor, fara sudura Affymetrix ™ integrare și de analiză (Clește, GC-ARM, ARM), Rich MIAME compatibil experiment de adnotare. - [ Read more ] -- [Read more]

GEPAS - Gene Expression Pattern Analysis Suite - [ Read more ] GEPAS - Gene Expression Modelul de Analiză Suite - [Read more]

The Microarray Data Manager, implemented in Java, facilitates the entry of data into a relational database. Microarray Manager de date, puse în aplicare în Java, facilitează intrarea de date într-o bază de date relationale. MADAM guides users through the microarray process from RNA procurement to data analysis, offering intelligent forms to simplify the tracking of exp - [ Read more ] MADAM ghiduri de utilizatori prin intermediul microarray procesul de achiziții de la ARN la date de analiză, oferind forme inteligente pentru a simplifica modul de urmărire a exp - [Read more]

MAGE Software Toolkit: MAGE-stk. Mage noua trusa de unelte software: Mage-stk. MAGE Object Model. Mage Object Model. Sourceforge. - [ Read more ] -- [Read more]

Micovito - Microarray Comparison Visualization Tool. Micovito - Microarray Comparație Instrumentul de vizualizare. A tool enabling intuitive understanding of data as a first step into comparison of microarray experiments. Un instrument care să permită înțelegerea intuitivă de date ca un prim pas în comparație microarray de experimente. Visualization of groups of genes whose expression profiles are similar in both microarray experiments, but also genes whose expression profiles are similar in one microarray experiment but not in the other. Vizualizare de grupuri de gene ale căror profile de expresie sunt similare în ambele microarray experimente, dar de asemenea, a căror gene expression profile sunt similare într-unul microarray de experiment, dar nu și în celelalte. Micovito - [ Read more ] Micovito - [Read more]

Microarray Explorer (MAExplorer) is a Java-based data-mining facility for cDNA or oligonucleiotide microarray databases. Microarray Explorer (MAExplorer) este un Java-based de data-mining pentru Facilitatea de cDNA sau oligonucleiotide microarray baze de date. MAExplorer - [ Read more ] MAExplorer - [Read more]

TIGR?s Microarray Data Analysis System, a Java application, provides users an intuitive interface to design analysis protocols combining one or more normalization and filtering steps. TIGR? S Microarray Sistemul de analiza datelor, un Java cerere, oferă utilizatorilor o interfață intuitivă pentru a analiza protocoale de design care combină una sau mai multe etape de filtrare și de normalizare. In this way, data from many individual hybridizations can be treated - [ Read more ] În acest fel, date de la mai multe hybridizations individuale pot fi tratate - [Read more]

PARTISAN arrayLIMS. ArrayLIMS partizan. Clondiag chip technologies. Clondiag chip tehnologii. arrayLIMS is designed to manage all pertinent issues in the microarray life cycle, including array design, microarray production, biochemical reactions (hybridization), chip detection (image scanning/acquisition), data analysis and data mining. arrayLIMS este proiectat pentru a administra toate aspectele pertinente în microarray ciclu de viata, inclusiv matrice de proiectare, producție microarray, reacții biochimice (hybridization), chip de detectare (scanare imagine / achizitie), date de analiză și de exploatare a datelor. - [ Read more ] -- [Read more]

Rosetta Resolver System. Rosetta resolver System. Includes the Rosetta Syllego system for the management of genetic data and analysis. Include Rosetta Syllego sistem de gestionare a datelor și de analiză genetică. For drug discovery - Determine and validate targets, Prioritize compounds, Pinpoint on- and off- target treatment effects, Determine underlying treatment mechanisms of action. Pentru descoperirea de droguri - Determinați și validați de obiective, priorități de compuși, Pinpoint on-și off-țintă de tratament efectele, să stabilească mecanisme care stau la baza de tratament de acțiune. Rosetta Inpharmatics - [ Read more ] Rosetta Inpharmatics - [Read more]

Signet Agilent. Signet Agilent. - [ Read more ] -- [Read more]

Software Utilites for DNA Microarray. Utilites Produse de plastic pentru a ADN-ului Microarray. ExpressConverter and SlideMap. ExpressConverter și SlideMap. - [ Read more ] -- [Read more]

Normalized and filtered expression files can be analyzed using TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). Normalizat și filtrate expresie fișiere pot fi analizate folosind TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). MeV is a versatile microarray data analysis tool, incorporating sophisticated algorithms for clustering, visualization, classification, statistical analysis - [ Read more ] MeV versatil microarray este un instrument de analiză a datelor, incluzând algoritmi sofisticați pentru clustering, vizualizare, clasificarea, analiza statistică - [Read more]

VARAN - a tool for analyzing variability amongst DNA microarrays experiments. VARAN - un instrument de analiza a ADN-ului variabilitate între microarrays experimente. Published in Bioinformatics : http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [ Read more ] Publicat in Bioinformatics: http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [Read more]

yMGV - Yeast Microarray Global Viewer - an on-line database, provides a synthetic view of the transcriptional expression profiles of yeast genes among most of the published expression datasets. yMGV - Global Drojdie Microarray Viewer - o bază de date on-line, oferă o vedere sintetica a transcriptional expresie profiluri de drojdie de gene, printre cei mai de exprimare publică seturi de date. yMGV - [ Read more ] yMGV - [Read more]

yTAFNET is designed to help the characterization of connections between the different yeast regulatory networks. yTAFNET este proiectat pentru a ajuta la caracterizarea de conexiuni între diferite rețele de drojdie de reglementare. - [ Read more ] -- [Read more]