
Long Oligonucleotide Arrays Long Oligonucleotide Array
Long Oligonucleotide DNA Microarrays : Long Oligonucleotide ADN Microarrays:
Long Oligonucleotide arrays are created using either ink-jet printing or robotic printing. Long Oligonucleotide arrays sunt create utilizând fie de imprimare cu jet de cerneală-robotizate sau imprimare.
Algorithms are used in order to design long oligos of the same size of around 60 nucleotides (60-mers). Algoritmi sunt utilizate cu scopul de a desenului sau modelului lung oligos de aceeași dimensiune de aproximativ 60 nucleotides (60-mers). However, these longer oligos are more difficult to pick as they need to have little homology to each other. Cu toate acestea, aceste oligos mai sunt mai dificil de a alege în care acestea au nevoie de puțină homology reciproc.
Ink-jet pump printing produces the 60-mer arrays. Ink-jet de pompa de imprimare produce de 60 de mer Array. 100 picoliter droplets of reagents are printed onto aa hydrophobic surface containing chemically active hyrdoxyl- OH groups. 100 picoliter droplets de reactivi sunt tipărite pe aa hydrophobic Suprafață care conține chimic activ hyrdoxyl-oh grupuri. The phosphoramidite DNA monomers in the droplets react with the OH groups, resulting in covalent bonding. Phosphoramidite ADN de monomeri în droplets reacționează cu grupele OH, care rezultă în covalent de unire.
The slide can then be hybridized with labeled cDNA probes. Diapozitiv poate fi apoi hybridized etichetate cu cDNA probe. Similar to other DNA microarrays, you wash after hybridization, scan and analyze the resulting data. Similar cu alte DNA microarrays, spălați-vă după hybridization, scanare și analiza datelor rezultate.
Companies regularly produce Long oligonucleotide arrays with greater than 25,000 different probes. Companiile produc regulat Long oligonucleotide arrays cu mai mult de 25000 probe diferite.
Differences and Advantages of Long Oligonucleotide DNA Microarrays: Diferențele și avantajele pe termen lung Oligonucleotide ADN Microarrays:
- Long oligos can distinguish between alternatively spliced mRNAs (this is quite important as most genes have alternative isoforms!) -- Long oligos poate distinge între alternativ spliced mRNAs (acest lucru este destul de importante ca cele mai multe alternative de gene au isoforms!)
- Long oligos (60-mers) are single stranded which makes usual DNA microarray denaturation steps un-necessary -- Long oligos (60-mers) sunt unice, care face de obicei stranded DNA microarray denaturation etape este necesar un -
- Long oligos (60-mers) permit better specificity in DNA microarray hybridization -- Long oligos (60-mers) să permită o mai bună precizie în ADN microarray hybridization
- Easily Modified -- Ușurință Modificat
- Adaptable -- Flexibilitate