
Information on DNA Microarrays Informații despre ADN Microarrays
DNA Microarrays, an Introduction : Microarrays a ADN-ului, o introducere:
Introduction to Microarrays Introducere în Microarrays
Availability of whole genomic sequences from many organisms (such as the human genome project) have created the need for high throughput analysis of gene expression patterns. Posibilitatile de a genomic întreg de secvențe din mai multe organisme (cum ar fi proiectul genomul uman) au creat nevoia de analiză totală tranzitată de mare de gene de modele de exprimare.
DNA microarrays have revolutionized functional and genomic analysis. DNA microarrays au revolutionized genomic funcționale și de analiză.
The Evolution of the DNA Microarray: Evolutia din cadrul DNA Microarray:
In the 1980's, bacterial colonies were spotted on nylon membranes with different genomic inserts or cDNAs În anii 1980, s-au identificat colonii bacteriene pe nailon membranelor cu diferite genomic inserturi sau cDNAs
The 1990's resulted in the emergence of ink-jet spotting methods which allowed the in situ synthesis of 60-mer oligo spots on glass slides. Din 1990 a dus la apariția unor jet de cerneală-spotting metode care a permis "in situ" sinteza de 60 de oligo-Mer pete pe sticlă de diapozitive.
Affymetrix further developed DNA microarrays which were based on high-density 25-mer oligos from human cDNA sequences. Affymetrix dezvoltate DNA microarrays care s-au bazat pe mare densitate 25-mer oligos de la om cDNA secvențe.
Background on DNA Microarrays Fundal pe ADN Microarrays
The basic premise of the DNA microarray is that RNA samples or targets are hybridized to known cDNAs/oligo probes on the arrays. Premisa de bază din cadrul DNA microarray este ca ARN probe sau obiective sunt hybridized pentru a cunoscut cDNAs / oligo probe privind Array.
Microarrays were originally designed to measure gene expression levels of a few genes. Microarrays a fost conceput inițial pentru a măsura nivelul de expresie gene de câteva gene. Recently, high density microarrays have been developed which have allowed the global analysis of gene expression or the transcriptome. This global analysis allows one to determine the cellular function of genes, the nature and regulation of biochemical pathways, and the regulatory mechanisms at play during certain signalling conditions or diseases. Recent, de înaltă densitate microarrays au fost dezvoltate, care au permis de analiză globală de gene de expresie sau de transcriptome. Aceasta permite o analiză globală a determina funcția de gene celulare, natura și căile de reglementare a biochimice, precum și mecanisme de reglementare, la joaca in timpul anumitor condițiile de semnalizare sau boli.
Regulation of Transcription and DNA Microarrays Regulamentul de transcriere și ADN Microarrays
The Human Genome Project has allowed a vast wealth of information to come into our hands. Proiectul genomului uman a permis o mare bogăție de informații care vin în mâinile noastre. However, a huge problem is analyzing the new genes and putative regulatory functions of these genes. Cu toate acestea, o mare problemă este de a analiza noile gene putative și funcțiile de reglementare ale acestor gene. DNA microarray analysis has allowed these newly annotated genes and novel genes to be examined. New regulatory pathways can be examined using DNA microarrays. DNA microarray analiză a permis acestor gene nou adnotate și romanul gene pentru a fi examinate. Căi noi de reglementare pot fi examinate folosind ADN microarrays. For example, the new gene may be a transcriptional factor. Microarrays can examine the effect that gene has on thousands of genes at a time, under many conditions in a simple and fast manner. De exemplu, noua genă poate fi un factor transcriptional. Microarrays poate examina efectul de gene care are pe mii de gene la un moment dat, în conformitate cu condițiile multe într-un mod simplu și rapid.
Applications of DNA Microarrays Cererile de ADN Microarrays
DNA microarrays have been used to examine the gene expression changes under diseases such as cancer. Tumour profiling using DNA microarrays allows the analysis of the development and the progression of such complex diseases. DNA microarrays au fost utilizate pentru a examina de gene expresie de modificări în conformitate cu boli cum ar fi cancerul. Tumorali profilare, folosind ADN-ul microarrays permite analiza dezvoltarea și progresia unor astfel de boli complexe.
Using DNA microarrays, one can examine targets for drug discovery and potential diagnostic and prognostic biomarkers for many complex diseases. Utilizarea ADN microarrays, se poate examina obiective pentru descoperirea de droguri și a potențialului de diagnostic și de prognostic biomarkerilor pentru multe boli complexe.
DNA microarrays are used commonly to detect viruses and other pathogens from blood samples and thus can be used as a pathogen detection method. DNA microarrays sunt utilizate frecvent pentru a detecta viruși și alte agenții patogeni de la eșantioane de sânge și, prin urmare, poate fi folosit ca o metodă de detectare a agentului patogen.
DNA microarrays have been more recently used to identify inheritable markers, and therefore have been used as a genotyping tool. DNA microarrays, mai recent, au fost utilizate pentru a identifica inheritable markeri, și, prin urmare, au fost utilizate ca un instrument de genotyping.
SNP chips based on DNA microarray technology have allowed the high throughput profiling of single nucleotide polymorphisms using a chip or array approach. This has allowed polymorphisms to be more quickly assayed and also their relavence to disease to be easily determined. SNP chip-uri bazate pe tehnologia ADN-ului microarray au permis totală tranzitată de mare de profilare singur nucleotid polymorphisms folosind un cip sau matrice de abordare. Polymorphisms Aceasta a permis de a fi mai rapid assayed și, de asemenea, pentru a bolii relavence lor să fie ușor de determinat.
Advantages of DNA Microarrays Avantajele de a ADN-ului Microarrays
DNA microarrays are better than other profiling methods (such as SAGE, SH, PCR methods) in that they are: DNA microarrays sunt mai bune decât alte metode de profesie (cum ar fi SAGE, SH, metode de PCR) în care acestea sunt:
- easier to use -- Mai ușor de utilizat
- are high-throughput (can analyze thousands of genes or markers at a time) -- Cantitățile sunt de mare (poate mii de analiza genelor sau a markerilor la un moment dat)
- generate large amounts of data in little time -- Genera mari cantități de date în timp
- do not require large-scale sequencing -- Nu au nevoie de mari dimensiuni secvențiere
- allow the quantitation of thousands of genes from many samples -- Permite quantitation de mii de gene de la mai multe probe