Tipos de Microarray e Info

Usando Microarrays

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Tecido Microarrays

Tecido Microarrays uma introdução:

Os microarrays do tecido (TMAs) são usados analisar simultaneamente a expressão dos genes em amostras individuais múltiplas do tecido em uma corrediça. TMAs é composto de núcleos pequenos de 0.6 - 3.0 milímetro do tecido dos blocos fornecedores da parafina do tecido que são postos em uma densidade elevada em uma corrediça.

tecido microarray

Introspecção Da Tecnologia: identificação dos biomarkers com tecnologia microarray Jena M Giltnane e David L oncology clínico do tecido da prática da natureza de Rimm (2004) 1, 104-111

O tecido Microarrays permitiu que a tecido a análise tradicional de blocos histologic convencionais da parafina torne-se miniturized e elevado-high-throughput.

As técnicas histochemical e molecular da deteção podem ser usadas nas corrediças de TMA, e permitem assim que TMAs seja ferramentas poderosas para examinar a expressão do gene que perfila em estados da doença através de uma variedade dos pacientes e das condições da doença.

Índices De Microarray Do Tecido

Introdução de TMA

Características de disposições do tecido

Síntese De Microarray Do Tecido

Aplicações

Vantagens de TMAs

Tipos de disposições do tecido

Software Da Análise

Referências Da Microplaqueta Do Tecido

Características do tecido Microarrays:

 

Síntese De Microarray Do Tecido:

O tecido Microarrays é produzido usando um microtome que secione o tecido em seções de 4 - 5 micrômetros (veja figura 1 acima). Estes retiram o núcleo de seções do biopsy do tecido são feitos exame das áreas de interesse específicas dos blocos parafina-encaixados do tecido.  Estes núcleos cynlindrical do tecido re-são encaixados no blocos recipient em branco postos. Usando este método, mais de 500 núcleos do tecido podem ser postos em uma única corrediça! O bloco mestre foi desenvolvido por Konenen et por al.

 

Aplicações do tecido Microarrays:

tma

Vantagens de disposições do tecido ou de microplaquetas do tecido:

 

Tipos de tecido Microarrays:

Cryo - Tecido Microarrays: Cryo-TMAs usa os tecidos frozen que são encaixados em um composto optimal da temperatura de corte. Estes cryo-TMAs devido a seu congelar-se são superiores aos tecidos reparados formalin para a análise do RNA e da proteína. Também, os antibodies trabalham muito betterl com tecidos frozen.

Tecido Microarrays Dos Multi-Multi-tumours : o multi-multi-tumour TMAs tem muitos tipos diferentes de tecidos alinhados na corrediça. A técnica foi usada primeiramente por Kononen et por al., 1998. Kononen usou este tipo de TMA detectar 6 amplifications. do gene a expressão de p53 que foi examinada também no tecido do cancer de peito.

Tecido Microarrays Da Progressão: Este tipo de tecido microarray examina estágios diferentes da progressão do tumour (ou a doença) dentro de um órgão dado. Para o exemplo, examinação dos tumours no peito. Estas corrediças podem então assayed para marcadores do interesse, ou a análise biochemical das amostras pode ser feita.

Tecido Microarrays Do Prognosis: As amostras da doença tais como biopsies do tumour podem ser feitas exame dos pacientes e ser examinadas. Estas amostras podem ser usadas para continuações clínicas monitorar a progressão do paciente. Os dados então são analisados e comparados com outros dados clínicos.

 

Software e Bioinformatics de Microarray do tecido:

Ferramentas do software para a análise do Elevado-high-Throughput do tecido Microarrays: Archiving da imagem e análise de dados

Contem o seguinte software:

TMA-Deconvoluter e Stainfinder. O deconvoluter converte folhas marcando cruas da disposição de Microarray do tecido 3-D em um 2-D formato tabulated da tabela apropriado para uma análise de dados mais adicional.

Análise De Dados Da Disposição Do Tecido : Software a criar uma base de dados interativa para a visão da imagem de TMA e a entrada de dados.

TAD: Software da base de dados da disposição do tecido para o download.

TMAJ : o jogo de ferramentas do software usou-se controlar dados e informação de MicroArray do tecido (TMA).

Papéis Originais Da Referência De Microarray Do Tecido:

Battifora H: O bloco do tecido do multitumor (sausage): método da novela para testar immunohistochemical do antibody. O Laboratório Invest 1986, 55:244-248.

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Microarrays do tecido para perfilar molecular do elevado-high-throughput de espécimes do tumor. Med Nat 1998, 4:844-847.