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Notícia do Dna Microarray

Dna Curto Microarrays Do Oligonucleotide:

As disposições curtas do oligonucleotide são criadas usando a síntese photolithographic in-situ

os oligos 25-mer synthesized quimicamente nas corrediças de vidro usando os métodos photolithographic abertos caminho originalmente por Affymetrix.  Os micro-espelhos controlados de Digital são usados agora na técnica imprimindo photolithographic.

As corrediças de vidro são revestidas com os linkers sintéticos que contêm grupos químicos foto-photo-labile.  As máscaras são usadas dirigir a luz às posições pre-determined na corrediça e esta remove os grupos expostos. Os grupos desprotegidos podem então ser acoplados com dNTPs bi-funcionais dos triphosphates do deoxy-deoxy-nucleotide.

As máscaras novas são acoplamento direto usado em outros locais até que as seqüências e os comprimentos desejados dos oligos synthesized.

Uma microplaqueta de Affymetrix pode ter sobre 500.000 pontas de prova do oligo 25-mer postas em uma corrediça de 1.25x1.25 cm!

Em qualquer lugar 10 a 20 pontas de prova diferentes do oligo synthesized para que cada gene telhe do fim 3' do mRNA.  Há os oligos que synthesized como os fósforos perfeitos (designados PM), e combina mal os pares (milímetro).

Cada par do milímetro tem uma mau combinação do par da um-base no centro do oligo, que permite um controle para o ruído de fundo e permite o normalization do cruz-cross-hybridization.

 

Problemas de DNA curto Microarrays do oligonucleotide:

- os oligos curtos têm problemas do cruz-cross-hybridization

- deve conseqüentemente usar muitos controles do oligo para cada alvo do gene