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Ferramentas de projeto e software mais maiss bem vestido de Oligo:

Software, programas, e ferramentas bioinformatic em linha para o projeto dos primers e dos oligonucleotides.

Nós recomendamos o seguinte:

Premier Biosoft Internacional Do Desenhador Da Disposição. Software que pode projetar primers para disposições do DNA ou do oligo.

Premier Biosoft Internacional Do Desenhador Da Baliza.

OligoArray2.1 OligoArray 2.0 e a versão nova 2.1 são os pacotes de software livres que compute oligonucleotides específicos do gene para
     genome-escale a construção microarray do oligonucleotide. Reference [PubMed] Livre

Oligodb - Oligodb é um programa Web-baseado para o projeto interativo de oligos do DNA para perfilar da transcrição e o hybridization de genes humanos. O programa do oligodb determina oligos usando dados humanos do DNA-dNA-transcript de ENSEMBL. Reference [PubMed] [pdf]

OligoPicker - OligoPicker pode selecionar até cinco pontas de prova do oligo para cada uma das seqüências que do DNA você fornece para se manchar microarray. Referência [PubMed] Livre

PrimerQuest Livre

o software mais mais bem vestido automatizado Genome-largo dos server do finder (ABERTURA ) que pode projetar milhares de uns pares mais maiss bem vestido amplificar um jogo da leitura aberta molda (ORFs) a coberta de um genome inteiro. Livre

O ORGULHO GenomePRIDE do genome é uma ferramenta mais maia bem vestido do software do projeto que projete os primers de PCR ou os oligos longos baseados em seqüências anotadas.
GenomePRIDE foi usado para o projeto dos muitos DNA arrays/chips. Livre

Centro de Primer3 Whitehead Institute/MIT para a pesquisa do genome, livre

Premier Mais mais bem vestido Premier Biosoft Internacional.

PRIMEGENS- Primegens (projeto mais mais bem vestido usando fragmentos específicos do gene) é um programa de computador que você use fragmentos gene-específicos selecionados e então ele projeta uns pares mais maiss bem vestido para amplifications de PCR. Referência [PubMed]

Server de ProbeWiz - o server do CBS ProbeWiz WWW prediz pares optimal do primer de PCR para a geração das pontas de prova para disposições do DNA. Referência [PubMed]

ProMide - ProMide é uma coleção da comando-linha ferramentas para a seleção da ponta de prova e o projeto de Microarray. Livre

Sarani - o ouro de Sarani (desenhador de Oligo do genome) é um software para o projeto em grande escala automático de pontas de prova optimal do oligonucleotide para experiências microarray. Os milhares das seqüências do gene podem ser analisados junto e as mais melhores pontas de prova disponíveis do oligonucleotide com propriedades thermodynamic uniformes e a similaridade mínima aos genes non-specific podem ser selecionadas. Produto da costa Genomics.

STACKdb - o STACKdb, o alinhamento do Tag da seqüência e o consenso Knowledgebase, são gerados pelas seqüências processando do EST e do mRNA obtidas de Genbank com as etapas da análise do encanamento mascarar consistindo, aglomerar-se, de alinhamento e de variação. A base de dados de STACKdb é usar-se criado dirige "stackPACK chamado". Genetics elétrico direto também disponível. Livre

OMP visuais - OMP visual escolhe primers e as pontas de prova do oligo que não se cruzam hybridize com se e os outros alvos. Usa o motor de OMP (oligonucleotide que modela a plataforma), baseado na pesquisa científica pelo perito do thermodynamics dos ácidos nucleic, Dr. John SantaLucia.  Software do Dna, Inc.

WebPrimer Livre

Premier Biosoft Internacional Do Primer De Xpression.