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Dna Longo Microarrays Do Oligonucleotide:

As disposições longas do oligonucleotide são criadas usando o ink-jet que imprime ou imprimir robotic.

Os algoritmos são usados a fim projetar oligos longos do mesmo tamanho de ao redor 60 nucleotides (60-mers). Entretanto, estes oligos mais longos são mais difíceis de escolher porque necessitam se ter pouco homology.

Imprimir da bomba do ink-jet produz as disposições 60-mer. 100 gotas do picoliter dos reagents são imprimidas em uma superfície hydrophobic que contem grupos quimicamente ativos do OH do hyrdoxyl-. Os monomers do DNA do phosphoramidite nas gotas reagem com os grupos do OH, tendo por resultado a ligação covalent.

A corrediça pode então hybridized com pontas de prova etiquetadas do DNA. Similar a outros microarrays do DNA, você lava-se após o hybridization, varredura e analisa-se os dados resultantes.

As companhias produzem regularmente disposições longas do oligonucleotide com mais extremamente de 25.000 pontas de prova diferentes.

 

Diferenças e vantagens de DNA longo Microarrays do oligonucleotide:

- os oligos longos podem distinguir entre mRNAs alternativamente emendados (este é completamente importante porque a maioria de genes têm isoforms alternativos!)

- os oligos longos (60-mers) são únicos encalhados que faz DNA usual etapas microarray do denaturation desnecessárias

- os oligos longos (60-mers) permitem o specificity melhor no hybridization microarray do DNA

- Modificado Fàcilmente

- adaptable