Informação em DNA Microarrays
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DNA Microarrays, uma introdução:
Introdução a Microarrays
A disponibilidade de seqüências genomic inteiras de muitos organismos (tais como o projeto humano do genome) criou a necessidade para a análise elevada do throughput de testes padrões da expressão do gene.
Os microarrays do DNA revolutionized a análise funcional e genomic.
A evolução do DNA Microarray:
Nos 1980's, as colônias bacterianas foram manchadas nas membranas de nylon com as inserções ou cDNAs genomic diferentes
Os 1990's resultaram no emergence do ink-jet que mancha os métodos que permitiram a síntese in situ de 60 pontos do oligo do mer nas corrediças de vidro.
Uns microarrays desenvolvidos mais adicionais do DNA de Affymetrix que sejam baseados no alto densidade 25 oligos do mer do cDNA humano arranjam em seqüência.
Fundo em DNA Microarrays
A premissa básica do DNA microarray é que as amostras ou os alvos do RNA são pontas de prova sabidas hybridized de cDNAs/oligo nas disposições.
Microarrays foi projetado originalmente medir níveis da expressão do gene de alguns genes. Recentemente, os microarrays high-density foram desenvolvidos que permitiram a análise global da expressão do gene ou do transcriptome. Esta análise global permite que se determine a função celular dos genes, a natureza e o regulamento de pathways biochemical, e os mecanismos regulatory no jogo durante determinadas condições ou doenças sinalizando.
Regulamento da transcrição e do DNA Microarrays
O projeto humano do Genome permitiu que uma riqueza vasta da informação venha em nossas mãos. Entretanto, um problema enorme está analisando os genes novos e as funções regulatory putative destes genes. A análise microarray do DNA permitiu estes genes recentemente anotados e genes da novela a ser examinados. Os pathways regulatory novos podem ser examinados usando microarrays do DNA. Por exemplo, o gene novo pode ser um fator do transcriptional. Microarrays pode examinar o efeito que o gene tem em milhares dos genes em um momento, sob muitas circunstâncias em uma maneira simples e rápida.
Aplicações de DNA Microarrays
Os microarrays do DNA foram usados examinar as mudanças da expressão do gene sob doenças tais como o cancer. O Tumour que perfila usando microarrays do DNA permite a análise do desenvolvimento e a progressão de tais doenças complexas.
Usando microarrays do DNA, se pode examinar alvos para a descoberta da droga e biomarkers diagnósticos e prognósticos potenciais para muitas doenças complexas.
Os microarrays do DNA são usados geralmente detectar vírus e outros pathogens das amostras do sangue e assim podem ser usados como um método de deteção do pathogen.
Os microarrays do DNA têm sido usados mais recentemente identificar marcadores inheritable, e conseqüentemente foram usados enquanto uma ferramenta genotyping.
As microplaquetas de SNP baseadas na tecnologia microarray do DNA permitiram perfilar elevado do throughput de únicos polymorphisms do nucleotide usando uma microplaqueta ou põem a aproximação. Isto permitiu que os polymorphisms assayed mais rapidamente e também seu relavence à doença determinado fàcilmente.
Vantagens de DNA Microarrays
Os microarrays do DNA são melhores do que outros métodos perfilando (tais como os métodos do SÁBIO, os SH, do PCR) que são:
- mais fácil de usar-se
- é o elevado-throughput (pode analisar milhares dos genes ou dos marcadores em um momento)
- gere quantidades grandes de dados em pouca hora
- não reque arranjar em seqüência em grande escala
- permita o quantitation dos milhares dos genes de muitas amostras
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