Protein Microarrays Protein Microarrays
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Odwiedź Molekularnej stacji wielki artykuł na przeciwciała i Protein Microarrays
Protein Chips: Białko Chips:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Protein Microarrays może być oparta na żadnych ligand-binding assay, że opiera się na tworzeniu produktów z unieruchomiony wychwytywania i cząsteczki docelowej cząsteczki obecne w roztworze. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Te oznaczenia mogą być umieszczane na miniturized i białka microarray chips.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Protein microarrays są obecnie staje się bardzo popularne ze względu na ich możliwych przyszłych zastosowań w badaniach kwasów nukleinowych-białko, białko-białko, ligand-receptor, narkotyki białka docelowego, oraz enzym-substrat interakcji.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Rodzaje Capture Molecules dla Protein Microarray Chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. Aby analizować białka interakcji z innymi cząsteczkami, białka microarrays mogą mieć różne rodzaje cząsteczek immobilizowane na powierzchni szkiełka do działania jako wychwytywania cząsteczek białka microarray w teście.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Rysunek 1 ilustruje najczęściej białka macierzy, przeciwciało microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Przeciwciała są zauważone na szklanej slajdów. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. Dwie komórki lysates z białek z etykietą Cy3 i Cy5 (na przykład raka vs normalny) dodaje się jako rozwiązanie na tablicy białka. Signals are detected from the two different signals. Sygnały są wykrywane z dwóch różnych sygnałów. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Dane są obliczane umożliwiające analizę, ile barwnika-oznaczone białka przeciwciał w każdym miejscu są wiążące. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Ta informacja pozwala na ustalenie, czy białka wypowiedzi jest na regulowanych w raka, dół regulowany lub niezmienione.
Figure 2. Rysunek 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) wykaże, białko tablice, które są oparte na microarray analizę interakcji antygen-przeciwciało. Antigens are spotted onto glass slides. Antygeny są zauważone na szkło slajdów. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Przeciwciała, które oznaczone są wiążące dla antygenów i emitują sygnał fluorescencyjny (wykazywane jako żółta gwiazdka), które następnie mogą zostać wykryte z miejscem na tablicę.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) wykazuje, białka microarray składzie plamy, które działają jak sandwich immunotestach. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Przeciwciała są zauważone na chipy i komórek lysate lub rozwiązanie jest stosowane do slajdów. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Przeciwciała są inkubowane z roztworu, później mycie, aby usunąć wiązania niespecyficznego. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. W sandwich kompleksy utworzone emituje sygnał z wykrywalną miejscu.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) interakcje białko-białko białka microarray gdy białka są zauważone na białka chip, białek i oznaczone są dodawane do chipa i inkubatorów w celu ustalenia, gdzie mogą one wiążące i interakcję. A detectable signal is emitted from binding spots. Wykrywalną sygnał emitowany jest wiążące od plamy.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) kwasu nukleinowego-białka macierzy interakcji, (tutaj DNA-białko interakcji chip). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Kwasy nukleinowe, takich jak DNA są zauważone na szklanej slajdów. This could be transcriptional binding sites for example. Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. Może to być wiążące transkrypcji na przykład witryn. Białka, takie jak fluorescencyjne oznaczone wiążące DNA czynników transkrypcyjnych w roztworze są dodawane do chipa i inkubatorów na tablicy. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. Wykrywalną sygnał emitowany jest z DNA plam, gdy białka wiążące.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed. Receptor proteins are spotted on glass slides. e) Jeśli masz zestaw ligandy i chcesz znaleźć wiążą się z receptorami, można użyć receptor-ligand białka chip wyświetlane. receptora białka są naniesionego na szkło slajdów. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescencyjne ligandy oznaczone są dodawane do mikroprocesora. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Wiązanie ligand dla receptorów powoduje emisji wykrywalną sygnał, który wskazano na spoty interakcji (np. białka, które nie wiążą się z ligand).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) test na enzym-subrates specyfikę można zatrudniać enzym-substrat białka microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Ten chip składa się z descrete nano-studni, w której enzymy są wiążące. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Podłoże jest dodawany do studni i nano-emisji sygnału jest wykrywany z nano-studni w celu oznaczania na funkcję enzymu.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
