Information on DNA Microarrays Informacje na temat DNA Microarrays
DNA Microarrays, an Introduction : DNA Microarrays, Wstęp:
Introduction to Microarrays Wprowadzenie do Microarrays
Availability of whole genomic sequences from many organisms (such as the human genome project) have created the need for high throughput analysis of gene expression patterns. Dostępność całej sekwencji genomu wielu organizmów (takich jak projekt genomu człowieka) stworzyły potrzebę wysokiej przepustowości Analiza ekspresji genów struktury.
DNA microarrays have revolutionized functional and genomic analysis. DNA microarrays które zrewolucjonizowały funkcjonalne i analizy genomu.
The Evolution of the DNA Microarray: Zmian w Mikromacierz:
In the 1980's, bacterial colonies were spotted on nylon membranes with different genomic inserts or cDNAs W 1980, kolonie bakterii zostały dostrzeżone na nylonu membrany z różnych genomu wstawia lub cDNAs
The 1990's resulted in the emergence of ink-jet spotting methods which allowed the in situ synthesis of 60-mer oligo spots on glass slides. W 1990, doprowadziły do powstania druku atramentowego plamień metody, które pozwoliły na miejscu syntezę 60-mer oligo plamy na szkle slajdów.
Affymetrix further developed DNA microarrays which were based on high-density 25-mer oligos from human cDNA sequences. Affymetrix rozwinięte DNA microarrays, które zostały w oparciu o wysokiej gęstości 25-mer oligos z sekwencji ludzkiego cDNA.
Background on DNA Microarrays Dodatkowe informacje na temat DNA Microarrays
The basic premise of the DNA microarray is that RNA samples or targets are hybridized to known cDNAs/oligo probes on the arrays. Podstawową przesłanką jest to, że Mikromacierz próbek RNA lub cele są hybridized do znanych cDNAs / oligo sondy na tablice.
Microarrays were originally designed to measure gene expression levels of a few genes. Microarrays były pierwotnie zaprojektowane do pomiaru poziomu ekspresji genu kilka genów. Recently, high density microarrays have been developed which have allowed the global analysis of gene expression or the transcriptome. This global analysis allows one to determine the cellular function of genes, the nature and regulation of biochemical pathways, and the regulatory mechanisms at play during certain signalling conditions or diseases. Ostatnio wysokiej gęstości microarrays zostały opracowane, które pozwoliły globalnej analizy ekspresji genów lub transcriptome. Globalnej analizy pozwala na określenie funkcji genów komórkowych, charakter i regulacji biochemicznych ścieżek i mechanizmów regulacyjnych w grę podczas niektórych sygnalizacji warunków lub chorób.
Regulation of Transcription and DNA Microarrays Rozporządzenia i transkrypcja DNA Microarrays
The Human Genome Project has allowed a vast wealth of information to come into our hands. The Human Genome Project umożliwił szeroki bogactwo informacji, aby w nasze ręce. However, a huge problem is analyzing the new genes and putative regulatory functions of these genes. Jednak wielkim problemem jest analiza nowych genów i putative regulacyjnych funkcji tych genów. DNA microarray analysis has allowed these newly annotated genes and novel genes to be examined. New regulatory pathways can be examined using DNA microarrays. Mikromacierz analiza pozwoliła tych genów nowo adnotacją i nowe geny, które mają być zbadane. Nowych ścieżek mogą być badane przy użyciu DNA microarrays. For example, the new gene may be a transcriptional factor. Microarrays can examine the effect that gene has on thousands of genes at a time, under many conditions in a simple and fast manner. Na przykład, nowego genu może być czynnikiem transkrypcji. Microarrays może zbadać wpływ genów, które ma na tysiące genów jednocześnie, pod wieloma warunkami, w prosty i szybki sposób.
Applications of DNA Microarrays Wnioski DNA Microarrays
DNA microarrays have been used to examine the gene expression changes under diseases such as cancer. Tumour profiling using DNA microarrays allows the analysis of the development and the progression of such complex diseases. DNA microarrays zostały wykorzystane do badania ekspresji genów w ramach zmian chorób takich jak rak. Tumour profilowania przy użyciu DNA microarrays pozwala na analizę rozwoju i progresji choroby takie skomplikowane.
Using DNA microarrays, one can examine targets for drug discovery and potential diagnostic and prognostic biomarkers for many complex diseases. Korzystanie z DNA microarrays, można zbadać cele dla potencjalnych leków i diagnostyki i prognozowania biomarkerów dla wielu skomplikowanych chorób.
DNA microarrays are used commonly to detect viruses and other pathogens from blood samples and thus can be used as a pathogen detection method. DNA microarrays są powszechnie wykorzystywane do wykrywania wirusów i innych patogenów z próbek krwi, a tym samym mogą być wykorzystywane jako metoda wykrywania patogenów.
DNA microarrays have been more recently used to identify inheritable markers, and therefore have been used as a genotyping tool. DNA microarrays zostały ostatnio użyte do identyfikacji dziedzicznych markerów, i dlatego zostały wykorzystane jako narzędzie genotypowanie.
SNP chips based on DNA microarray technology have allowed the high throughput profiling of single nucleotide polymorphisms using a chip or array approach. This has allowed polymorphisms to be more quickly assayed and also their relavence to disease to be easily determined. SNP chipów opartych na technologii Mikromacierz pozwoliły wysokiej przepustowości profilowanie polimorfizmów pojedynczych nukleotydów przy użyciu chipa lub tablicy. To pozwoliło polimorfizmów się szybciej zbadanego, a także ich relavence na choroby, które mają być łatwo ustalony.
Advantages of DNA Microarrays Zalety DNA Microarrays
DNA microarrays are better than other profiling methods (such as SAGE, SH, PCR methods) in that they are: DNA microarrays są lepsze niż inne metody profilowania (takich jak szałwia, SH, metody PCR), że są one:
- easier to use -- Łatwiejszy w użyciu
- are high-throughput (can analyze thousands of genes or markers at a time) -- Są wysokiej przepustowości (może analizować tysięcy genów lub markerów na raz)
- generate large amounts of data in little time -- Generowania dużych ilości danych w krótkim czasie
- do not require large-scale sequencing -- Nie wymagają dużych sekwencjonowanie
- allow the quantitation of thousands of genes from many samples -- Umożliwić ilościowego tysięcy genów z wielu próbek
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
