Protein Microarrays Protein Microarrays
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Besøk Molecular Station for en stor artikkel om Antibody og Protein Microarrays
Protein Chips: Protein Chips:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Protein Microarrays kan være basert på en ligand-bindende analysen som er avhengig av dannelse av produkt med en immobilized fange molekylet og et mål molekylet i løsning. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Disse essay kan være miniturized og plassert på en protein microarray chip.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Protein microarrays er nå i ferd med å bli svært populære på grunn av sin mulige fremtidige programmer i studiet av nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, narkotika-protein målet, og enzym-substrat samhandling.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Typer Capture molekyler for Protein microarray Chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. For å analysere proteiner samhandling med andre molekyler, protein microarrays kan ha ulike typer molekyler immobilized på lysbildet overflaten til å handle som fange molekyler i protein microarray analysen.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Figur 1 viser de vanligste protein array, antistoffer microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Antistoffer er prikket inn på et glass lysbilde. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. To cell lysates med proteiner merket med Cy3 og Cy5 (for eksempel kreft kontra normal) er lagt til som en løsning på protein matrisen. Signals are detected from the two different signals. Signalene blir oppdaget fra to forskjellige signaler. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Data er beregnet slik at en analyse av hvor mye farge-merket protein av antistoffer på hvert sted er bindende. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Denne informasjonen kan en for å finne ut om protein uttrykk er opp-regulert i kreft, ned-regulert eller uendret.
Figure 2. Figur 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) viser protein matriser som er basert på microarray analyse av antigen-antistoff samhandling. Antigens are spotted onto glass slides. Antigener er prikket inn glass skred. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Antistoffer som er merket bind for antigener og avgir fluorescerende signal (vist som gul stjerne) som deretter kan oppdages fra punkt på matrisen.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) viser en protein microarray består av stedene som fungerer som en sandwich immunoassays. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Antistoffer er prikket inn på chips og celle lysate eller en løsning er brukt på lysbildet. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Antistoffer er incubated med løsningen, med senere vask for å fjerne ikke-spesifikke bindende. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. Den sandwich complexes dannet avgir en detectable signal fra stedet.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) En protein-protein interaksjon protein microarray hvor proteiner er prikket inn en protein-chip, og merket proteiner er lagt til chip og incubated for å finne ut hvor de kan binde og samhandle. A detectable signal is emitted from binding spots. En detectable signal slippes ut fra bindende flekker.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) Nucleic Acid-protein interaksjon matrise, (her en DNA-protein interaksjon sjetong). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Nucleic syrer som DNA er prikket inn på et glass lysbilde. This could be transcriptional binding sites for example. Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. Dette kan være transcriptional bindende områder, for eksempel. Proteiner som fluorescently merket DNA-bindende transkripsjonstjenester faktorer i løsningen er lagt til chip og incubated på tabellen. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. En detectable signal slippes ut fra DNA-spots der proteiner bind.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed. Receptor proteins are spotted on glass slides. e) Hvis du har et sett av ligands og du vil finne receptors den bind til, kan du bruke en receptor-ligand protein chip som vises. Receptor proteiner er flekket på glass skred. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescently merket ligands legges til brikken. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Binding av ligand til receptors forårsaker utslipp av en detectable signal som viser nøyaktig den samspill kapasitet (dvs. som protein gjorde ligand bind for).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) for å teste enzym-subrates spesifiserer en kan ansette en enzym-substrat protein microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Denne chip består av descrete nano-brønner i enzymer som er bundet av. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Underlaget er lagt inn i nano-brønner og signal-utslipp er oppdaget fra nano-brønner for analysen av enzymet funksjon.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
