Primer and Oligo Design Tools Primer og Oligo Design Tools
Primer Design Tools and Oligo Software : Primer Design Verktøy og Oligo Programvare:
Software, programs, and online bioinformatic tools for the design of primers and oligonucleotides. Programvare, programmer og elektroniske bioinformatic verktøy for design av første og oligonucleotides.
We recommend the following: Vi anbefaler følgende:
Array Designer Premier Biosoft International. Array Designer Premier Biosoft International. Software which can design primers for DNA or oligo arrays. Programvare som kan designe første av DNA eller oligo arrays.
Beacon Designer Premier Biosoft International. Beacon Designer Premier Biosoft International.
OligoArray2.1 OligoArray 2.0 and the new version 2.1 are free software packages that compute gene specific oligonucleotides for OligoArray2.1 OligoArray 2,0 og ny versjon 2,1 er fri programvare-pakker som beregne genetisk bestemte oligonucleotides for
genome-scale oligonucleotide microarray construction. genome-skala oligonucleotide microarray konstruksjon. Reference [ PubMed ] Free Referanse [PubMed] Gratis
Oligodb - Oligodb is a web-based program for the interactive design of DNA oligos for transcription profiling and hybridization of human genes. Oligodb - Oligodb er et web-basert program for interaktiv design av DNA oligos for transkripsjon profilering og hybridization av menneskelige gener. The oligodb program determine oligos using human DNA-transcript data from ENSEMBL. Den oligodb programmet fastslår oligos ved hjelp av menneskelig DNA-transkripsjon data fra ENSEMBL. Reference [ PubMed ][ pdf ] Referanse [PubMed] [pdf]
OligoPicker - OligoPicker can select up to five oligo probes for each of the DNA sequences you provide for microarray spotting. OligoPicker - OligoPicker kan velge opptil fem oligo probes for hver av de DNA-sekvenser du sørge for microarray fange. Reference [ PubMed ] Free Referanse [PubMed] Gratis
PrimerQuest Free PrimerQuest Gratis
Genome-wide Automated Primer finder servers (GAP) Software which can design thousands of primer pairs to amplify a set of open reading frames (ORFs) covering a whole genome. Free Genom-wide Automated Primer Finneren servere (GAP) Programvare som kan designe tusenvis av grunning parene til å forsterke et sett av åpne lesing rammer (ORFs) som dekker en hel genome. Free
Genome PRIDE GenomePRIDE is a primer design software tool that designs PCR primers or long oligos based on annotated sequences. Genom PRIDE GenomePRIDE er en grunning design software som designer PCR første eller lang oligos basert på kommenterte sekvenser.
GenomePRIDE has been used for the design of many DNA arrays/chips. Free GenomePRIDE har vært brukt i utformingen av mange DNA arrays / chips. Free
Primer3 Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, Free Primer3 Whitehead Institute / MIT Center for Genom Forskning, Gratis
Primer Premier Premier Biosoft International. Primer Premier Premier Biosoft International.
PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Using Gene Specific Fragments) is a computer program which you use selected gene-specific fragments and then it designs primer pairs for PCR amplifications. PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Bruke Gene Konkrete Bruddstykker) er et dataprogram som du bruker valgte gene-spesifikke fragmenter, og deretter er det design først parene for PCR presiseringer. Reference [ PubMed ] Referanse [PubMed]
ProbeWiz Server - The CBS ProbeWiz WWW server predicts optimal PCR primer pairs for generation of probes for cDNA arrays. ProbeWiz Server - CBS ProbeWiz WWW server anslår optimale PCR først parene for generering av probes for cDNA arrays. Reference [ PubMed ] Referanse [PubMed]
ProMide - ProMide is a collection of command-line tools for Probe selection and Microarray Design. Free ProMide - ProMide er en samling av kommandolinjeverktøy for Probe utvalg og microarray Design. Free
Sarani - Sarani Gold (Genome Oligo Designer) is a software for automatic large-scale design of optimal oligonucleotide probes for microarray experiments. Sarani - Sarani Gold (Genom Oligo Designer) er en programvare for automatisk storstilt design av optimale oligonucleotide probes for microarray eksperimenter. Thousands of gene sequences can be analyzed together and best available oligonucleotide probes with uniform thermodynamic properties and minimal similarity to non-specific genes can be selected. Tusenvis av genet sekvenser kan bli analysert sammen og best tilgjengelige oligonucleotide probes med ensartet termodynamisk egenskaper og minimal likhet med ikke-spesifikke gener kan bli valgt. Product of Strand Genomics . Produkt av Strand Genomics.
STACKdb - The STACKdb, Sequence Tag Alignment and Consensus Knowledgebase, is generated by processing EST and mRNA sequences obtained from Genbank through a pipeline consisting of masking, clustering, alignment and variation analysis steps. STACKdb - STACKdb, Sequence Tag justering og konsensus Knowledgebase er generert av behandlingen EST og mRNA-sekvenser hentet fra Genbank gjennom en rørledning bestående av maskeringsmiddel, gruppering, innretting og variasjon analyse trinnene. The STACKdb database is created using tools called "stackPACK". Den STACKdb databasen er opprettet ved hjelp av verktøy som kalles "stackPACK". Also available through Electric Genetics . Free Også tilgjengelig gjennom Electric Genetics. Free
Visual OMP - Visual OMP picks primers and oligo probes which do not cross hybridize with each other and other targets. Visual OMP - Visual OMP plukker første og oligo probes som ikke krysser hybridize med hverandre og andre mål. Uses the OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) engine, based on scientific research by nucleic acids thermodynamics expert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc . Bruker den OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) motoren, basert på vitenskapelig forskning ved nucleic syrer termodynamikk ekspert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc.
WebPrimer Free WebPrimer Gratis
Xpression Primer Premier Biosoft International. Xpression Primer Premier Biosoft International.
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
