Among 23 databases, 4 were evaluated precisely (BASE, GeneTraffic, MaxD, RAD ). Blant 23 databaser, 4 ble vurdert nettopp (base, GeneTraffic, MaxD, RAD). Analysed according ot MGED standards. Analysert i henhold ot MGED standarder. Review. Gjennomgang. Transcriptome.ens.fr. Sophie Lemoine - [ Read more ] Sophie Lemoine - [Les mer]

Acuity 4.0 - Enterprise Microarray Informatics. ACUITY 4,0 - Enterprise microarray Informatikk. cross-platform support, data warehousing, and new enabling analysis and visualization tools. cross-platform support, datavarehusprodukt, og nye muliggjør analyse og visualisering. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Les mer]

Agilent Data Analysis. Agilent Data Analysis. Software. ChIP Analytics Software • CGH Analytics Software • Feature Extraction Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring Workgroup • Rosetta Resolver® System - [ Read more ] Chip Analytics Software • CGH Analytics programvare • Feature Utvinning Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring arbeidsgruppe • Rosetta Løsnings ® System - [Les mer]

The Automated Microarray Pipeline is a series of programs that allow the automated normalization and web publication of microarray data. Den automatiserte microarray Rørledning er det en rekke programmer som lar den automatiserte normalisering og web-publisering av microarray data. Data stored in a MADAM-compliant database, like that provided with MADAM, can be automatically downloaded, normalized - [ Read more ] Data lagres i en MADAM-kompatibel database, slik som forutsatt med MADAM, kan lastes ned automatisk, normalisert - [Les mer]

Argus - a microarray database software system which functions to process, analyze, manage, and publish microarray data. Argus - et microarray databaseprogramvaren system som fungerer til å behandle, analysere, administrere og publisere microarray data. Comander et al. Sjef et al. A new database system for web-based analysis of multiple microarray datasets. En ny database for web-basert analyse av flere microarray datasett. Genome Research 2001 11(9):1603-1610. Genom Forskning 2001 11 (9) :1603-1610. - [ Read more ] -- [Les mer]

Arrayplot allows for rapid graphical visalisuation and normalisation of microarray data. Arrayplot muliggjør rask grafisk visalisuation og normalisering av microarray data. Also provides a user-friendly interface to visualise data distribution and to view most variant genes. Gir også et brukervennlig grensesnitt for å visualisere data distribusjon og for å vise mest varianten gener. Permits to calculate normalisation factor based on overall median intensity. Mulighet til å beregne normalisering faktor basert på generelle median intensitet. Arrayplot. Free software! Gratis programvare! - [ Read more ] -- [Les mer]

Microarray Image Analysis Software. Microarray Image Analysis Software. A software package developed for the quantification of gene expression arrays. En pakke utviklet for kvantifisering av gene expression arrays. AlphaInnotech - [ Read more ] AlphaInnotech - [Les mer]

Michael Eisen's software at Stanford - includes ScanAlyze, Cluster and TreeView. Michael Eisen programvare ved Stanford - inkluderer ScanAlyze, Cluster og TreeView. - [ Read more ] -- [Les mer]

Doelan is an automated tool which checks the quality of produced DNA microarrays. Doelan er et automatisert verktøy som sjekker kvaliteten av produsert DNA microarrays. Software is based on the execution of TestSuites on quality control data to validate batches of chips. Programvaren er basert på kjøring av TestSuites på kvalitetskontroll av data for å validere grupper av sjetonger. - [ Read more ] -- [Les mer]

Enterprise wide solution for automating and repeating tasks in data processing, analysis and interpretation from diverse data formats (all microarray formats, Mass Spectrometry, 2D Gel). Enterprise bred løsning for å automatisere og gjenta oppgaver i databehandling, analyse og tolkning av data fra ulike formater (alle microarray formater, mass spectrometry, 2D-Gel). - [ Read more ] -- [Les mer]

GenePix Pro 6.0 for Microarray Image Analysis for microarrays, tissue arrays and cell arrays. GenePix Pro 6,0 for microarray Image Analysis for microarrays, vev matriser og celle arrays. New spot-finding algorithms, full spot finding automation, Automatic balancing of PMT gain for all GenePix scanners, Batch Analysis tab for browsing and analyzing batches of images, Morphological background subtraction, support for opening and analyzing third-party images. Ny spot-finne algoritmer, full spot finne automatisering, Automatisk balansering av PMT gevinst for alle GenePix skannere, Batch analyse kategorien for å bla gjennom og analysere grupper av bilder, morphological bakgrunn subtraksjon, støtte for åpning og analysere tredjepart bilder. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Les mer]

GeneTraffic Version 3.2. GeneTraffic Version 3,2. Centralized data management for all microarray platforms, Powerful, easy-to-use microarray data analysis tools, Seamless Affymetrix™ integration and analysis (PLIER, GC-RMA, RMA), Rich MIAME-compliant experiment annotation. Sentralisert data for alle microarray plattformer, kraftig, brukervennlig microarray data analyseverktøy, Seamless Affymetrix ™ integrering og analyse (PLIER, GC-RMA, RMA), rikt MIAME-kompatibel forsøket uttalelse. - [ Read more ] -- [Les mer]

GEPAS - Gene Expression Pattern Analysis Suite - [ Read more ] GEPAS - Gene Expression Pattern Analysis Suite - [Les mer]

The Microarray Data Manager, implemented in Java, facilitates the entry of data into a relational database. The microarray Data Manager, implementert i Java, forenkler innlegging av data i en relasjonsdatabase. MADAM guides users through the microarray process from RNA procurement to data analysis, offering intelligent forms to simplify the tracking of exp - [ Read more ] MADAM guider brukerne gjennom microarray prosessen fra RNA anskaffelser til data analyse, som tilbyr intelligente skjemaer for å forenkle sporing av omk - [Les mer]

MAGE Software Toolkit: MAGE-stk. MAGE Software Toolkit: MAGE-stk. MAGE Object Model. MAGE Object Model. Sourceforge. - [ Read more ] -- [Les mer]

Micovito - Microarray Comparison Visualization Tool. Micovito - microarray Comparison visualisering Tool. A tool enabling intuitive understanding of data as a first step into comparison of microarray experiments. Et verktøy gjør det mulig intuitiv forståelse av data som et første skritt i sammenligning av microarray eksperimenter. Visualization of groups of genes whose expression profiles are similar in both microarray experiments, but also genes whose expression profiles are similar in one microarray experiment but not in the other. Visualisering av grupper av gener hvis uttrykk profiler er lik i begge microarray eksperimenter, men også gener hvis uttrykk profiler ligner på en microarray eksperiment, men ikke i andre. Micovito - [ Read more ] Micovito - [Les mer]

Microarray Explorer (MAExplorer) is a Java-based data-mining facility for cDNA or oligonucleiotide microarray databases. Microarray Explorer (MAExplorer) er en Java-basert data-mining for cDNA eller oligonucleiotide microarray databaser. MAExplorer - [ Read more ] MAExplorer - [Les mer]

TIGR?s Microarray Data Analysis System, a Java application, provides users an intuitive interface to design analysis protocols combining one or more normalization and filtering steps. TIGR? S microarray Data Analysis System, en Java-applikasjon, gir brukerne et intuitivt grensesnitt for design analyse protokoller kombinere en eller flere normalisering og filtrering trinnene. In this way, data from many individual hybridizations can be treated - [ Read more ] På denne måten data fra mange individuelle hybridizations kan behandles - [Les mer]

PARTISAN arrayLIMS. Partisan arrayLIMS. Clondiag chip technologies. Clondiag chip-teknologi. arrayLIMS is designed to manage all pertinent issues in the microarray life cycle, including array design, microarray production, biochemical reactions (hybridization), chip detection (image scanning/acquisition), data analysis and data mining. arrayLIMS er designet for å håndtere all relevant spørsmål i den microarray livsløpet, inkludert array design, microarray produksjon, biokjemiske reaksjoner (hybridization), chip gjenkjenning (bildet skanning / erverv), data analyse og data mining. - [ Read more ] -- [Les mer]

Rosetta Resolver System. Rosetta Løsnings System. Includes the Rosetta Syllego system for the management of genetic data and analysis. Omfatter Rosetta Syllego system for styring av genetiske data og analyser. For drug discovery - Determine and validate targets, Prioritize compounds, Pinpoint on- and off- target treatment effects, Determine underlying treatment mechanisms of action. For drug discovery - Bestem og validere mål, Prioritere sammensetninger, Fastslå on-og off-target behandling effekter, fastslår underliggende behandling virkningsmekanismer. Rosetta Inpharmatics - [ Read more ] Rosetta Inpharmatics - [Les mer]

Signet Agilent. Signet Agilent. - [ Read more ] -- [Les mer]

Software Utilites for DNA Microarray. Programvare Utilites for DNA microarray. ExpressConverter and SlideMap. ExpressConverter og SlideMap. - [ Read more ] -- [Les mer]

Normalized and filtered expression files can be analyzed using TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). Normalisert og filtrert uttrykk filer kan bli analysert ved hjelp av TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). MeV is a versatile microarray data analysis tool, incorporating sophisticated algorithms for clustering, visualization, classification, statistical analysis - [ Read more ] MeV er en allsidig microarray data analyseverktøyet, som omfatter avanserte algoritmer for klyngen, visualisering, klassifisering, statistiske analyser - [Les mer]

VARAN - a tool for analyzing variability amongst DNA microarrays experiments. VARAN - et verktøy for å analysere variasjon blant DNA microarrays eksperimenter. Published in Bioinformatics : http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [ Read more ] Publisert i Bioinformatikk: http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [Les mer]

yMGV - Yeast Microarray Global Viewer - an on-line database, provides a synthetic view of the transcriptional expression profiles of yeast genes among most of the published expression datasets. yMGV - Gjær microarray Global Viewer - et on-line database, gir en kunstig syn på transcriptional uttrykk profiler av gjær gener blant de fleste av de publiserte uttrykk datasett. yMGV - [ Read more ] yMGV - [Les mer]

yTAFNET is designed to help the characterization of connections between the different yeast regulatory networks. yTAFNET er utviklet for å hjelpe karakterisering av forbindelser mellom de ulike gjær regulerende nettverk. - [ Read more ] -- [Les mer]