Microarray Types and Info Microarray Typer og Info

• Learn About Microarrays Lær Om Microarrays
• DNA Microarrays DNA Microarrays
• Protein Microarrays Protein Microarrays
• Antibody Microarrays Antibody Microarrays
• Tissue Microarrays Tissue Microarrays

Using Microarrays Bruke Microarrays

• Microarray Vendors Microarray Vendors
• Microarray Software Microarray Programvare
• Microarray Protocols Microarray Protokoller
• Microarray Forums Microarray Forums
• Contact Us / Advertise Kontakt oss / Annonsere

DNA Microarray Protocols DNA microarray Protokoller	DNA Microarray Bioinformatics DNA microarray Bioinformatikk	Learn about DNA Chips Lær om DNA-Chips	DNA Microarray Vendors and Products DNA microarray leverandører og produkter	DNA Array Forum DNA Array Forum	DNA Microarray News DNA microarray Nyheter

Long Oligonucleotide DNA Microarrays : Long Oligonucleotide DNA Microarrays:

Long Oligonucleotide arrays are created using either ink-jet printing or robotic printing. Long Oligonucleotide arrays er opprettet ved hjelp av enten blekk-jet utskrift eller robotic utskrift.

Algorithms are used in order to design long oligos of the same size of around 60 nucleotides (60-mers). Algoritmer er brukt for å utforme lang oligos av samme størrelse på rundt 60 nucleotides (60-mers). However, these longer oligos are more difficult to pick as they need to have little homology to each other. Men disse lenger oligos er vanskeligere å plukke som de trenger for å ha liten homologi til hverandre.

Ink-jet pump printing produces the 60-mer arrays. Ink-jet pumpe utskrift produserer 60-MER arrays. 100 picoliter droplets of reagents are printed onto aa hydrophobic surface containing chemically active hyrdoxyl- OH groups. 100 picoliter dråpestørrelse av reagenser er trykt på aa hydrophobic overflaten inneholder kjemisk aktive hyrdoxyl-OH grupper. The phosphoramidite DNA monomers in the droplets react with the OH groups, resulting in covalent bonding. Den phosphoramidite DNA monomers i dråpestørrelse reagerer med OH-grupper, noe som resulterer i Kovalent bonding.

The slide can then be hybridized with labeled cDNA probes. Lysbildet kan da bli hybridized med merket cDNA probes. Similar to other DNA microarrays, you wash after hybridization, scan and analyze the resulting data. I likhet med andre DNA microarrays du vaske etter hybridization, skanne og analysere de resulterende data.

Companies regularly produce Long oligonucleotide arrays with greater than 25,000 different probes. Selskaper regelmessig produserer Long oligonucleotide arrays med mer enn 25000 forskjellige probes.

Differences and Advantages of Long Oligonucleotide DNA Microarrays: Forskjeller og fordeler av Long Oligonucleotide DNA Microarrays:

- Long oligos can distinguish between alternatively spliced mRNAs (this is quite important as most genes have alternative isoforms!) -- Long oligos kan skille mellom alternativt skjøtes mRNAs (dette er ganske viktig som de fleste gener har alternative isoforms!)

- Long oligos (60-mers) are single stranded which makes usual DNA microarray denaturation steps un-necessary -- Long oligos (60-mers) er enkelt strandet som gjør vanlig DNA microarray denaturation trinn un-nødvendig

- Long oligos (60-mers) permit better specificity in DNA microarray hybridization -- Long oligos (60-mers) tillater bedre spesifiserer i DNA microarray hybridization

- Easily Modified -- Enkelt endres

- Adaptable -- Tilpasningsdyktige