menu

Information on DNA Microarrays Informasjon om DNA Microarrays

protokoller
microarray sjetonger bioinformatikk
lære
leverandører
matrise forum diskusjon

DNA Microarray Protocols DNA microarray Protokoller

DNA Microarray Bioinformatics DNA microarray Bioinformatikk

Learn about DNA Chips Lær om DNA-Chips

DNA Microarray Vendors and Products DNA microarray leverandører og produkter

DNA Array Forum DNA Array Forum

DNA Microarray News DNA microarray Nyheter

DNA Microarrays, an Introduction : DNA Microarrays, en innføring:

Introduction to Microarrays Introduksjon til Microarrays

Availability of whole genomic sequences from many organisms (such as the human genome project) have created the need for high throughput analysis of gene expression patterns. Tilgjengelighet av hele Genova-sekvenser fra mange organismer (for eksempel Human Genome Project) har skapt behovet for høy overføringshastighet analyse av gene expression mønstre.

DNA microarrays have revolutionized functional and genomic analysis. DNA microarrays har revolusjonerte funksjonelle og Genova analyse.

The Evolution of the DNA Microarray: Utviklingen av DNA microarray:

In the 1980's, bacterial colonies were spotted on nylon membranes with different genomic inserts or cDNAs I 1980, bakterielle kolonier ble sett på nylon membraner med forskjellige Genova innsettinger eller cDNAs

The 1990's resulted in the emergence of ink-jet spotting methods which allowed the in situ synthesis of 60-mer oligo spots on glass slides. 1990-tallet førte til fremveksten av blekk-jet fange metoder som gjorde det i situ syntese av 60-MER oligo flekker på glass skred.

Affymetrix further developed DNA microarrays which were based on high-density 25-mer oligos from human cDNA sequences. Affymetrix videreutviklet DNA microarrays som var basert på høy tetthet 25-MER oligos fra menneskelige cDNA sekvenser.

Background on DNA Microarrays Bakgrunn på DNA Microarrays

The basic premise of the DNA microarray is that RNA samples or targets are hybridized to known cDNAs/oligo probes on the arrays. Den grunnleggende forutsetningen for DNA microarray er at RNA prøver eller mål er hybridized til kjente cDNAs / oligo probes på arrays.

Microarrays were originally designed to measure gene expression levels of a few genes. Microarrays ble opprinnelig utviklet for å måle gene expression nivåer av noen få gener. Recently, high density microarrays have been developed which have allowed the global analysis of gene expression or the transcriptome.  This global analysis allows one to determine the cellular function of genes, the nature and regulation of biochemical pathways, and the regulatory mechanisms at play during certain signalling conditions or diseases. Nylig høy tetthet microarrays har blitt utviklet som har tillatt det globale analyse av gene expression eller transcriptome. Globale analyse gjør det interessant å fastslå cellular funksjon av gener, natur og regulering av biokjemiske pathways, og regulerende mekanismer på spille under visse signalanlegg eller sykdommer.

Regulation of Transcription and DNA Microarrays Forskrift av Transkripsjon og DNA Microarrays

The Human Genome Project has allowed a vast wealth of information to come into our hands. The Human Genome Project har tillatt en enorm mengde informasjon for å komme inn i våre hender. However, a huge problem is analyzing the new genes and putative regulatory functions of these genes. Imidlertid et stort problem er å analysere den nye gener og putative regulerende funksjoner av disse genene. DNA microarray analysis has allowed these newly annotated genes and novel genes to be examined.  New regulatory pathways can be examined using DNA microarrays. DNA microarray analyser har gjort at disse nylig kommenterte gener og romanen gener for å bli undersøkt. Nye regulatoriske pathways kan bli undersøkt ved hjelp av DNA microarrays. For example, the new gene may be a transcriptional factor.  Microarrays can examine the effect that gene has on thousands of genes at a time, under many conditions in a simple and fast manner. For eksempel det nye genet kan være en transcriptional faktor. Microarrays kan undersøke effekten at genet har på tusenvis av gener på en gang, under mange forhold på en enkel og rask måte.

Applications of DNA Microarrays Anvendelser av DNA Microarrays

DNA microarrays have been used to examine the gene expression changes under diseases such as cancer.  Tumour profiling using DNA microarrays allows the analysis of the development and the progression of such complex diseases. DNA microarrays har blitt brukt til å undersøke gene expression endringer under sykdommer som kreft. Svulst profilering ved hjelp av DNA microarrays tillater analyse av utvikling og progresjon av slike komplekse sykdommer.

Using DNA microarrays, one can examine targets for drug discovery and potential diagnostic and prognostic biomarkers for many complex diseases. Ved hjelp av DNA microarrays, kan man undersøke mål for legemiddelutvikling og potensielle diagnostiske og prognostic biomarkers for mange komplekse sykdommer.

DNA microarrays are used commonly to detect viruses and other pathogens from blood samples and thus can be used as a pathogen detection method. DNA microarrays brukes vanligvis til å oppdage virus og andre patogener fra blodprøver og dermed kan brukes som en patogen deteksjon metode.

DNA microarrays have been more recently used to identify inheritable markers, and therefore have been used as a genotyping tool. DNA microarrays har blitt mer nylig brukes til å identifisere inheritable markører, og derfor har blitt brukt som en genotyping.

SNP chips based on DNA microarray technology have allowed the high throughput profiling of single nucleotide polymorphisms using a chip or array approach.  This has allowed polymorphisms to be more quickly assayed and also their relavence to disease to be easily determined. SNP sjetonger basert på DNA microarray teknologi har tillatt den høye gjennomstrømningen profilering av single nucleotide polymorphisms ved hjelp av en brikke eller matrise tilnærming. Dette har tillatt polymorphisms å være raskere assayed og også deres relavence sykdom å være lett bestemmes.

Advantages of DNA Microarrays Fordeler med DNA Microarrays

DNA microarrays are better than other profiling methods (such as SAGE, SH, PCR methods) in that they are: DNA microarrays er bedre enn andre profilering metoder (for eksempel Sage, SH, PCR metoder) i det de er:

- easier to use -- Enklere å bruke

- are high-throughput (can analyze thousands of genes or markers at a time) -- Er høy overføringshastighet (kan analysere tusenvis av gener eller markører på et tidspunkt)

- generate large amounts of data in little time -- Generere store mengder data på kort tid

- do not require large-scale sequencing -- Ikke krever store sekvensering

- allow the quantitation of thousands of genes from many samples -- Tillater quantitation av tusenvis av gener fra mange eksempler