menu

Weefsel Microarrays

Weefsel Microarrays een Inleiding:

Het weefsel microarrays (TMAs) wordt gebruikt om de uitdrukking van genen in veelvoudige individuele weefselsteekproeven op één dia gelijktijdig te analyseren. TMAs is samengesteld uit kleine 0.6 - 3.0 mmkernen van weefsel van de paraffineblokken van het donorweefsel die bij een hoogte - dichtheid op een dia worden opgesteld.

microarray weefsel

Het Inzicht van de technologie: identificatie van biomarkers met weefsel microarray technologie Jena M Giltnane en Oncologie van de Praktijk van de Aard van David L Rimm Klinische (2004) 1, 104-111

Het weefsel Microarrays heeft toegestaan de weefsel traditionele analyse van conventionele histologische paraffineblokken om te worden en hoog-productie miniturized.

Histochemical en moleculaire opsporingstechnieken kunnen op de dia's worden gebruikt TMA, en zo TMAs toestaan om krachtige hulpmiddelen te zijn om genuitdrukking te onderzoeken die in ziektestaten profileren over een verscheidenheid van patiënten en ziektevoorwaarden.

De Inhoud van Microarray van het weefsel

Inleiding TMA

Kenmerken van de Series van het Weefsel

De Synthese van Microarray van het weefsel

Toepassingen

Voordelen van TMAs

Soorten de Series van het Weefsel

De Software van de analyse

De Verwijzingen van de Spaander van het weefsel

Kenmerken van Weefsel Microarrays:

  • 50 - 500 weefsels of meer kunnen per diablok worden geanalyseerd
  • hoge productie
  • vrij lage kosten
  • kan met een verscheidenheid van vlekken zoals bevlekt H & E worden bevlekt
  • de dia's kunnen met een breed-verscheidenheid van technieken worden geanalyseerd
  • geautomatiseerde analyse en gegevensinzameling met vele technieken

 

De Synthese van Microarray van het weefsel:

Het weefsel Microarrays wordt geproduceerd gebruikend microtome die sectiesweefsel in 4 - 5 micrometerssecties (zie hierboven figuur 1). Deze boren de secties van de weefselbiopsie uit worden genomen uit specifieke aandachtsgebieden van paraffine-ingebedde weefselblokken.  Deze cynlindrical kernen van weefsel worden re-ingebed in opgestelde lege ontvankelijke blokken. Gebruikend deze methode, kunnen meer dan 500 weefselkernen op één enkele dia worden opgesteld! Het hoofdblok werd ontwikkeld door Konenen et al.

 

Toepassingen van Weefsel Microarrays:

  • Immunohistochemistry
  • Het bevlekken van: H & E, HC, ISH,
  • Kruising in situ
  • Fluorescente kruising in situ (VISSEN)
  • PCR in situ
  • RNA of de uitdrukkingsanalyse van DNA
  • Analyse TUNEL voor apoptosis
  • Morfologische en Klinische Karakterisering van Vele Geduldige Weefsels

tma

Voordelen van de Series van het Weefsel of de Spaanders van het Weefsel:

  • Experimentele uniformiteit
  • Staat versterking (en behoud) van schaarse weefselsteekproeven toe
  • Het bewaren van het analysevolume
  • Vermindert het aantal onderzochte dia's (de conventionele paraffine van het dia'sweefsel)
  • Hoog-productie
  • De analyse kan worden geautomatiseerd en de gegevens kunnen worden geautomatiseerd

 

Types van Weefsel Microarrays:

Cryo - Weefsel Microarrays: Cryo-TMAs gebruikt bevroren weefsels die in een optimale scherpe temperatuursamenstelling worden ingebed. Deze cryo-TMAs toe te schrijven aan hun het bevriezen is superieur aan formaline vaste weefsels voor RNA en eiwitanalyse. Ook, werken de antilichamen veel betterl met bevroren weefsels.

Het Weefsel Microarrays van multi-tumors: de multi-tumor TMAs heeft vele verschillende types van weefsels die op de dia worden gericht. De techniek werd eerst gebruikt door Kononen et al., 1998. Kononen gebruikte dit type van TMA om 6 genversterking te ontdekken. p53 de uitdrukking werd ook onderzocht in het weefsel van borstkanker.

Het Weefsel Microarrays van de vooruitgang: Dit microarray type van weefsel onderzoekt verschillende stadia van tumor (of ziekte) vooruitgang binnen een bepaald orgaan. Bijvoorbeeld, onderzoek van tumors in de borst. Deze dia's kunnen dan voor tellers van belang worden geanalyseerd, of de biochemische analyse van de steekproeven kan worden gemaakt.

Het Weefsel Microarrays van de prognose: De steekproeven van de ziekte zoals tumorbiopsieën kunnen uit patiënten worden genomen en worden onderzocht. Deze steekproeven kunnen voor klinische follow-up worden gebruikt om de vooruitgang van de patiënt te controleren. Het gegeven wordt dan geanalyseerd en met andere klinische gegevens vergeleken.

 

De Software en de Bio-informatica van Microarray van het weefsel:

De Hulpmiddelen van de software voor de Analyse van de hoog-Productie van Weefsel Microarrays: Het Archiveren van het beeld en de Analyse van Gegevens

Bevat de volgende software:

TMA-Deconvoluter en Stainfinder. Deconvoluter zet ruwe noterende aantekenvellen van de 3-D lay-out van Microarray van het Weefsel in een 2-D getabelleerd lijstformaat geschikt om voor verdere gegevensanalyse.

De Analyse van de Gegevens van de Serie van het weefsel: Software aan het creëren van een interactief gegevensbestand voor beeld TMA het bekijken en gegevensinput.

TAD: De Software van het Gegevensbestand van de Serie van het weefsel voor Download.

TMAJ: reeks softwarehulpmiddelen die worden gebruikt om de gegevens en de informatie van het Weefsel te beheren van MicroArray (TMA).

De oorspronkelijke Documenten van de Verwijzing van Microarray van het Weefsel:

Battifora H: Blok het van het multitumor (worst) weefsel: nieuwe methode voor het immunohistochemical antilichaam testen. Het laboratorium investeert 1986, 55:244 - 248.

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Weefsel microarrays voor hoog-productie het moleculaire profileren van tumorspecimens. Nationaal Med 1998, 4:844 - 847.