Korte Oligonucleotide Series
Korte Oligonucleotide DNA Microarrays:
De korte Oligonucleotide series worden gecreÃërd gebruikend photolithographic synthese in situ
25 meroligos zijn chemisch samengesteld op glasplaatjes die photolithographic methodes gebruiken die oorspronkelijk door Affymetrix de weg worden bereid. De digitaal gecontroleerde micro-spiegels worden nu gebruikt in de photolithographic druktechniek.
De glasplaatjes zijn met een laag bedekt met synthetische linkers die photo-labile chemische groepen bevatten. De maskers worden gebruikt aan direct licht in vooraf bepaalde posities inzake de dia en dit verwijdert blootgestelde groepen. De onbeschermde groepen kunnen dan aan bi-functional deoxy-nucleotide trifosfaat worden gekoppeld dNTPs.
De nieuwe maskers zijn gebruikte directe koppeling bij andere plaatsen tot de gewenste opeenvolgingen en de lengten van oligos worden samengesteld.
Een spaander Affymetrix kan meer dan 500.000 25 mer oligo sondes hebben die op een 1.25x1.25cm dia worden opgesteld!
Overal van 10 tot 20 verschillende oligo sondes zijn samengesteld voor elk gen van ' te betegelen eind 3 van mRNA. Er zijn oligos die als perfecte gelijken (aangewezen PM), en wanverhoudingsparen samengesteld zijn (MM.).
Elk paar van MM. heeft een één-basis paarwanverhouding in het centrum van oligo, die een controle voor achtergrondruis toestaat en normalisatie van dwars-kruising toestaat.
Â
Problemen van Korte Oligonucleotide DNA Microarrays:
- Korte oligos hebben dwars-kruisingsproblemen
- Moet daarom vele oligo controles voor elk gendoel gebruiken
Â
Â
Â
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
