Microarray のタイプ及びインフォメーション

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ティッシュMicroarrays

ティッシュMicroarrays 導入:

ティッシュのmicroarrays (TMAs) が1 枚のスライドの多重個々のティッシュサンプルで遺伝子の表現を同時に分析するのに使用されている。TMAs はスライドの高密度で配列される供給のティッシュパラフィンブロックからのティッシュの小さい0.6 - 3.0 ミリメートルのコアで構成される。

microarray ティッシュ

技術の洞察力: ティッシュのmicroarray 技術イエナM Giltnane 及びデイヴィッドL Rimm の性質のの臨床練習のOncology (2004 年) 1 、104-111 biomarkers の識別

ティッシュMicroarrays はティッシュに慣習的な組織学的パラフィンブロックの従来の分析がminiturized 高スループットなるようにし。

Histochemical 及び分子検出の技術はTMA のスライドで使用することができこうしてTMAs が色々な患者および病気の状態を渡る病気の状態で側面図を描く遺伝子表現を検査する強力なツールであるようにする。

ティッシュのMicroarray の内容

TMA の紹介

ティッシュのアレイの特性

ティッシュのMicroarray の統合

アプリケーション

TMAs の利点

タイプのティッシュのアレイ

分析のソフトウェア

ティッシュチップ参照

ティッシュMicroarrays の特性:

 

ティッシュのMicroarray の統合:

ティッシュMicroarrays は4 - 5 マイクロメートルセクションにティッシュを区分するミクロトームを使用して作り出される(図1 を上見なさい) 。これらはパラフィン埋め込まれたティッシュのブロックからの特定の関心領域からティッシュのバイオプシーセクションの取られる芯を取る。  ティッシュのこれらのcynlindrical コアはに配列されたブランク感受性があるブロック再埋め込まれる。この方法を使用して、500 以上のティッシュのコアは単一のスライドで配列することができる! 母型はKonenen 等によって開発された。

 

ティッシュMicroarrays のアプリケーション:

tma

ティッシュのアレイまたはティッシュチップの利点:

 

タイプのティッシュMicroarrays:

Cryo - ティッシュMicroarrays: Cryo-TMAs は最適の切断温度の混合物で埋め込まれる凍結するティッシュを使用する。フリーズのためのこれらのcryo-TMAs はRNA 及び蛋白質の分析のためのホルマリン固定ティッシュより優秀である。また、抗体は凍結するティッシュが付いている多くのbetterl を働かせる。

マルチ腫瘍のティッシュMicroarrays : マルチ腫瘍TMAs に多くの異なったタイプのスライドで一直線に並ぶティッシュがある。技術はKononen 等1998 年によって最初に使用された。 6 つの遺伝子の拡大を検出するのにKononen はこのタイプのTMA を使用したp53 の表現がまた乳癌のティッシュで検査された。

進行のティッシュMicroarrays: microarray このタイプのティッシュはある特定の器官内の腫瘍(か病気) 進行の異なった段階を検査する。例えば、胸の腫瘍の検査。これらのスライドは興味のマーカーのためにそれから試金することができるまたはサンプルの生化学的な分析はすることができる。

予想のティッシュMicroarrays: 腫瘍のバイオプシーのような病気のサンプルは患者から取られ、検査することができる。患者の進行を監視するのに臨床フォローアップにこれらのサンプルが使用することができる。データは他の臨床データとそして分析され、比較される。

 

ティッシュのMicroarray のソフトウェア及びBioinformatics:

ティッシュMicroarrays の高スループット分析のためのソフトウエアツール: アーカイブし、データ解析画像

次のソフトウェアを含んでいる:

TMA-Deconvoluter 及びStainfinder 。deconvoluter はそれ以上のデータ解析のために適した第2 表にされたテーブルフォーマットに3-D ティッシュのMicroarray のレイアウトからの未加工記録のワークシートを変える。

ティッシュのアレイデータ解析 : TMA の画像の観覧及びデータ入力のための対話型のデータベースの作成へのソフトウェア。

TAD: ダウンロードのためのティッシュの アレイデータベースのソフトウェア。

TMAJ : ソフトウエアツールのセットはティッシュのMicroArray (TMA) データ及び情報を管理するのが常であった。

ティッシュのMicroarray の元の参照は壁紙を張る:

Battifora H: multitumor (ソーセージ) のティッシュのブロック: immunohistochemical 抗体のテストのための新しい方法。実験室は1986 年、55:244-248 を投資する。

Kononen J 、Bubendorf L 、Kallioniemi A 、Barlund M 、Schraml P 、Leighton S 、Torhorst J 、Mihatsch MJ 、Sauter G 、操作Kallioniemi: 腫瘍の標本の高スループット分子に側面図を描くことのためのティッシュのmicroarrays 。ネットワークアドレス交換のMed 1998 年、4:844-847 。