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ティッシュのマイクロアレイ
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ティッシュのマイクロアレイ

ティッシュのマイクロアレイ導入:

ティッシュのマイクロアレイ(TMAs)が1枚のスライドの多重個々の組織サンプルで遺伝子の表現を同時に分析するのに使用されている。 TMAsはスライドの高密度で配列される供給のティッシュパラフィンブロックからのティッシュの小さい0.6 - 3.0 mmのコアで構成される。

ティッシュのマイクロアレイ

技術の洞察力: ティッシュのマイクロアレイの技術イエナM GiltnaneおよびデイヴィッドL Rimmの性質の臨床方法の腫瘍学(2004年) 1、104-111のbiomarkersの識別

ティッシュのマイクロアレイはティッシュに慣習的な組織学的パラフィンブロックの従来の分析が高スループットminiturizedなるようにし。

Histochemicalおよび分子検出の技術はTMAのスライドで使用することができこうしてTMAsがいろいろな患者および病気の状態を渡る病気の状態で側面図を描く遺伝子発現を検査する強力なツールであるようにする。

ティッシュのマイクロアレイの内容

TMAの紹介

ティッシュのアレイの特性

ティッシュのマイクロアレイの統合

アプリケーション

TMAsの利点

タイプのティッシュのアレイ

分析ソフトウェア

ティッシュチップ参照

ティッシュのマイクロアレイの特性:

  • 50 - 500のティッシュはスライドのブロックごとにまたはもっと分析することができる
  • 高いスループット
  • 比較的低価格
  • 汚れるH及びEのようないろいろな汚れと汚れることができる
  • スライドは技術の広変化と分析することができる
  • 多くの技術の自動解析そしてデータ収集

 

ティッシュのマイクロアレイの統合:

ティッシュのマイクロアレイは4 - 5マイクロメートルセクションにティッシュを区分するミクロトームを使用して作り出される(上の図1を見なさい)。 これらはパラフィン埋め込まれたティッシュのブロックからの特定の関心領域からティッシュのバイオプシーセクションの取られる芯を取る。  ティッシュのこれらのcynlindricalコアはに配列されたブランク受信者のブロック再埋め込まれる。 この方法を使用して、500以上のティッシュのコアは単一のスライドで配列することができる! 母型はKonenenによって等開発された。

 

ティッシュのマイクロアレイのアプリケーション:

  • Immunohistochemistry
  • の汚損: H及びE、HC、ISH、
  • そのままの交配
  • 蛍光そのままの交配(魚)
  • そのままのPCR
  • RNAまたはDNAの表現の分析
  • apoptosisのためのTUNELの試金
  • 多くの忍耐強いティッシュの形態学上および臨床性格描写

tma

ティッシュのアレイまたはティッシュチップの利点:

  • 実験均等性
  • 乏しい組織サンプルの拡大(および保存を)許可する
  • 試金ボリュームを保存すること
  • 検査されるスライドの番号を減らす(慣習的なスライドのティッシュパラフィン)
  • 高スループット
  • 分析は自動化し、データはコンピュータ化することができる

 

タイプのティッシュのマイクロアレイ:

Cryo -ティッシュのマイクロアレイ: Cryo-TMAsは最適の切断温度の混合物で埋め込まれる凍結するティッシュを使用する。 フリーズによるこれらのcryo-TMAsはRNAおよび蛋白質の分析のためのホルマリンによって修復されるティッシュより優秀である。 また、抗体は凍結するティッシュが付いている多くのbetterlを働かせる。

マルチ腫瘍のティッシュのマイクロアレイ: マルチ腫瘍TMAsにスライドで一直線に並ぶ多くの異なったタイプのティッシュがある。 技術はKononenによって最初に、1998年等使用された。 Kononenは6つの遺伝子の拡大を検出するのにこのタイプのTMAを使用した。 p53表現はまた乳癌のティッシュで検査された。

進行のティッシュのマイクロアレイ: このタイプのティッシュのマイクロアレイはある特定の器官内の腫瘍(か病気)進行の異なった段階を検査する。 例えば、胸の腫瘍の検査。 これらのスライドは興味のマーカーのためにそれから試金することができるまたはサンプルの生化学的な分析はすることができる。

予想のティッシュのマイクロアレイ: 腫瘍のバイオプシーのような病気のサンプルは患者から取られ、検査することができる。 臨床フォローアップにこれらのサンプルが患者の進行を監視するのに使用することができる。 データは他の臨床データとそして分析され、比較される。

 

ティッシュのマイクロアレイのソフトウェアおよび生物情報学:

ティッシュのマイクロアレイの高スループット分析のためのソフトウエアツール: アーカイブし、データ解析画像

次のソフトウェアを含んでいる:

TMA-DeconvoluterおよびStainfinder。 deconvoluterはそれ以上のデータ解析のために適した第2表にされた表のフォーマットに3Dティッシュのマイクロアレイのレイアウトからの未加工記録のワークシートを変換する。

ティッシュのアレイデータ解析: TMAの画像の観覧およびデータ入力のための対話型のデータベースの作成へのソフトウェア。

TAD: ダウンロードのためのティッシュのアレイデータベースソフトウェア。

TMAJ: ティッシュのマイクロアレイ(TMA)データおよび情報を管理するのに使用されるソフトウエアツールのセット。

元のティッシュのマイクロアレイの参照は壁紙を張る:

Battifora H: multitumor (ソーセージ)のティッシュのブロック: immunohistochemical抗体のテストのための新しい方法。 実験室は1986年の55:244 - 248 --を投資する。

Kononen J、Bubendorf L、Kallioniemi A、Barlund M、Schraml P、Leighton S、Torhorst J、Mihatsch MJ、Sauter G、操作Kallioniemi: 腫瘍の標本の高スループット分子に側面図を描くことのためのティッシュのマイクロアレイ。 ネットワークアドレス交換Med 1998年の4:844 - 847。