Tessuto Microarrays
Tessuto Microarrays un'introduzione:
I microarrays del tessuto (TMAs) sono usati per analizzare simultaneamente l'espressione dei geni nei diversi campioni multipli del tessuto su uno scorrevole. TMAs si compone di piccoli nuclei di 0.6 - 3.0 millimetri del tessuto dai blocchetti erogatori della paraffina del tessuto che sono allineati ad un'alta densità su uno scorrevole.
Comprensione Di Tecnologia: identificazione dei biomarkers con tecnologia microarray Jena m. Giltnane e David L oncologia clinica di pratica della natura di Rimm (2004) 1, 104-111 del tessuto
Il tessuto Microarrays ha permesso che a tessuto l'analisi tradizionale dei blocchetti istologici convenzionali della paraffina diventasse miniturized ed alto-rendimento.
Le tecniche istochimiche e molecolari di rilevazione possono essere usate sugli scorrevoli di TMA e così che permettono che TMAs sia strumenti potenti per esaminare l'espressione del gene che profila nella malattia dichiara attraverso una varietà di pazienti e di stati di malattia.
Indice Di Microarray Del Tessuto
Caratteristiche degli allineamenti del tessuto
Sintesi Di Microarray Del Tessuto
Tipi di allineamenti del tessuto
Riferimenti Del Circuito integrato Del Tessuto
Caratteristiche del tessuto Microarrays:
- 50 - 500 tessuti o di più possono essere analizzati per il blocchetto dello scorrevole
- alto rendimento
- basso costo relativamente
- può essere macchiato con una varietà di macchie quali la H & la E macchiate
- gli scorrevoli possono essere analizzati con una largo-varietà di tecniche
- analisi e raccolta di dati automatizzate con molte tecniche
Sintesi Di Microarray Del Tessuto:
Il tessuto Microarrays è prodotto per mezzo di un microtome che seziona il tessuto nelle sezioni di 4 - 5 micrometri (si veda figura 1 qui sopra). Questi estraggono la parte centrale dalle sezioni di biopsia del tessuto sono presi dalle zone specifiche di interesse dai blocchetti paraffina-incastonati del tessuto. Questi nuclei cynlindrical del tessuto re-sono incastonati nell'blocchi recettivi in bianco allineati. Usando questo metodo, più di 500 nuclei del tessuto possono essere allineati su un singolo scorrevole! Il blocco matrice è stato sviluppato da Konenen ed altri.
Applicazioni del tessuto Microarrays:
- Immunohistochemistry
- Macchiatura di: H & E, HC, ISH,
- Ibridazione in situ
- Ibridazione in situ fluorescente (PESCE)
- PCR in situ
- Analisi di espressione del DNA o del RNA
- Analisi di TUNEL per il apoptosis
- Descrizione morfologica e clinica di molti tessuti pazienti
Vantaggi degli allineamenti del tessuto o dei circuiti integrati del tessuto:
- Uniformità sperimentale
- Permette l'amplificazione (e conservazione) dei campioni limitati del tessuto
- Salvare il volume di analisi
- Riduce il numero di scorrevoli esaminati (paraffina convenzionale del tessuto degli scorrevoli)
- Alto-rendimento
- L'analisi può essere automatizzata ed i dati possono essere automatizzati
Tipi di tessuti Microarrays:
Cryo - Tessuto Microarrays: Cryo-TMAs usa i tessuti frozen che sono incastonati in un residuo ottimale di temperatura di taglio. Questi cryo-TMAs dovuto il loro congelamento sono superiori ai tessuti fissi formalina per analisi della proteina e del RNA. Inoltre, gli anticorpi funzionano molto betterl con i tessuti frozen.
Tessuto Microarrays Dei Multi-tumori : il multi-tumore TMAs ha molti tipi differenti di tessuti stati allineati sullo scorrevole. La tecnica in primo luogo è stata usata da Kononen ed altri, 1998. Kononen ha usato questo tipo di TMA per rilevare 6 amplificazioni del gene l'espressione di p53 che egualmente è stata esaminata nel tessuto del cancro di seno.
Tessuto Microarrays Di Progressione: Questo tipo di tessuto microarray esamina le fasi differenti della progressione malattia o (del tumore) all'interno di dato organo. Per esempio, esame dei tumori nel seno. Questi scorrevoli possono allora analizzarsi per gli indicatori di interesse, o l'analisi biochimica dei campioni può essere fatta.
Tessuto Microarrays Di Prognosi: I campioni di malattia quali le biopsie del tumore possono essere prelevati dai pazienti ed essere esaminati. Questi campioni possono essere usati per gli aggiornamenti clinici per controllare la progressione del paziente. I dati allora sono analizzati e paragonati ad altri dati clinici.
Software e Bioinformatics di Microarray del tessuto:
Strumenti del software per analisi di Alto-Rendimento del tessuto Microarrays: Archiviatura di immagine ed analisi di dati
Contiene il seguente software:
TMA-Deconvoluter e Stainfinder. Il deconvoluter converte i fogli di lavoro notanti grezzi dalla disposizione di Microarray del tessuto 3-D in 2-D formato tabulato della tabella adatto ad ulteriore analisi di dati.
Analisi Di Dati Di Allineamento Del Tessuto : Software a creare una base di dati interattiva per l'osservazione di immagine di TMA e l'immissione dei dati.
TAD: Software della base di dati di allineamento del tessuto per il trasferimento dal sistema centrale verso i satelliti.
TMAJ : l'insieme degli strumenti del software ha usato gestire i dati e le informazioni di MicroArray del tessuto (TMA).
Carte Originali Da Riferimento Di Microarray Del Tessuto:
Battifora H: Il blocchetto del tessuto di multitumor (salsiccia): metodo del romanzo per la prova immunohistochemical dell'anticorpo. Il Laboratorio Investe 1986, 55:244-248.
Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M., Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Microarrays del tessuto per il delineamento molecolare di alto-rendimento degli esemplari del tumore. Med Nazionale 1998, 4:844-847.
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