Allineamenti Lunghi Del Oligonucleotide
DNA Lungo Microarrays Del Oligonucleotide:
Gli allineamenti lunghi del oligonucleotide sono creati usando il getto di inchiostro che stampa o stampa robot.
Le procedure sono usate per progettare i oligos lunghi dello stesso formato di intorno 60 nucleotidi (60-mers). Tuttavia, questi oligos più lunghi sono più difficili da selezionare poichè devono l'un l'altro avere poca omologia.
La stampa della pompa del getto di inchiostro produce gli allineamenti 60-mer. 100 goccioline del picoliter dei reagenti sono stampate su una superficie idrofoba che contiene i gruppi chimicamente attivi dell'OH del hyrdoxyl-. I monomeri del DNA del phosphoramidite nelle goccioline reagiscono con i gruppi dell'OH, con conseguente bonding covalente.
Lo scorrevole può allora essere ibridato con le sonde identificate del DNA. Simile ad altri microarrays del DNA, vi lavate dopo l'ibridazione, esplorazione ed analizzate i dati risultanti.
Le aziende producono regolarmente gli allineamenti lunghi del oligonucleotide con più notevolmente di 25.000 sonde differenti.
Differenze e vantaggi del DNA lungo Microarrays del oligonucleotide:
- i oligos lunghi possono distinguersi fra i mRNAs alternativamente impiombati (questo è abbastanza importante poichè la maggior parte dei geni hanno isoforms alternativi!)
- i oligos lunghi (60-mers) sono singolo incagliati che rende a DNA usuale i punti microarray di denaturazione inutili
- i oligos lunghi (60-mers) consentono la specificità migliore nell'ibridazione microarray del DNA
- Modificato Facilmente
- adattabile
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