Le informazioni su DNA Microarrays
DNA Microarrays, un'introduzione:
Introduzione a Microarrays
La disponibilità delle sequenze genomic intere da molti organismi (quale il progetto umano del genome) ha creato l'esigenza di alta analisi di rendimento dei modelli di espressione del gene.
I microarrays del DNA hanno rivoluzionato l'analisi funzionale e genomic.
Lo sviluppo del DNA Microarray:
Negli anni 80, le colonie batteriche sono state macchiate sulle membrane di nylon con differenti inserti genomic o DNAS
Gli anni 90 hanno provocato l'emersione dei metodi di macchia del getto di inchiostro che hanno permesso la sintesi in situ dei punti di oligo 60-mer sulle lastre di vetro.
Ulteriori microarrays sviluppati del DNA di Affymetrix che sono stati basati sui oligos ad alta densità 25-mer da DNA umano ordina.
Priorità bassa su DNA Microarrays
I locali di base del DNA microarray sono che i campioni o gli obiettivi del RNA sono sonde conosciute ibridate di DNAS/OLIGO sugli allineamenti.
Microarrays originalmente è stato destinato per misurare i livelli di espressione del gene di alcuni geni. Recentemente, i microarrays ad alta densità sono stati sviluppati che hanno permesso l'analisi globale dell'espressione del gene o del transcriptome. Questa analisi globale permette che si determini la funzione cellulare dei geni, la natura e la regolazione delle vie biochimiche ed i meccanismi regolatori a gioco durante i determinati stati o malattie di segnalazione.
Regolazione di trascrizione e di DNA Microarrays
Il progetto umano del genome ha permesso che una ricchezza ampia delle informazioni entrasse nelle nostre mani. Tuttavia, un problema enorme sta analizzando i nuovi geni e le funzioni regolarici presunte di questi geni. L'analisi microarray del DNA ha permesso questi geni recentemente annotati ed i geni del romanzo da esaminare. Le nuove vie regolarici possono essere esaminate usando i microarrays del DNA. Per esempio, il nuovo gene può essere un fattore di transcriptional. Microarrays può esaminare l'effetto che il gene ha sulle migliaia dei geni alla volta, in molti termini in un modo semplice e veloce.
Applicazioni di DNA Microarrays
I microarrays del DNA sono stati usati per esaminare i cambiamenti di espressione del gene sotto le malattie quale cancro. Il tumore che profila usando i microarrays del DNA permette l'analisi dello sviluppo e la progressione di tali malattie complesse.
Usando i microarrays del DNA, si può esaminare gli obiettivi per la scoperta della droga ed i biomarkers diagnostici e prognostici potenziali per molte malattie complesse.
I microarrays del DNA sono usati comunemente per rilevare i virus ed altri agenti patogeni dai campioni di anima e possono essere usati così come metodo di rilevazione dell'agente patogeno.
I microarrays del DNA più recentemente sono stati usati per identificare gli indicatori inheritable e quindi sono stati usati mentre uno strumento genotyping.
I circuiti integrati di SNP basati su tecnologia microarray del DNA hanno permesso l'alto delineamento di rendimento dei polimorfismi singoli del nucleotide usando un circuito integrato o allineano il metodo. Ciò ha permesso che i polimorfismi si analizzassero più rapidamente ed anche il loro relavence alla malattia fossero determinati facilmente.
Vantaggi di DNA Microarrays
I microarrays del DNA sono migliori di altri metodi di delineamento (quali i metodi SH e di PCR della SALVIA) in quanto sono:
- più facile usare
- è il alto-rendimento (può analizzare le migliaia dei geni o degli indicatori alla volta)
- generi i grandi importi dei dati in poco tempo
- non richieda ordinare su grande scala
- permetta la quantificazione delle migliaia dei geni da molti campioni
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