Microarray Types and Info माइक्रोएरे के प्रकार और जानकारी

Using Microarrays Microarrays का उपयोग

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Tissue Microarrays ऊतक Microarrays

Tissue Microarrays an Introduction : ऊतक Microarrays एक परिचय :

Tissue microarrays (TMAs) are used to analyze the expression of genes simultaneously in multiple individual tissue samples on one slide. ऊतक microarrays ( TMAs ) का विश्लेषण करने के लिए उपयोग किया जाता है जीन की अभिव्यक्ति का एक साथ कई व्यक्ति के ऊतकों के नमूनों में से एक स्लाइड पर हैं . TMAs are composed of small 0.6 - 3.0 mm cores of tissue from donor tissue paraffin blocks which are arrayed at a high density on a slide. TMAs हैं 0,6 के छोटे -- 3,0 मिमी कोर के ऊतकों से दाता ऊतक पैराफिन ब्लॉक हैं जो arrayed पर एक स्लाइड पर एक उच्च घनत्व है .

ऊतक माइक्रोएरे

Technology Insight: identification of biomarkers with tissue microarray technology Jena M Giltnane and David L Rimm Nature Clinical Practice Oncology (2004) 1, 104-111 प्रौद्योगिकी इनसाइट : पहचान के ऊतक biomarkers माइक्रोएरे के साथ प्रौद्योगिकी जेना Giltnane एम एल और दाऊद Rimm प्रकृति नैदानिक विधि का कैंसर विज्ञान ( 2004 ) 1 , 104-111

Tissue Microarrays have allowed tissue traditional analysis of conventional histologic paraffin blocks to become miniturized and high-throughput. ऊतक Microarrays ने पारंपरिक विश्लेषण के ऊतकों की अनुमति दी पारंपरिक histologic पैराफिन ब्लॉक बनने के लिए miniturized और उच्च throughput .

Histochemical and molecular detection techniques can be used on the TMA slides, and thus allow TMAs to be powerful tools to examine gene expression profiling in disease states across a variety of patients and disease conditions. Histochemical आणविक और पता लगाने की तकनीक का इस्तेमाल किया जा सकता है पर स्लाइड TMA , और इस तरह की अनुमति TMAs को शक्तिशाली उपकरण की जांच करने के लिए जीन की अभिव्यक्ति की रूपरेखा में भर राज्यों में विभिन्न प्रकार के रोग के रोगियों और बीमारियों की स्थिति है .

Tissue Microarray Contents ऊतक माइक्रोएरे अनुक्रमणिका

TMA Introduction TMA परिचय

Characteristics of Tissue Arrays ऊतक के लक्षण Arrays

Tissue Microarray Synthesis ऊतक माइक्रोएरे संश्लेषण

Applications अनुप्रयोग

Advantages of TMAs लाभ के TMAs

Types of Tissue Arrays Arrays प्रकार के ऊतक

Analysis Software सॉफ्टवेयर विश्लेषण

Tissue Chip References ऊतक चिप सन्दर्भों

Characteristics of Tissue Microarrays : ऊतक के लक्षण Microarrays :

Tissue Microarray Synthesis : ऊतक माइक्रोएरे संश्लेषण :

Tissue Microarrays are produced using a microtome which sections tissue into 4 - 5 micrometer sections (see figure 1 above). ऊतक Microarrays उत्पन्न होते हैं जो वर्गों का प्रयोग करते हुए एक सूक्ष्म तक्षणी ऊतक में 4 -- 5 सुक्ष्ममापी वर्गों ( देखें संख्या 1 से ऊपर है ) . These core tissue biopsy sections are taken from specific areas of interest from paraffin-embedded tissue blocks.  These cynlindrical cores of tissue are re-embedded into an arrayed blank recipient blocks. ये मूल ऊतक बायोप्सी हैं वर्गों से लिया विशिष्ट क्षेत्रों में रुचि से पैराफिन ब्लॉकों के ऊतक एम्बेडेड . cynlindrical ये कोर के ऊतक हैं फिर से एम्बेडेड प्राप्तकर्ता को खाली ब्लॉक में एक arrayed . Using this method, more than 500 tissue cores can be arrayed on a single slide! इस विधि का प्रयोग , 500 से अधिक ऊतक कोर किया जा सकता है arrayed स्लाइड पर एक ही है ! The master block was developed by Konenen et al. यह खंड मास्टर Konenen एट अल द्वारा विकसित किया गया था .

Applications of Tissue Microarrays : ऊतक के अनुप्रयोगों को Microarrays :

tma

Advantages of Tissue Arrays or Tissue Chips : लाभ के ऊतक Arrays या ऊतक चिप्स :

Types of Tissue Microarrays : ऊतक Microarrays के प्रकार :

Cryo - Tissue Microarrays : Cryo-TMAs uses frozen tissues which are embedded in an optimal cutting temperature compound. क्रायो -- ऊतक Microarrays : क्रायो - TMAs फ्रोजन ऊतकों का उपयोग करता है जो एक इष्टतम को काटने के तापमान में एम्बेडेड मिश्रित है . These cryo-TMAs due to their freezing are superior to formalin fixed tissues for RNA and protein analysis. ये क्रायो - TMAs की वजह से रोक रहे हैं उनके लिए श्रेष्ठ formalin ऊतकों के लिए निर्धारित की शाही सेना और प्रोटीन का विश्लेषण है . Also, antibodies work much betterl with frozen tissues. इसके अलावा , काम ज्यादा एंटीबॉडी betterl फ्रोजन ऊतकों के साथ .

Multi-tumours Tissue Microarrays : multi-tumour TMAs have many different types of tissues aligned on the slide. बहु ट्यूमर के ऊतक Microarrays : बहु अर्बुद TMAs बहुत से विभिन्न प्रकार के ऊतकों के अनुरूप पर स्लाइड . The technique was first used by Kononen et al., 1998. Kononen used this type of TMA to detect 6 gene amplifications. इस तकनीक का इस्तेमाल किया गया था Kononen द्वारा एट अल . , 1998 . Kononen का इस्तेमाल किया TMA का पता लगाने के लिए इस प्रकार के 6 जीन amplifications . p53 expression was also examined in breast cancer tissue. अभिव्यक्ति की भी जांच की गई थी p53 में स्तन कैंसर के ऊतक .

Progression Tissue Microarrays : This type of tissue microarray examines different stages of tumour (or disease) progression within a given organ. प्रगति ऊतक Microarrays : इस प्रकार के ऊतकों माइक्रोएरे जाँच के विभिन्न चरणों अर्बुद ( या रोग ) में प्रगति के भीतर किसी अंग है . For example, examination of tumours in the breast. उदाहरण के लिए , परीक्षा में ट्यूमर के स्तन . These slides can then be assayed for markers of interest, or biochemical analysis of the samples can be done. ये स्लाइड किया जा सकता है assayed मार्करों के लिए ब्याज , या जैव रासायनिक के नमूनों का विश्लेषण किया जा सकता है .

Prognosis Tissue Microarrays : Disease samples such as tumour biopsies can be taken from patients and examined. पूर्वानुमान ऊतक Microarrays : इस तरह के रोग के नमूने के रूप में ट्यूमर बायोप्सी से लिया जा सकता है और रोगियों की जांच की . These samples can be used for clinical follow-ups to monitor the patient's progression. इन नमूनों के लिए प्रयोग किया जा सकता है नैदानिक का पालन अप रोगी की प्रगति की निगरानी के लिए . Data is then analyzed and compared with other clinical data. डाटा विश्लेषण किया है और उसके बाद की तुलना में डाटा के साथ अन्य नैदानिक .

Tissue Microarray Software and Bioinformatics : सॉफ्टवेयर और ऊतक माइक्रोएरे Bioinformatics :

Software Tools for High-Throughput Analysis of Tissue Microarrays: Image Archiving and Data Analysis सॉफ्टवेयर उपकरण के लिए उच्च Throughput विश्लेषण के ऊतक Microarrays : छवि डेटा संग्रह और विश्लेषण

Contains the following software: सॉफ्टवेयर में निम्नलिखित हैं :

TMA-Deconvoluter and Stainfinder. TMA - Deconvoluter और Stainfinder . The deconvoluter converts raw scoring worksheets from the 3-D Tissue Microarray layout into a 2-D tabulated table format suitable for further data analysis. इस कच्ची deconvoluter धर्मान्तरित रन से 3 डी worksheets ऊतक माइक्रोएरे लेआउट में सारणीबद्ध तालिका D - 2 स्वरूप और डाटा विश्लेषण के लिए उपयुक्त है .

Tissue Array Data Analysis : Software to creating an interactive database for TMA image viewing and data input. ऊतक एरे डाटा विश्लेषण : सॉफ्टवेयर बनाने के लिए एक डेटाबेस TMA छवि को देखने के लिए और डेटा इनपुट .

TAD : Tissue Array Database Software for Download. TAD : ऊतक एरे डाटाबेस के लिए सॉफ्टवेयर डाउनलोड करें .

TMAJ : set of software tools used to manage Tissue MicroArray (TMA) data and information.. TMAJ : स्थापित सॉफ्टवेयर का प्रबंधन करने के लिए उपकरण का प्रयोग किया ऊतक माइक्रोएरे ( TMA ) डेटा और जानकारी ..

Original Tissue Microarray Reference Papers: मूल ऊतक माइक्रोएरे संदर्भ पत्र :

Battifora H: The multitumor (sausage) tissue block: novel method for immunohistochemical antibody testing. Battifora एच : multitumor ( लंगूचा ) ऊतक ब्लॉक : उपन्यास immunohistochemical एंटीबॉडी परीक्षण के लिए विधि है . Lab Invest 1986, 55:244-248. लैब निवेश 1986 , 55:244-248 .

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP: Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. जे Kononen , Bubendorf एल , एक Kallioniemi , Barlund एम , Schraml पी , लीगटन एस , जे Torhorst , Mihatsch MJ , Sauter जी , ओ पी Kallioniemi : ऊतक microarrays के लिए उच्च throughput आणविक की रूपरेखा में ट्यूमर के नमूनों . Nat Med 1998, 4:844-847. नेट सुरक्षा 1998 , 4:844-847 .