Short Oligonucleotide Arrays लघु Oligonucleotide Arrays
Short Oligonucleotide DNA Microarrays : लघु Oligonucleotide डीएनए Microarrays :
Short Oligonucleotide arrays are created using in-situ photolithographic synthesis छोटा बनाया का उपयोग कर रहे हैं Oligonucleotide arrays में स्वस्थानी photolithographic संश्लेषण
25-mer oligos are chemically synthesized onto glass slides using photolithographic methods pioneered originally by Affymetrix. Digitally controlled micro-mirrors are now used in the photolithographic printing technique. 25 रंगरूट हैं oligos रासायनिक संश्लेषित स्लाइड पर कांच के तरीकों का उपयोग करते हुए photolithographic आरयू मूल द्वारा Affymetrix . डिजिटल माइक्रो नियंत्रित कर रहे हैं दर्पण में photolithographic मुद्रण तकनीक का इस्तेमाल किया है .
Glass slides are coated with synthetic linkers which contain photo-labile chemical groups. Masks are used to direct light to pre-determined positions on the slide and this removes exposed groups. स्लाइड ग्लास के साथ सिंथेटिक linkers लेपित हैं जिसमें तस्वीर के अस्थायी रासायनिक समूह हैं . मास्क इस्तेमाल किया जाता है प्रकाश को सीधा करने के लिए पूर्व निर्धारित स्थान पर स्लाइड और इस समूह को हटा परिचित कराया . The unprotected groups can then be coupled with bi-functional deoxy-nucleotide triphosphates dNTPs. असुरक्षित किया जा सकता है समूहों के साथ द्विपक्षीय कार्यात्मक deoxy - nucleotide triphosphates dNTPs .
New masks are used in order to direct coupling at other sites until the desired sequences and lengths of oligos are synthesized. नई मास्क करने के लिए उपयोग किया जाता है पर अन्य साइटों तक प्रत्यक्ष युग्मन इच्छित लंबाई के दृश्य और oligos संश्लेषित हैं .
An Affymetrix chip can have over 500,000 25-mer oligo probes arrayed on a 1.25x1.25 cm slide! एक से अधिक हो सकती है Affymetrix चिप 500000 25 - रंगरूट oligo जांच arrayed स्लाइड पर एक 1.25x1.25 सेमी !
Anywhere from 10 to 20 different oligo probes are synthesized for each gene to tile from the 3' end of the mRNA. There are oligos that are synthesized as perfect matches (designated PM), and mis-match pairs (MM). 10 से 20 से कहीं अलग हैं संश्लेषित oligo जांच करने के लिए प्रत्येक जीन टाइल से 3 ' के अंत में mRNA . oligos हैं कि सटीक मैच के रूप में हैं संश्लेषित ( नामित प्रधानमंत्री ) , और गलत मैचों की जोड़ी ( एम एम ) .
Each MM pair has a one-base pair mismatch in the centre of the oligo, which allows a control for background noise and allows normalization of cross-hybridization. एम एम जोड़ी ने हर एक आधार बेमेल जोड़ी में केंद्र के oligo हैं , जिससे नियंत्रण के लिए एक सामान्य बनाने की अनुमति देता है और शोर पृष्ठभूमि के पार से संकरण .
Problems of Short Oligonucleotide DNA Microarrays: लघु Oligonucleotide समस्याओं के डीएनए Microarrays :
- Short oligos have cross-hybridization problems -- oligos शॉर्ट ने समस्याओं के पार से संकरण
- Must therefore use many oligo controls for each gene target -- का उपयोग करना चाहिए इसलिए कई oligo नियंत्रण के लिए प्रत्येक जीन लक्ष्य
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