Primer and Oligo Design Tools प्रथम Oligo डिजाइन और उपकरण
Primer Design Tools and Oligo Software : प्रथम डिजाइन Oligo सॉफ्टवेयर और उपकरण :
Software, programs, and online bioinformatic tools for the design of primers and oligonucleotides. सॉफ्टवेयर , कार्यक्रम , और ऑनलाइन bioinformatic उपकरणों के लिए प्रारंभिकी तथा डिजाइन के oligonucleotides .
We recommend the following: हमारा सुझाव है :
Array Designer Premier Biosoft International. डिज़ाइनर एरे प्रीमियर Biosoft अंतर्राष्ट्रीय है . Software which can design primers for DNA or oligo arrays. सॉफ्टवेयर है जो कर सकते हैं या डीएनए के लिए डिजाइन प्राइमरों oligo arrays .
Beacon Designer Premier Biosoft International. बीकन डिज़ाइनर प्रीमियर Biosoft अंतर्राष्ट्रीय है .
OligoArray2.1 OligoArray 2.0 and the new version 2.1 are free software packages that compute gene specific oligonucleotides for OligoArray2.1 OligoArray 2,0 के नए संस्करण और सॉफ्टवेयर संकुल 2,1 स्वतंत्र हैं कि जीन गणना के लिए विशिष्ट oligonucleotides
genome-scale oligonucleotide microarray construction. जीनोम oligonucleotide माइक्रोएरे पैमाने पर निर्माण . Reference [ PubMed ] Free संदर्भ [ PubMed ] मुक्त
Oligodb - Oligodb is a web-based program for the interactive design of DNA oligos for transcription profiling and hybridization of human genes. Oligodb -- Oligodb एक वेब आधारित कार्यक्रम के लिए डिजाइन के इंटरैक्टिव के लिए डीएनए oligos प्रतिलेखन और संकरण की रूपरेखा में मानव जीन है . The oligodb program determine oligos using human DNA-transcript data from ENSEMBL. oligodb निर्धारित कार्यक्रम के oligos डेटा का उपयोग करते हुए मानव डीएनए प्रतिलेख से ENSEMBL . Reference [ PubMed ][ pdf ] संदर्भ [ PubMed ] [ pdf ]
OligoPicker - OligoPicker can select up to five oligo probes for each of the DNA sequences you provide for microarray spotting. OligoPicker -- अप करने के लिए चुन सकते हैं OligoPicker पांच oligo की डीएनए जांच के लिए प्रत्येक दृश्यों के लिए आपके द्वारा प्रदान माइक्रोएरे spotting . Reference [ PubMed ] Free संदर्भ [ PubMed ] मुक्त
PrimerQuest Free PrimerQuest मुक्त
Genome-wide Automated Primer finder servers (GAP) Software which can design thousands of primer pairs to amplify a set of open reading frames (ORFs) covering a whole genome. Free स्वचालित खोजक में प्रथम जीनोम सर्वर ( जीएपी ) सॉफ्टवेयर डिज़ाइन कर सकते हैं जो हजारों की संख्या में प्रथम amplify जोड़ी को पढ़ने का एक सेट खुला फ़्रेम ( ORFs ) को कवर एक संपूर्ण जीनोम . मुक्त
Genome PRIDE GenomePRIDE is a primer design software tool that designs PCR primers or long oligos based on annotated sequences. जीनोम गर्व है GenomePRIDE प्रथम डिजाइन सॉफ़्टवेयर उपकरण है जो लंबे समय से डिजाइन या पीसीआर प्राइमरों oligos एनोटेट दृश्यों पर आधारित है .
GenomePRIDE has been used for the design of many DNA arrays/chips. Free GenomePRIDE इस्तेमाल किया गया है डीएनए के लिए भारत के कई arrays / चिप्स . मुक्त
Primer3 Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, Free Primer3 व्हाइटहेड संस्थान / एमआईटी के लिए जीनोम अनुसंधान केन्द्र , मुक्त
Primer Premier Premier Biosoft International. प्रीमियर प्रथम अंतर्राष्ट्रीय प्रीमियर Biosoft .
PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Using Gene Specific Fragments) is a computer program which you use selected gene-specific fragments and then it designs primer pairs for PCR amplifications. PRIMEGENS -- Primegens ( प्रथम डिजाइन जीन का प्रयोग विशिष्ट टुकड़ों ) एक कंप्यूटर प्रोग्राम का उपयोग करें जो आप जीन विशेष के टुकड़ों का चयन और तब यह जोड़ी के लिए डिजाइन प्रथम पीसीआर amplifications . Reference [ PubMed ] संदर्भ [ PubMed ]
ProbeWiz Server - The CBS ProbeWiz WWW server predicts optimal PCR primer pairs for generation of probes for cDNA arrays. ProbeWiz सर्वर -- CBS ProbeWiz वैब सर्वर भविष्यवाणी इष्टतम पीसीआर प्रथम पीढ़ी के जोड़े के लिए जांच के लिए सीडीएनए arrays . Reference [ PubMed ] संदर्भ [ PubMed ]
ProMide - ProMide is a collection of command-line tools for Probe selection and Microarray Design. Free ProMide -- ProMide का संग्रह है कमांड लाइन उपकरण चयन की जांच के लिए डिजाइन और माइक्रोएरे . मुक्त
Sarani - Sarani Gold (Genome Oligo Designer) is a software for automatic large-scale design of optimal oligonucleotide probes for microarray experiments. Sarani -- Sarani गोल्ड ( जीनोम Oligo डिज़ाइनर ) एक स्वत : सॉफ्टवेयर के लिए बड़े पैमाने पर जांच के लिए डिजाइन के इष्टतम oligonucleotide माइक्रोएरे का परीक्षण किया . Thousands of gene sequences can be analyzed together and best available oligonucleotide probes with uniform thermodynamic properties and minimal similarity to non-specific genes can be selected. हजारों जीन दृश्य का विश्लेषण किया जा सकता है और एक साथ उपलब्ध सर्वोत्तम oligonucleotide जांच के साथ एक समान गुण thermodynamic समानता और न्यूनतम करने के लिए गैर विशिष्ट जीन का चयन किया जा सकता है . Product of Strand Genomics . उत्पाद का किनारा जीनोमिक्स .
STACKdb - The STACKdb, Sequence Tag Alignment and Consensus Knowledgebase, is generated by processing EST and mRNA sequences obtained from Genbank through a pipeline consisting of masking, clustering, alignment and variation analysis steps. STACKdb -- STACKdb , संरेखण अनुक्रम टैग और नॉलेजबेस सहमति है , प्रसंस्करण द्वारा उत्पन्न ईएसटी mRNA दृश्य और एक पाइप लाइन के माध्यम से प्राप्त Genbank के masking , क्लस्टरिंग , संरेखण विभिन्नता और विश्लेषण कदम है . The STACKdb database is created using tools called "stackPACK". इस उपकरण का उपयोग कर बनाया है STACKdb डेटाबेस नाम से " stackPACK " . Also available through Electric Genetics . Free इसके अलावा के माध्यम से उपलब्ध इलेक्ट्रिक आनुवंशिकी . मुक्त
Visual OMP - Visual OMP picks primers and oligo probes which do not cross hybridize with each other and other targets. OMP दृश्य -- दृश्य OMP पकड़ता प्रारंभिकी तथा oligo जांच नहीं करते हैं जो एक दूसरे के साथ संकरण क्रॉस और अन्य लक्ष्य है . Uses the OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) engine, based on scientific research by nucleic acids thermodynamics expert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc . उपयोग की OMP ( Oligonucleotide मॉडलिंग प्लेटफॉर्म ) इंजन के आधार पर , वैज्ञानिक अनुसंधान के द्वारा nucleic एसिड ऊष्मा विशेषज्ञ डॉ. जॉन SantaLucia . डीएनए सॉफ़्टवेयर , इंक .
WebPrimer Free WebPrimer मुक्त
Xpression Primer Premier Biosoft International. Xpression प्रथम अंतर्राष्ट्रीय प्रीमियर Biosoft .
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