Long Oligonucleotide Arrays लंबी Oligonucleotide Arrays
Long Oligonucleotide DNA Microarrays : लंबी Oligonucleotide डीएनए Microarrays :
Long Oligonucleotide arrays are created using either ink-jet printing or robotic printing. लंबी Oligonucleotide बनाया arrays का उपयोग कर रहे हैं , या तो स्याही जेट मुद्रण या मुद्रण रोबोट .
Algorithms are used in order to design long oligos of the same size of around 60 nucleotides (60-mers). एल्गोरिदम डिजाइन करने के लिए उपयोग किया जाता है oligos की लंबे समय से एक ही आकार के लगभग 60 nucleotides ( 60 mers ) . However, these longer oligos are more difficult to pick as they need to have little homology to each other. लेकिन , अब इन oligos को चुन रहे हैं और अधिक कठिन करने की जरूरत है क्योंकि वे एक दूसरे के पास बहुत कम समरूपता है .
Ink-jet pump printing produces the 60-mer arrays. इंक जेट पम्प के मुद्रण के उत्पादन 60 रंगरूट arrays . 100 picoliter droplets of reagents are printed onto aa hydrophobic surface containing chemically active hyrdoxyl- OH groups. 100 picoliter अभिकर्मकों हैं बूंदों की मुद्रित सतह पर आ hydrophobic जिसमें रासायनिक hyrdoxyl सक्रिय गुटों के ओह . The phosphoramidite DNA monomers in the droplets react with the OH groups, resulting in covalent bonding. इस phosphoramidite डीएनए monomers में बूंदों के साथ प्रतिक्रिया ओह समूहों , जिसके परिणामस्वरूप covalent दोस्ती है .
The slide can then be hybridized with labeled cDNA probes. इस स्लाइड किया जा सकता है hybridized सीडीएनए जांच के साथ लेबल है . Similar to other DNA microarrays, you wash after hybridization, scan and analyze the resulting data. इसी प्रकार के अन्य डीएनए microarrays , आप संकरण धोने के बाद , स्कैन और डेटा का विश्लेषण के परिणामस्वरूप है .
Companies regularly produce Long oligonucleotide arrays with greater than 25,000 different probes. कंपनी नियमित रूप से लंबे समय उपज oligonucleotide arrays के साथ अलग अलग जांच 25000 से अधिक है .
Differences and Advantages of Long Oligonucleotide DNA Microarrays: और लंबे समय के अंतर का लाभ Oligonucleotide डीएनए Microarrays :
- Long oligos can distinguish between alternatively spliced mRNAs (this is quite important as most genes have alternative isoforms!) -- लंबी oligos वैकल्पिक रूप से spliced mRNAs के बीच भेद कर सकते हैं ( यह काफी महत्वपूर्ण है जीन के पास विकल्प के रूप में सबसे isoforms ! )
- Long oligos (60-mers) are single stranded which makes usual DNA microarray denaturation steps un-necessary -- लंबी oligos ( 60 mers ) एक असहाय हैं जिसके कारण आम डीएनए माइक्रोएरे विकृतीकरण गैर - आवश्यक कदम
- Long oligos (60-mers) permit better specificity in DNA microarray hybridization -- लंबी oligos ( 60 mers ) परमिट बेहतर विशिष्टता में डीएनए माइक्रोएरे संकरण
- Easily Modified -- आसानी से संशोधित
- Adaptable -- अनुकूलनीय
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