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Microarrays de tissu
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Microarrays de tissu

Microarrays de tissu une introduction :

Des microarrays de tissu (TMAs) sont employés pour analyser l'expression des gènes simultanément dans différents échantillons de tissu multiples sur une glissière. TMAs se composent de petits noyaux de 0.6 - 3.0 millimètres de tissu des blocs de distributeur de paraffine de tissu qui sont rangés à une densité sur une glissière.

microarray de tissu

Perspicacité de technologie : identification des biomarkers avec la technologie Iéna M Giltnane et David L oncologie clinique de pratique en matière de nature de Rimm (2004) 1, 104-111 de microarray de tissu

Les Microarrays de tissu ont permis tissu à l'analyse traditionnelle des blocs histologiques conventionnels de paraffine de devenir miniturized et haut-débit.

Des techniques histochimiques et moléculaires de détection peuvent être utilisées sur les glissières de TMA, et permettent ainsi à TMAs d'être les outils puissants pour examiner l'expression de gène profilant dans des états de la maladie à travers une série de patients et états de la maladie.

Contenu de Microarray de tissu

Introduction de TMA

Caractéristiques des alignements de tissu

Synthèse de Microarray de tissu

Applications

Avantages de TMAs

Types d'alignements de tissu

Logiciel d'analyse

Références de puce de tissu

Caractéristiques des Microarrays de tissu :

  • 50 - 500 tissus ou davantage peuvent être analysés par bloc de glissière
  • débit élevé
  • relativement coût bas
  • peut être souillé avec une série de taches telles que H et E souillés
  • des glissières peuvent être analysées avec une large-variété de techniques
  • analyse automatisée et collecte de données avec beaucoup de techniques

 

Synthèse de Microarray de tissu :

Des Microarrays de tissu sont produits utilisant un microtome qui sectionne le tissu dans des sections de 4 - 5 micromètres (voir le schéma 1 ci-dessus). Ceux-ci creusent des sections de biopsie de tissu sont pris des centres d'intérêt spécifiques des blocs paraffine-encastrés de tissu.  Ces noyaux cynlindrical de tissu re-sont encastrés dans les blocs réceptifs blanc rangés. Suivre cette méthode, plus de 500 noyaux de tissu peuvent être rangés sur une glissière simple ! Le bloc principal a été développé par Konenen et autres.

 

Applications des Microarrays de tissu :

  • Immunohistochemistry
  • Souillure de : H ET E, HC, ISH,
  • Hybridation in situ
  • Hybridation in situ fluorescente (POISSON)
  • ACP in situ
  • Analyse d'expression d'ARN ou d'ADN
  • Analyse de TUNEL pour l'apoptosis
  • Caractérisation morphologique et clinique de beaucoup de tissus patients

tma

Avantages des alignements de tissu ou des puces de tissu :

  • Uniformité expérimentale
  • Permet l'amplification (et l'économie) des échantillons de tissu rares
  • Épargne du volume d'analyse
  • Réduit le nombre de glissières examinées (la paraffine conventionnelle de tissu de glissières)
  • Haut-débit
  • L'analyse peut être automatisée et des données peuvent être informatisées

 

Types de Microarrays de tissu :

Cryo - Microarrays de tissu : Cryo-TMAs utilise les tissus figés qui sont encastrés dans un composé optimal de la température de découpage. Ces cryo-TMAs dus à leur congélation sont supérieurs aux tissus fixes par formaline pour l'analyse d'ARN et de protéine. En outre, les anticorps fonctionnent beaucoup de betterl avec les tissus figés.

Microarrays de tissu de Multi-tumeurs : la multi-tumeur TMAs ont beaucoup de différents types de tissus alignés sur la glissière. La technique a été la première fois employée par Kononen et autres, 1998. Kononen a employé ce type de TMA pour détecter 6 amplifications de gène. l'expression p53 a été également examinée dans le tissu de cancer du sein.

Microarrays de tissu de progression : Ce type de microarray de tissu examine différentes étapes de progression de tumeur (ou maladie) dans un organe donné. Par exemple, examen des tumeurs dans le sein. On peut alors analyser ces glissières pour des repères d'intérêt, ou l'analyse biochimique des échantillons peut être faite.

Microarrays de tissu de pronostic : Des échantillons de la maladie tels que des biopsies de tumeur peuvent être prélevés des patients et être examinés. Ces échantillons peuvent être employés pour que des suivis cliniques surveillent la progression du patient. Des données sont alors analysées et comparées à d'autres données cliniques.

 

Logiciel et bio-informatique de Microarray de tissu :

Outils logiciels pour l'analyse de Haut-Débit des Microarrays de tissu : Archivage d'image et analyse de données

Contient le logiciel suivant :

TMA-Deconvoluter et Stainfinder. Le deconvoluter convertit les tableaux de marquage crus de la disposition à trois dimensions de Microarray de tissu en 2-D format sous forme de tableaux de table approprié davantage à d'analyse de données.

Analyse de données d'alignement de tissu : Logiciel à créer une base de données interactive pour le visionnement d'image de TMA et l'entrée de données.

TAD : Logiciel de base de données d'alignement de tissu pour le téléchargement.

TMAJ : ensemble d'outils logiciels utilisés pour contrôler des données et l'information du MicroArray de tissu (TMA).

Papiers initiaux de référence de Microarray de tissu :

Battifora H : Le bloc de tissu de multitumor (saucisse) : méthode originale pour le test immunohistochemical d'anticorps. Le laboratoire investissent 1986, le 55:244 - 248.

Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP : Microarrays de tissu pour le profilage moléculaire de haut-débit des spécimens de tumeur. Med national 1998, 4:844 - 847.