Tissu Microarrays
Tissu Microarrays une introduction :
Des microarrays de tissu (TMAs) sont employés pour analyser l'expression des gènes simultanément dans différents échantillons multiples de tissu sur une glissière. TMAs se composent de petits noyaux de 0.6 - 3.0 millimètres de tissu des blocs de distributeur de paraffine de tissu qui sont rangés à une forte densité sur une glissière.
Perspicacité De Technologie : identification des biomarkers avec la technologie microarray Iéna M Giltnane et David L oncologie clinique de pratique en matière de nature de Rimm (2004) 1, 104-111 de tissu
Le tissu Microarrays ont permis tissu à l'analyse traditionnelle des blocs histologiques conventionnels de paraffine de devenir miniturized et haut-débit.
Des techniques histochimiques et moléculaires de détection peuvent être utilisées sur les glissières de TMA, et permettent ainsi à TMAs d'être les outils puissants pour examiner l'expression de gène profilant dans des états de la maladie à travers une variété de patients et d'états de la maladie.
Table des matières de Microarray de Tissu
Caractéristiques des alignements de tissu
Synthèse de Microarray de Tissu
Caractéristiques de tissu Microarrays :
- 50 - 500 tissus ou davantage peuvent être analysés par bloc de glissière
- débit élevé
- relativement à prix réduit
- peut être souillé avec une variété de taches telles que H et E souillés
- des glissières peuvent être analysées avec une large-variété de techniques
- collecte automatisée d'analyse et de données avec beaucoup de techniques
Synthèse de Microarray de Tissu :
Le tissu Microarrays sont produits à l'aide d'un microtome qui sectionne le tissu dans des sections de 4 - 5 micromètres (voir le schéma 1 ci-dessus). Celles-ci creusent des sections de biopsie de tissu sont prises des centres d'intérêt spécifiques des blocs paraffine-encastrés de tissu. Ces noyaux cynlindrical de tissu re-sont encastrés dans les blocs réceptifs blanc rangés. En utilisant cette méthode, plus de 500 noyaux de tissu peuvent être rangés sur une glissière simple ! Le bloc principal a été développé par Konenen et autres.
Applications de tissu Microarrays :
- Immunohistochemistry
- Souillure de : H et E, HC, ISH,
- Hybridation in situ
- Hybridation in situ fluorescente (POISSON)
- PCR in situ
- Analyse d'expression d'ARN ou d'ADN
- Analyse de TUNEL pour l'apoptosis
- Caractérisation morphologique et clinique de beaucoup de tissus patients
Avantages des alignements de tissu ou des puces de tissu :
- Uniformité expérimentale
- Permet l'amplification (et l'économie) des échantillons rares de tissu
- Sauvegarder le volume d'analyse
- Réduit le nombre de glissières examinées (paraffine conventionnelle de tissu de glissières)
- Haut-débit
- L'analyse peut être automatisée et des données peuvent être informatisées
Types de tissu Microarrays :
Cryo - Tissu Microarrays : Cryo-TMAs utilise les tissus figés qui sont encastrés dans un composé optimal de la température de découpage. Ces cryo-TMAs dus à leur congélation sont supérieurs aux tissus fixés par formaline pour l'analyse d'ARN et de protéine. En outre, les anticorps fonctionnent beaucoup de betterl avec les tissus figés.
Tissu Microarrays de Multi-tumeurs : la multi-tumeur TMAs ont beaucoup de différents types de tissus alignés sur la glissière. La technique a été employée la première fois par Kononen et autres, 1998. Kononen a employé ce type de TMA pour détecter 6 amplifications de gène que l'expression de p53 a été également examinée dans le tissu de cancer de sein.
Tissu Microarrays de Progression : Ce type de tissu microarray examine différentes étapes de progression de tumeur (ou maladie) dans un organe donné. Par exemple, examen des tumeurs dans le sein. On peut alors analyser ces glissières pour des repères d'intérêt, ou l'analyse biochimique des échantillons peut être faite.
Tissu Microarrays de Pronostic : Des échantillons de la maladie tels que des biopsies de tumeur peuvent être pris des patients et être examinés. Ces échantillons peuvent être employés pour des suivis cliniques pour surveiller la progression du patient. Des données sont alors analysées et comparées à d'autres données cliniques.
Logiciel et Bioinformatics de Microarray de tissu :
Outils de logiciel pour l'analyse de Haut-Débit du tissu Microarrays : Archivage d'image et analyse de données
Contient le logiciel suivant :
TMA-Deconvoluter et Stainfinder. Le deconvoluter convertit les tableaux de marquage crus de la disposition de Microarray du tissu 3-D en 2-D format sous forme de tableaux de table approprié davantage à d'analyse de données.
Analyse de Données d'Alignement de Tissu : Logiciel à créer une base de données interactive pour le visionnement d'image de TMA et l'entrée de données.
TAD : Logiciel de base de données d'alignement de tissu pour le téléchargement.
TMAJ : l'ensemble d'outils de logiciel contrôlait des données et l'information de MicroArray de tissu (TMA).
Papiers Initiaux de Référence de Microarray de Tissu :
Battifora H : Le bloc de tissu de multitumor (saucisse) : méthode de roman pour le test immunohistochemical d'anticorps. Le Laboratoire Investissent 1986, 55:244-248.
Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi OP : Microarrays de tissu pour le profilage moléculaire de haut-débit des spécimens de tumeur. Med National 1998, 4:844-847.
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