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Outils de conception et logiciel mieux habillés d'Oligo :

Logiciel, programmes, et outils bioinformatic en ligne pour la conception des amorces et des oligonucléotides.

Nous recommandons ce qui suit :

Premier ministre Biosoft International De Créateur d'Alignement. Logiciel qui peut concevoir des amorces pour des alignements d'ADN ou d'oligo.

Premier ministre Biosoft International De Créateur de Balise.

OligoArray2.1 OligoArray 2.0 et la nouvelle version 2.1 sont des progiciels libres pour lesquels calculez les oligonucléotides spécifiques de gène
     génome-mesurez la construction microarray d'oligonucléotide. Mettez en référence [PubMed] Libre

Oligodb - Oligodb est un programme Web-basé pour la conception interactive des oligos d'ADN pour le profilage de transcription et l'hybridation des gènes humains. Le programme d'oligodb déterminent des oligos en utilisant des données humaines d'ADN-TRANSCRIPTION à partir d'ENSEMBL. Mettez en référence [PubMed] [pdf]

OligoPicker - OligoPicker peut choisir jusqu'à cinq sondes d'oligo pour chacun des ordres d'ADN que vous fournissez pour repèrer microarray. Référence [PubMed] Libre

PrimerQuest Librement

le logiciel mieux habillé automatisé Génome-large de serveurs de détecteur (INTERVALLE ) qui peut concevoir des milliers de paires mieux habillées pour amplifier un ensemble de lecture ouverte encadre (ORFs) couvrir un génome entier. Libre

La FIERTÉ GenomePRIDE de génome est un outil mieux habillé de logiciel de conception qui conçoit des amorces de PCR ou de longs oligos basés sur des ordres annotés.
GenomePRIDE a été utilisé pour la conception des beaucoup d'ADN arrays/chips. Libre

Centre de Primer3 Whitehead Institute/MIT pour la recherche de génome, libre

Premier ministre Mieux habillé Premier ministre Biosoft International.

PRIMEGENS- Primegens (conception mieux habillée en utilisant les fragments spécifiques de gène) est un programme machine que vous utilisez les fragments gène-spécifiques choisis et il puis conçoit des paires mieux habillées pour des amplifications de PCR. Référence [PubMed]

Serveur de ProbeWiz - le serveur de CBS ProbeWiz WWW prévoit des paires optimales d'amorce de PCR pour la génération des sondes pour des alignements d'ADN. Référence [PubMed]

ProMide - ProMide est une collection de la commande-ligne outils pour la sélection de sonde et la conception de Microarray. Libre

Sarani - l'or de Sarani (créateur d'Oligo de génome) est un logiciel pour la conception de grande puissance automatique des sondes optimales d'oligonucléotide pour des expériences microarray. Des milliers d'ordres de gène peuvent être analysés ensemble et les meilleures sondes disponibles d'oligonucléotide avec les propriétés thermo-dynamiques uniformes et la similitude minimale aux gènes non spécifiques peuvent être choisies. Produit de Génomique de brin.

STACKdb - Le STACKdb, le cadrage et le consensus Knowledgebase d'étiquette d'ordre, est produit par des ordres de traitement d'est et de mRNA obtenus à partir de Genbank par des étapes d'analyse de masquer se composant, grouper, de cadrage et de variation de canalisation. La base de données de STACKdb est utilisation créée usine "stackPACK" appelé. La génétique électrique traversante en outre disponible. Libre

OMP visuels - OMP visuel sélectionne des amorces et les sondes d'oligo qui ne croisent pas hybrident avec l'un l'autre et d'autres cibles. Utilise le moteur d'OMP (oligonucléotide modelant la plateforme), basé sur la recherche scientifique par l'expert en matière de thermodynamique d'acides nucléiques, Dr. John SantaLucia.  Logiciel d'ADN, Inc..

WebPrimer Librement

Premier ministre Biosoft International d'Amorce de Xpression.