Longs Alignements d'Oligonucléotide
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Longue ADN Microarrays d'Oligonucléotide :
De longs alignements d'oligonucléotide sont créés en utilisant ink-voyager en jet imprimant ou impression robotique.
Des algorithmes sont employés afin de concevoir de longs oligos de la même taille d'environ 60 nucléotides (60-mers). Cependant, il est plus difficile sélectionner ces plus longs oligos car ils doivent avoir peu d'homologie entre eux.
L'impression de pompe d'Ink-voyager en jet produit les alignements 60-mer. 100 gouttelettes de picoliter des réactifs sont imprimées sur une surface hydrophobe contenant les groupes chimiquement actifs de l'OH de hyrdoxyl-. Les monomères d'ADN de phosphoramidite dans les gouttelettes réagissent avec les groupes de l'OH, ayant pour résultat la liaison covalente.
La glissière peut alors être hybridée avec les sondes étiquetées d'ADN. Semblable à d'autres microarrays d'ADN, vous lavez après hybridation, balayage et analysez les données résultantes.
Les compagnies produisent régulièrement de longs alignements d'oligonucléotide avec les 25.000 sondes différentes plus grandes que.
Différences et avantages de longue ADN Microarrays d'oligonucléotide :
- les longs oligos peuvent distinguer les mRNAs alternativement épissés (c'est tout à fait important car la plupart des gènes ont les isoforms alternatifs !)
- les longs oligos (60-mers) sont célibataires échoués qui rend ADN habituelle des étapes microarray inutiles de dénaturation
- les longs oligos (60-mers) permettent une meilleure spécificité dans l'hybridation microarray d'ADN
- Facilement Modifié
- adaptable
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