L'information sur ADN Microarrays
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ADN Microarrays, une introduction :
Introduction à Microarrays
La disponibilité des ordres genomic entiers de beaucoup d'organizations (telles que le projet humain de génome) ont créé le besoin d'analyse élevée de débit des configurations d'expression de gène.
Les microarrays d'ADN ont révolutionné l'analyse fonctionnelle et genomic.
L'évolution de l'ADN Microarray :
Dans les années 80, des colonies bactériennes ont été repèrées sur les membranes en nylon avec différentes insertions genomic ou DNAS
Les années 90 ont eu comme conséquence l'apparition des méthodes repèrantes d'ink-voyager en jet qui ont permis la synthèse in situ des taches de l'oligo 60-mer sur des plaques en verre.
Les microarrays développés encore d'ADN d'Affymetrix qui ont été basés sur les oligos 25-mer à haute densité de l'ADN humaine ordonnance.
Fond sur ADN Microarrays
Les lieux de base de l'ADN microarray sont que les échantillons ou les cibles d'ARN sont les sondes connues hybridées de DNAS/OLIGO sur les alignements.
Microarrays ont été initialement conçus pour mesurer des niveaux d'expression de gène de quelques gènes. Récemment, on a développé des microarrays à haute densité qui ont permis l'analyse globale de l'expression de gène ou du transcriptome. Cette analyse globale permet à on de déterminer la fonction cellulaire des gènes, la nature et le règlement des voies biochimiques, et les mécanismes de normalisation au jeu pendant de certains états ou maladies de signalisation.
Règlement de transcription et d'ADN Microarrays
Le projet humain de génome a permis à une vaste richesse d'information d'hériter nos mains. Cependant, un problème énorme analyse les nouveaux gènes et les fonctions de normalisation putatives de ces gènes. L'analyse microarray d'ADN a permis ces gènes nouvellement annotés et gènes de roman à examiner. De nouvelles voies de normalisation peuvent être examinées en utilisant des microarrays d'ADN. Par exemple, le nouveau gène peut être un facteur de transcriptional. Microarrays peut examiner l'effet que le gène a sur des milliers de gènes à la fois, dans beaucoup de conditions d'une façon simple et rapide.
Applications d'ADN Microarrays
Des microarrays d'ADN ont été employés pour examiner les changements d'expression de gène sous les maladies telles que le cancer. La tumeur profilant en utilisant des microarrays d'ADN permet l'analyse du développement et la progression de telles maladies complexes.
En utilisant des microarrays d'ADN, on peut examiner des cibles pour la découverte de drogue et des biomarkers diagnostiques et pronostiques potentiels pour beaucoup de maladies complexes.
Des microarrays d'ADN sont employés généralement pour détecter des virus et d'autres microbes pathogènes des échantillons de sang et peuvent être utilisés ainsi comme méthode de détection de microbe pathogène.
Des microarrays d'ADN plus récemment ont été employés pour identifier les repères dont on peut hériter, et donc ont été utilisés pendant qu'un outil genotyping.
Les puces de SNP basées sur la technologie microarray d'ADN ont permis le profilage élevé de débit des polymorphismes simples de nucléotide en utilisant une puce ou rangent l'approche. Ceci a permis à des polymorphismes d'être analysés plus rapidement et également leur relavence à la maladie de déterminer facilement.
Avantages d'ADN Microarrays
Les microarrays d'ADN sont meilleurs que d'autres méthodes de profilage (telles que les méthodes de SAUGE, SH, de PCR) du fait elles sont :
- plus facile à utiliser
- sont le haut-débit (peut analyser des milliers de gènes ou de repères à la fois)
- produisez des grandes quantités de données dans peu d'heure
- n'exigez pas l'ordonnancement de grande puissance
- permettez la quantitation des milliers de gènes de beaucoup d'échantillons
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