Types de Microarray et information

Utilisation de Microarrays

menu

Protocole d'ADN Microarray

protocoles
bioinformatics microarray de puces
apprenez
constructeurs
discussion de forum d'alignement

Protocoles d'ADN Microarray

 

ADN Microarray Bioinformatics

Renseignez-vous sur des puces d'ADN

Constructeurs et produits d'ADN Microarray

Forum d'Alignement d'ADN

Nouvelles d'ADN Microarray

Protocole de base d'ADN Microarray :

 

Les étapes dans une expérience de Microarray :

1. Obtenez La Puce d'ADN Microarray  

Actuel, plus de 50.000 ADN des sondes peuvent être repèrées sur une glissière de 25X75mm par l'impression robotique. Il est ainsi possible de ranger le compliment humain entier de génome en utilisant cette approche à haute densité d'alignement (par exemple alignements d'Affymetrix).

Des milliers de taches distinctes d'oligos ou de DNAS connus sont imprimés sur des plateformes de matrice situées sur le silicium, les feuilles en nylon, ou les plaques en verre.

2. Étiqueter Cy3 et Cy5 des spécimens d'ARN en utilisant (RT-PCR) la synthèse d'ADN

L'ARN de 2 spécimens ou plus sont comparés.  L'ARN de chaque spécimen est renversé transcrit en utilisant RT-PCR à ADN (ADN complémentaire). L'ADN est étiquetée avec deux colorants fluorescents différents qui sont colorés différemment (rouge et vert), avec Cy3 et Cy5.

3. Hybridation des sondes d'ADN à l'alignement d'ADN

Les sondes d'ADN sont hybridées à l'ADN microarray. L'alignement d'ADN est alors lavé.

4. Détection de signal d'hybridation

Des signaux fluorescents d'hybridation sont balayés et détectés à l'aide des dispositifs confocal de laser. Les données sont filtré et traité.

5. Analyse de Données d'ADN Microarray

L'analyse de données est conduite en utilisant les outils d'ADN Microarray et/ou le logiciel bioinformatic de traitement d'image.

Les intesities de signal des taches sont corrélés avec les concentrations des échantillons de mRNA de cible. L'exploitation de données est également conduite en utilisant des programmes et des algorithmes statistiques pour déterminer si le gène d'intérêt vers le haut-est réglé, vers le bas-réglé, ou sans changement.

Des données sont alors organisées en utilisant une base de données. L'annotation de gène peut être alors exécutée sur les données, avec VONT analyse (d'ontology de gène), groupant l'analyse (qui les gènes semblables et les voies de groupes ensemble), et l'analyse des voies et les réseaux des gènes.