Protein Microarrays Proteiini microarray
Visit Molecular Station for a great article on Antibody and Protein Microarrays Käy Molecular Station for suuri artikkeli Antibody ja proteiinin microarray
Protein Chips: Proteiini Chips:
Protein Microarrays can be based on any ligand-binding assay that relies on the formation of product with an immobilized capture molecule and a target molecule present in the solution. Proteiini microarray voidaan perustu mihinkään ligandi-sitovia assay, että vetoaa muodostumista tuotteen kanssa seisonta-capture-molekyylin ja tavoite molekyylin läsnä ratkaisua. These assays can be miniturized and placed on a protein microarray chip. Nämä määritykset voidaan miniturized ja saatetaan proteiini microarray sirulle.
Protein microarrays are now becoming very popular due to their possible future applications in the study of nucleic acid-protein, protein-protein, ligand-receptor, drug-protein target, and enzyme-substrate interactions. Proteiini microarray on nyt tulossa hyvin suosittu, mikä johtuu niiden mahdollisten tulevien sovellusten tutkimus nukleiinihappo-proteiinia, proteiini-proteiini ligandi-reseptori, huumeiden-proteiini tavoite, ja entsyymi-substraatti vuorovaikutus.
Types of Capture Molecules for Protein Microarray Chips. Laji Capture molekyylejä Proteiini Microarray Chips. To analyze protein interactions with other molecules, protein microarrays can have various types of molecules immobilized on the slide surface to act as capture molecules in the protein microarray assay. Tutki proteiinien vuorovaikutus muiden molekyylien, proteiinien microarray voi olla erilaisia molekyylejä seisonta-dia-ala toimimaan pyydystäminen molekyylien valkuaispitoisuuden microarray assay.
Figure 1 Illustrates the most common protein array, the antibody microarray. Kuvio 1 osoittaa, yleisin proteiini jono, vasta microarray. Antibodies are spotted onto a glass slide. Vasta-aineita ovat laikullinen onto lasi-levyltä. Two cell lysates with proteins labeled with Cy3 and Cy5 (for example, cancer vs normal) are added as a solution onto the protein array. Kaksi cell lysates proteiinin merkintä Cy3 ja Cy5 (esimerkiksi syöpä vs normaali) on lisätty, sillä ratkaisu siirtyy proteiini jono. Signals are detected from the two different signals. Signaalit ovat havainneet, että kaksi eri signaaleja. Data is computed allowing an analysis of how much dye-labeled protein the antibodies on each spot are binding. Tiedot on laskettu sallimalla analyysi siitä, kuinka paljon väri-merkkisissä proteiini, vasta-aineita kullakin paikalla ovat sitovia. This information allows one to determine whether the protein expression is up-regulated in cancer, down-regulated or unchanged. Tämän tiedon avulla, joka määrittää, onko proteiinien ilmentyminen up-säännelty syöpä, alas-säännellään tai muuttumattomana.
Figure 2. Kuvio 2. a) Demonstrates protein arrays which are based on microarray analysis of antigen-antibody interactions. a) osoittaa, proteiini järjestelmät, jotka perustuvat microarray analyysi antigeeni-vasta-aineiden välisestä vuorovaikutuksesta. Antigens are spotted onto glass slides. Antigeenit ovat laikullinen onto lasi dioja. Antibodies which are tagged bind to antigens and emit fluorescent signal (shown as the yellow star) which can then be detected from the spot on the array. Vasta-aineita, jotka on koodattu sitoutuvan antigeenien ja päästää fluoresoiva signaali (näytetään keltainen star), joka voidaan sitten havaita, että paikalla, jono.
b) Shows a protein microarray composed of spots which act as sandwich immunoassays. b) osoittaa proteiini microarray koostuu spotit, jotka toimivat sandwich immunoassays. Antibodies are spotted onto the chips and cell lysate or a solution is applied to the slide. Vasta-aineita ovat laikullinen onto pelimerkit ja solujen lysate tai ratkaisu on soveltaa levyltä. Antibodies are incubated with the solution, with later washing to remove non-specific binding. Vasta-aineita ovat inkuboidaan ratkaisu, myöhemmin pesu poistaa ei-sitovia. The sandwich complexes formed emit a detectable signal from the spot. Sandwich komplekseja muodostettu päästää havaittavan signaalin paikan päällä.
c) A protein-protein interaction protein microarray where proteins are spotted onto a protein chip, and labeled proteins are added to the chip and incubated to determine where they may bind and interact. c) A-proteiini-proteiini vuorovaikutus proteiini microarray proteiineja ovat laikullinen onto proteiini siru, ja otsikoitu proteiinit on lisätty sirulle ja inkuboidaan määrittämiseksi, joissa ne voivat sitoa ja vuorovaikutuksessa. A detectable signal is emitted from binding spots. A havaittavissa signaali on päästä sitovia sijoittelussa.
d) Nucleic Acid-protein interaction array, (here a DNA-protein interaction chip). d) nukleiinihappo-proteiinien vuorovaikutus jono, (tässä DNA-proteiinia vuorovaikutus chip). Nucleic acids such as DNA are spotted onto a glass slide. Nukleiinihapot kuten DNA ovat laikullinen onto lasi-levyltä. This could be transcriptional binding sites for example. Proteins such as fluorescently labeled DNA-binding transcription factors in solution are added to the chip and incubated on the array. Tämä voisi olla transcriptional sitovia sivustoja esimerkiksi. Proteiinit kuten fluorescently nimeltä DNA-sitovia transkriptio tekijöiden ratkaisu on lisätty sirulle ja inkuboidaan-jono. A detectable signal is emitted from the DNA spots where the proteins bind. A havaittavissa signaali on päästä DNA-spotit, joissa proteiinien sitovasti.
e) If you have a set of ligands and you want to find the receptors the bind to, you can use a receptor-ligand protein chip as displayed. Receptor proteins are spotted on glass slides. e) Jos sinulla on joukko ligands ja haluat löytää reseptoreja on sitovasti, voit käyttää reseptori-ligandi proteiini siru kuten näytetään. reseptori proteiinit ovat laikullinen lasi-dioja. Fluorescently labeled ligands are added to the chip. Fluorescently nimeltä ligands on lisätty sirulle. Binding of ligand to receptors causes the emission of a detectable signal which pinpoints the interacting spots (ie which protein did the ligand bind to). Sitovat-ligandi-reseptoreihin aiheuttaa päästöjen havaittavan signaalin, joka osoittaa, että interaktio spots (eli proteiini eivät ligandi sitoutuvan).
f) To test for enzyme-subrates specificity one can employ an enzyme-substrate protein microarray. f) testi-entsyymi-subrates spesifisyys voidaan palkata entsyymi-substraatti proteiini microarray. This chip is composed of descrete nano-wells in which enzymes are bound. Tämä siru koostuu descrete nano-kaivot, joissa entsyymit ovat sidottuja. Substrate is added into the nano-wells and signal emission is detected from the nano-wells in order to assay for enzyme function. Substraatti on lisätty osaksi nano-kaivot ja signaalin päästöjen on havaittu, nano-kaivot, jotta Määritystä varten entsyymin tehtävä.
&nbs�ÊM:p> & nbsÊM: p>
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
