Primer and Oligo Design Tools Primer ja Oligo Design Tools
Primer Design Tools and Oligo Software : Primer Design Tools and Oligo Ohjelmistot:
Software, programs, and online bioinformatic tools for the design of primers and oligonucleotides. Software, ohjelmista ja online bioinformatiikan työkaluja suunnittelua alukkeiden ja oligonucleotides.
We recommend the following: Suosittelemme seuraavia:
Array Designer Premier Biosoft International. Array Suunnittelija Premier Biosoft International. Software which can design primers for DNA or oligo arrays. Ohjelmisto, joka voi suunnitella pohjamaaleina DNA: n tai oligo taulukot.
Beacon Designer Premier Biosoft International. Beacon Suunnittelija Premier Biosoft International.
OligoArray2.1 OligoArray 2.0 and the new version 2.1 are free software packages that compute gene specific oligonucleotides for OligoArray2.1 OligoArray 2,0 ja uusi versio 2,1 ovat ilmaisia ohjelmistopaketteja, että lasken-geenin tietyn oligonucleotides varten
genome-scale oligonucleotide microarray construction. genomin mittakaavassa oligonukleotidi microarray rakentamiseen. Reference [ PubMed ] Free Viite [PubMed] Ilmainen
Oligodb - Oligodb is a web-based program for the interactive design of DNA oligos for transcription profiling and hybridization of human genes. Oligodb - Oligodb on Web-pohjainen ohjelma, vuorovaikutteinen suunnittelu DNA oligos, kääntäminen profilointi ja hybridization ihmisten geeneistä. The oligodb program determine oligos using human DNA-transcript data from ENSEMBL. The oligodb ohjelma määrittää oligos käyttävien ihmisten DNA-transkriptio tiedot ENSEMBL. Reference [ PubMed ][ pdf ] Viite [PubMed] [PDF]
OligoPicker - OligoPicker can select up to five oligo probes for each of the DNA sequences you provide for microarray spotting. OligoPicker - OligoPicker voi valita enintään viisi oligo luotaimiin kunkin DNA-sekvenssien annat for microarray tarkkailutehtävistä. Reference [ PubMed ] Free Viite [PubMed] Ilmainen
PrimerQuest Free PrimerQuest Free
Genome-wide Automated Primer finder servers (GAP) Software which can design thousands of primer pairs to amplify a set of open reading frames (ORFs) covering a whole genome. Free Genome-laajuinen automatisoitu Primer finder palvelimet (GAP)-ohjelmisto, jonka voi suunnitella tuhansia alukkeet paria täydentää joukko avoimen käsittelyn kehyksiä (ORFs), jotka kattavat koko genomin. Ilmainen
Genome PRIDE GenomePRIDE is a primer design software tool that designs PCR primers or long oligos based on annotated sequences. Genome PRIDE GenomePRIDE on primeri suunnittelu-ohjelmiston työkalu, jonka mallit PCR-alukkeet tai pitkällä oligos perustuu selityksin sekvenssejä.
GenomePRIDE has been used for the design of many DNA arrays/chips. Free GenomePRIDE on käytetty suunnittelussa monia DNA-taulukot / pelimerkit. Ilmainen
Primer3 Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, Free Primer3 Whitehead Institute / MIT Center for Genome Research, Ilmainen
Primer Premier Premier Biosoft International. Primer Premier Premier Biosoft International.
PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Using Gene Specific Fragments) is a computer program which you use selected gene-specific fragments and then it designs primer pairs for PCR amplifications. PRIMEGENS - Primegens (Primer Design Using Gene Erityiset Fragments) on tietokoneohjelma, jonka voit käyttää valitun geeni-fragmentit ja sitten se suunnittelee alukkeet paria varten PCR amplifications. Reference [ PubMed ] Viite [PubMed]
ProbeWiz Server - The CBS ProbeWiz WWW server predicts optimal PCR primer pairs for generation of probes for cDNA arrays. ProbeWiz Server - CBS ProbeWiz WWW-palvelin ennustaa optimaalisen PCR aluketta kenkäpareina sukupolven anturit, cDNA taulukot. Reference [ PubMed ] Viite [PubMed]
ProMide - ProMide is a collection of command-line tools for Probe selection and Microarray Design. Free ProMide - ProMide on kokoelma command-line työkalut Probe valinta ja Microarray Design. Ilmainen
Sarani - Sarani Gold (Genome Oligo Designer) is a software for automatic large-scale design of optimal oligonucleotide probes for microarray experiments. Sarani - Sarani Gold (Genome Oligo Designer) on ohjelmisto automaattiseen laajamittaisen suunnittelun optimaalinen oligonukleotidi luotaimiin for microarray kokeiluja. Thousands of gene sequences can be analyzed together and best available oligonucleotide probes with uniform thermodynamic properties and minimal similarity to non-specific genes can be selected. Tuhannet geenin sekvenssejä voidaan analysoida yhdessä, ja parhaan käytettävissä olevan oligonukleotidi luotaimiin yhdenmukaiset termodynaamiset ominaisuudet ja vähäinen samankaltaisuus ei-erityisiä geenejä voidaan valita. Product of Strand Genomics . Tuote-Strand genomiikka.
STACKdb - The STACKdb, Sequence Tag Alignment and Consensus Knowledgebase, is generated by processing EST and mRNA sequences obtained from Genbank through a pipeline consisting of masking, clustering, alignment and variation analysis steps. STACKdb - STACKdb, Sequence Tag Kohdistusta ja konsensus Tietopankki on luotu käsittelemällä EST ja mRNA-sekvenssit saatu Genbank kautta putki koostuu peittää, klustereiden muodostamista, yhdenmukaistaminen ja vaihtelua analyysin vaiheet. The STACKdb database is created using tools called "stackPACK". The STACKdb tietokanta on luotu käyttämällä työkaluja kutsutaan "stackPACK". Also available through Electric Genetics . Free Lisäksi saatavilla Electric Genetics. Ilmainen
Visual OMP - Visual OMP picks primers and oligo probes which do not cross hybridize with each other and other targets. Visual OMP - Visual OMP kivihakut pohjamaalit ja oligo luotaimiin, jotka eivät rajat hybridize toistensa kanssa ja muut tavoitteet. Uses the OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) engine, based on scientific research by nucleic acids thermodynamics expert, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc . Käyttää OMP (Oligonucleotide Modeling Platform) moottori, joka perustuu tieteelliseen tutkimukseen nukleiinihapot thermodynamics asiantuntija, Dr. John SantaLucia. DNA Software, Inc.
Xpression Primer Premier Biosoft International. Xpression Primer Premier Biosoft International.
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
