Among 23 databases, 4 were evaluated precisely (BASE, GeneTraffic, MaxD, RAD ). Niistä 23 tietokannat, 4 arvioitiin tarkasti (Base, GeneTraffic, MaxD, RAD). Analysed according ot MGED standards. Analysoitiin mukaan ot MGED standardeja. Review. Tarkistaa. Transcriptome.ens.fr. Sophie Lemoine - [ Read more ] Sophie Lemoine - [Lue lisää]

Acuity 4.0 - Enterprise Microarray Informatics. ACUITY 4,0 - Enterprise Microarray Tietotekniikan. cross-platform support, data warehousing, and new enabling analysis and visualization tools. cross-platform tuki, tietojen varastointi-, ja uusia mahdollistaa analyysin ja visualisoinnin välineitä. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Agilent Data Analysis. Agilent Data Analysis. Software. ChIP Analytics Software • CGH Analytics Software • Feature Extraction Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring Workgroup • Rosetta Resolver® System - [ Read more ] Chip Analytics-ohjelmisto • CGH Analytics-ohjelmisto • Feature Extraction Software • GeneSpring GT • GeneSpring GX • GeneSpring Workgroup • Rosetta ratkaisija ® System - [Lue lisää]

The Automated Microarray Pipeline is a series of programs that allow the automated normalization and web publication of microarray data. Automated Microarray Pipeline on useita ohjelmia, jotka mahdollistavat automaattisen normalisointi ja Web-julkaisemisen microarray data. Data stored in a MADAM-compliant database, like that provided with MADAM, can be automatically downloaded, normalized - [ Read more ] Tiedot tallennetaan, madam-yhteensopiva tietokanta, kuin että annetaan rouva, voidaan ladata automaattisesti, normalisoitu - [Lue lisää]

Argus - a microarray database software system which functions to process, analyze, manage, and publish microarray data. Argus - microarray tietokantaohjelmistot järjestelmä, joka toimii käsitellä, analysoida, hallita ja julkaista microarray data. Comander et al. Commander et al. A new database system for web-based analysis of multiple microarray datasets. Uusi tietokanta käyttöön www-pohjainen analyysi useita microarray tietoaineistoihin. Genome Research 2001 11(9):1603-1610. Genome Research 2001 11 (9) :1603-1610. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Arrayplot allows for rapid graphical visalisuation and normalisation of microarray data. Arrayplot mahdollistaa nopean graafisen visalisuation ja normalisointi microarray data. Also provides a user-friendly interface to visualise data distribution and to view most variant genes. Tarjoaa myös käyttäjäystävällinen käyttöliittymä visualisoida tietojen jakelua ja katsella eniten variantin geenejä. Permits to calculate normalisation factor based on overall median intensity. Luvat voidaan laskea normalisointi tekijä, joka perustuu yleiseen mediaani intensiteetti. Arrayplot. Free software! Ilmainen ohjelmisto! - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Microarray Image Analysis Software. Microarray Image Analysis Software. A software package developed for the quantification of gene expression arrays. A-ohjelmistopaketti kehitetty kvantifiointi geenien ilmentyminen taulukot. AlphaInnotech - [ Read more ] AlphaInnotech - [Lue lisää]

Michael Eisen's software at Stanford - includes ScanAlyze, Cluster and TreeView. Michael Eisen-ohjelmisto Stanfordin - sisältää ScanAlyze, Cluster ja TreeView. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Doelan is an automated tool which checks the quality of produced DNA microarrays. Doelan on automaattinen työkalu, joka tarkistaa, että laatu on tuotettu DNA microarray. Software is based on the execution of TestSuites on quality control data to validate batches of chips. Ohjelmisto perustuu suorittamisesta TestSuites laadun valvonta tietojen validoida erissä pelimerkkejä. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Enterprise wide solution for automating and repeating tasks in data processing, analysis and interpretation from diverse data formats (all microarray formats, Mass Spectrometry, 2D Gel). Enterprise laajuinen ratkaisu automatisoimiseksi ja toistuvia tehtäviä, tietojenkäsittely, analysointi ja tulkinta eri tietojen esitystapoja (kaikki microarray muodoissa, massaspekrometria, 2D-GEL). - [ Read more ] -- [Lue lisää]

GenePix Pro 6.0 for Microarray Image Analysis for microarrays, tissue arrays and cell arrays. GenePix Pro 6,0 varten Microarray kuva-analyysi, microarray, kudoksen taulukot ja solujen taulukot. New spot-finding algorithms, full spot finding automation, Automatic balancing of PMT gain for all GenePix scanners, Batch Analysis tab for browsing and analyzing batches of images, Morphological background subtraction, support for opening and analyzing third-party images. Uusi paikalla tutustumis-algoritmeja, täydellinen paikalla löytää automaatio, automaattinen tasapainottaminen PMT saada kaikki GenePix skannerit, Batch Analysis-välilehti selailuun ja analysoimalla eriä kuvia, Morfologiset tausta subtraction, tukea avaamisesta ja analysoimalla kolmannen osapuolen kuvat. Molecular Devices. Molecular Devices. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

GeneTraffic Version 3.2. GeneTraffic Versio 3,2. Centralized data management for all microarray platforms, Powerful, easy-to-use microarray data analysis tools, Seamless Affymetrix™ integration and analysis (PLIER, GC-RMA, RMA), Rich MIAME-compliant experiment annotation. Keskitetty tietojen hallinta kaikissa microarray alustoille, Tehokas, helppokäyttöinen microarray data-analyysin työkaluja, saumattoman Affymetrix ™ yhdentymistä ja analyysi (plier, GC-RMA, RMA), Rich MIAME-yhteensopiva kokeilun annotation. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

GEPAS - Gene Expression Pattern Analysis Suite - [ Read more ] GEPAS - Gene Expression Pattern Analysis Suite - [Lue lisää]

The Microarray Data Manager, implemented in Java, facilitates the entry of data into a relational database. The Microarray Data Manager, toteutetaan Java, helpottaa pääsyä Euroopan tietoa relaatiotietokantaan. MADAM guides users through the microarray process from RNA procurement to data analysis, offering intelligent forms to simplify the tracking of exp - [ Read more ] Arvoisa oppaita käyttäjien kautta microarray prosessin RNA hankinnat data-analyysi, joka tarjoaa älykkäitä lomakkeita yksinkertaistaa seuranta exp - [Lue lisää]

MAGE Software Toolkit: MAGE-stk. UVIEN Software Toolkit: UVIEN-stk. MAGE Object Model. UVIEN Object Model. Sourceforge. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Micovito - Microarray Comparison Visualization Tool. Micovito - Microarray Vertailu visualisointi Tool. A tool enabling intuitive understanding of data as a first step into comparison of microarray experiments. Välineenä, jonka avulla intuitiivisen ymmärryksen tietojen ensimmäisenä askeleena vertailu microarray kokeiluja. Visualization of groups of genes whose expression profiles are similar in both microarray experiments, but also genes whose expression profiles are similar in one microarray experiment but not in the other. Visuaalisuus ryhmien geenejä, joiden ilmaisun profiilit ovat samankaltaisia molemmissa microarray kokeiluja, mutta myös geenejä, joiden ilmaisun profiilit ovat samankaltaisia yhden microarray kokeilu, mutta ei muita. Micovito - [ Read more ] Micovito - [Lue lisää]

Microarray Explorer (MAExplorer) is a Java-based data-mining facility for cDNA or oligonucleiotide microarray databases. Microarray Explorer (MAExplorer) on Java-pohjainen data-mining laitokseen cDNA-tai oligonucleiotide microarray tietokantoihin. MAExplorer - [ Read more ] MAExplorer - [Lue lisää]

TIGR?s Microarray Data Analysis System, a Java application, provides users an intuitive interface to design analysis protocols combining one or more normalization and filtering steps. TIGR? S Microarray Data Analysis System, Java-sovelluksen, tarjoaa käyttäjille intuitiivisen suunnitella analyysi pöytäkirjat yhdistetään yhden tai useamman normalisointi ja suodatuksen vaiheet. In this way, data from many individual hybridizations can be treated - [ Read more ] Tällä tavoin saadut tiedot monien yksittäisten hybridizations voidaan käsitellä - [Lue lisää]

PARTISAN arrayLIMS. Partisaani arrayLIMS. Clondiag chip technologies. Clondiag sirun teknologiaa. arrayLIMS is designed to manage all pertinent issues in the microarray life cycle, including array design, microarray production, biochemical reactions (hybridization), chip detection (image scanning/acquisition), data analysis and data mining. arrayLIMS tarkoituksena on hallita kaikkia olennaisia kysymyksiä, microarray elinkaaren aikana, mukaan lukien array suunnittelu, microarray tuotantoa, biokemialliset reaktiot (hybridization), siru havaitseminen (kuva skannaus / hankinta), data-analyysin ja tiedon louhinnan. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Rosetta Resolver System. Rosetta ratkaisija System. Includes the Rosetta Syllego system for the management of genetic data and analysis. Sisältää Rosetta Syllego järjestelmän hallinnointia varten geneettisiä tietoja ja analyyseja. For drug discovery - Determine and validate targets, Prioritize compounds, Pinpoint on- and off- target treatment effects, Determine underlying treatment mechanisms of action. Huumeiden discovery - Päätä ja validoida tavoitteet, tärkeysjärjestys yhdisteet, Tunnista-ja off-tavoitteen hoidon vaikutuksia, Päätä taustalla kohtelun mekanismien toimintaa. Rosetta Inpharmatics - [ Read more ] Rosetta Inpharmatics - [Lue lisää]

Signet Agilent. Signet Agilent. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Software Utilites for DNA Microarray. Software Utilites DNA Microarray. ExpressConverter and SlideMap. ExpressConverter ja SlideMap. - [ Read more ] -- [Lue lisää]

Normalized and filtered expression files can be analyzed using TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). Normalized ja suodatettu sananvapauden tiedostoja voidaan analysoida käyttäen TIGR Multiexperiment Viewer (MeV). MeV is a versatile microarray data analysis tool, incorporating sophisticated algorithms for clustering, visualization, classification, statistical analysis - [ Read more ] MeV on monipuolinen microarray analysointityökalu, joka sisältää monimutkaisia algoritmeja, klustereiden muodostamista, visualisointi-, luokittelu-, tilastollinen analyysi - [Lue lisää]

VARAN - a tool for analyzing variability amongst DNA microarrays experiments. VARAN - työkalu analysointiin vaihtelua keskenään DNA microarray kokeiluja. Published in Bioinformatics : http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [ Read more ] Julkaistu Bioinformatics: http://bioinformatics.oupjournals.org/cgi/content/abstract/bth117?ijkey=863IeHRtnwjmk&keytype=ref - [Lue lisää]

yMGV - Yeast Microarray Global Viewer - an on-line database, provides a synthetic view of the transcriptional expression profiles of yeast genes among most of the published expression datasets. yMGV - Hiiva Microarray Global Viewer - on-line-tietokantaan, tarjoaa synteettisen otetaan huomioon transcriptional ilmaisun profiileja hiivan geenien joukossa suurin osa julkaistaan sananvapauden tietoaineistoihin. yMGV - [ Read more ] yMGV - [Lue lisää]

yTAFNET is designed to help the characterization of connections between the different yeast regulatory networks. yTAFNET on suunniteltu auttamaan luonnehdinta yhteydet eri hiivaa sääntely-verkoissa. - [ Read more ] -- [Lue lisää]