
Long Oligonucleotide Arrays Long Oligonucleotide Järjestää
Long Oligonucleotide DNA Microarrays : Long Oligonucleotide DNA microarray:
Long Oligonucleotide arrays are created using either ink-jet printing or robotic printing. Long Oligonucleotide taulukot on luotu käyttämällä joko mustesuihkutulostus tai robotti tulostusta.
Algorithms are used in order to design long oligos of the same size of around 60 nucleotides (60-mers). Algoritmit on käytetty, jotta voidaan suunnitella pitkällä oligos, samankokoisia noin 60 nukleotidia (60-laisten). However, these longer oligos are more difficult to pick as they need to have little homology to each other. Kuitenkin nämä enää oligos on vaikeampi valita, koska he tarvitsevat vain vähän homology toisilleen.
Ink-jet pump printing produces the 60-mer arrays. Ink-Jet pumppu tulostus tuottaa 60-mer taulukot. 100 picoliter droplets of reagents are printed onto aa hydrophobic surface containing chemically active hyrdoxyl- OH groups. 100 picoliter pisaroiden reagenssien on painettu päälle aa hydrofobinen pinta sisältävät kemiallisesti aktiivisia hyrdoxyl-OH-ryhmiä. The phosphoramidite DNA monomers in the droplets react with the OH groups, resulting in covalent bonding. The phosphoramidite DNA monomeereista pisarat reagoida kanssa OH-ryhmiä, mikä covalent liimaus.
The slide can then be hybridized with labeled cDNA probes. Kuvan voi sitten olla hybridized kanssa merkityillä cDNA-luotaimiin. Similar to other DNA microarrays, you wash after hybridization, scan and analyze the resulting data. Muiden DNA microarray, voit pestä sen jälkeen, kun hybridization, skannata ja analysoida kerättyihin tietoihin.
Companies regularly produce Long oligonucleotide arrays with greater than 25,000 different probes. Yritykset säännöllisesti tuottaa Long oligonukleotidi taulukot enemmän kuin 25000 eri luotaimiin.
Differences and Advantages of Long Oligonucleotide DNA Microarrays: Erot ja edut Long Oligonucleotide DNA microarray:
- Long oligos can distinguish between alternatively spliced mRNAs (this is quite important as most genes have alternative isoforms!) -- Long oligos voidaan erottaa vaihtoehtoisesti spliced mRNAs (tämä on hyvin tärkeää, sillä useimmat geenit ovat vaihtoehtoisia isoentsyymien!)
- Long oligos (60-mers) are single stranded which makes usual DNA microarray denaturation steps un-necessary -- Long oligos (60-laisten) ovat ainoa stranded joka tekee tavallista DNA microarray denaturointi vaiheet un-tarpeen
- Long oligos (60-mers) permit better specificity in DNA microarray hybridization -- Long oligos (60-laisten) mahdollistaa paremmin erityisyyttä DNA microarray hybridization
- Easily Modified -- Helposti Muutettu
- Adaptable -- Adaptable