Tejido fino Microarrays
Tejido fino Microarrays una introducción:
Los microarrays del tejido fino (TMAs) se utilizan para analizar la expresión de genes simultáneamente en muestras individuales múltiples del tejido fino en una diapositiva. TMAs se compone de memorias pequeñas de 0.6 - 3.0 milímetros del tejido fino de los bloques dispensadores de aceite de la parafina del tejido fino que se ponen en orden en una alta densidad en una diapositiva.
Penetración De la Tecnología: identificación de biomarkers con la tecnología microarray Jena M Giltnane y David L oncología clínica de la práctica de la naturaleza de Rimm (2004) 1, 104-111 del tejido fino
El tejido fino Microarrays ha permitido que a tejido fino el análisis tradicional de los bloques histologic convencionales de la parafina se convierta miniturized y alto-rendimiento de procesamiento.
Las técnicas histoquímicas y moleculares de la detección se pueden utilizar en las diapositivas de TMA, y permiten así que TMAs sea herramientas de gran alcance para examinar la expresión del gene que perfila en estados de la enfermedad a través de una variedad de pacientes y de condiciones de la enfermedad.
Contenido De Microarray Del Tejido fino
Características de las matrices del tejido fino
Síntesis De Microarray Del Tejido fino
Tipos de matrices del tejido fino
Referencias De la Viruta Del Tejido fino
Características del tejido fino Microarrays:
- 50 - 500 tejidos finos o se pueden analizar más por bloque de la diapositiva
- alto rendimiento de procesamiento
- costo relativamente bajo
- puede ser manchado con una variedad de manchas tales como H y E manchados
- las diapositivas se pueden analizar con una ancho-variedad de técnicas
- colección automatizada del análisis y de datos con muchas técnicas
Síntesis De Microarray Del Tejido fino:
Se produce el tejido fino Microarrays usando un micrótomo que seccione el tejido fino en secciones de 4 - 5 micrómetros (véase el cuadro 1 arriba). Éstos quitan el corazón a secciones de la biopsia del tejido fino se toman de campos de interés específicos de bloques parafina-embutidos del tejido fino. Estas memorias cynlindrical del tejido fino re-se embuten en los bloques receptores en blanco puestos en orden. ¡Usando este método, más de 500 memorias del tejido fino se pueden poner en orden en una sola diapositiva! El bloque principal fue desarrollado por Konenen et el al.
Aplicaciones del tejido fino Microarrays:
- Immunohistochemistry
- El mancharse de: H Y E, HC, ISH,
- Hibridación in situ
- Hibridación in situ fluorescente (PESCADO)
- PCR in situ
- Análisis de la expresión del RNA o de la DNA
- Análisis de TUNEL para el apoptosis
- Caracterización morfológica y clínica de muchos tejidos finos pacientes
Ventajas de las matrices del tejido fino o de las virutas del tejido fino:
- Uniformidad experimental
- Permite la amplificación (y la conservación) de las muestras escasas del tejido fino
- Salvar el volumen del análisis
- Reduce el número de las diapositivas examinadas (parafina convencional del tejido fino de las diapositivas)
- Alto-rendimiento de procesamiento
- El análisis puede ser automatizado y los datos pueden ser automatizados
Tipos de tejido fino Microarrays:
Cryo - Tejido fino Microarrays: Cryo-TMAs utiliza los tejidos finos congelados que se embuten en un compuesto óptimo de la temperatura de corte. Estos cryo-TMAs debido a su congelar son superiores a los tejidos finos fijados formalina para el análisis del RNA y de la proteína. También, los anticuerpos trabajan mucho betterl con los tejidos finos congelados.
Tejido fino Microarrays De los Multi-tumores : el multi-tumor TMAs tiene muchos diversos tipos de tejidos finos alineados en la diapositiva. La técnica primero fue utilizada por Kononen et el al., 1998. Kononen utilizó este tipo de TMA para detectar 6 amplificaciones del gene que la expresión de p53 también fue examinada en tejido fino del cáncer de pecho.
Tejido fino Microarrays De la Progresión: Este tipo de tejido fino microarray examina diversas etapas de la progresión del tumor (o enfermedad) dentro de un órgano dado. Por ejemplo, examinación de tumores en el pecho. Estas diapositivas se pueden entonces probar para las etiquetas de plástico del interés, o el análisis bioquímico de las muestras puede ser hecho.
Tejido fino Microarrays Del Pronóstico: Las muestras de la enfermedad tales como biopsias del tumor pueden ser tomadas de pacientes y ser examinadas. Estas muestras se pueden utilizar para las cartas recordativas clínicas para vigilar la progresión del paciente. Los datos después se analizan y se comparan con otros datos clínicos.
Software y Bioinformatics de Microarray del tejido fino:
Herramientas del software para el análisis del Alto-Rendimiento de procesamiento del tejido fino Microarrays: El archivar de la imagen y análisis de datos
Contiene el software siguiente:
TMA-Deconvoluter y Stainfinder. El deconvoluter convierte las hojas de trabajo que anotan sin procesar de la disposición de Microarray del tejido fino 3-D en un 2.o formato tabulado del vector conveniente para el análisis de datos adicional.
Análisis De Datos Del Arsenal Del Tejido fino : Software a crear una base de datos interactiva para la visión de la imagen de TMA y la entrada de información de datos.
TAD: Software de la base de datos del arsenal del tejido fino para la transferencia directa.
TMAJ : el conjunto de herramientas del software manejaba los datos y la información de MicroArray del tejido fino (TMA).
Papeles Originales De la Referencia De Microarray Del Tejido fino:
Battifora H: El bloque del tejido fino del multitumor (salchicha): método de la novela para la prueba immunohistochemical del anticuerpo. El Laboratorio Invierte 1986, 55:244-248.
Kononen J, Bubendorf L, Kallioniemi A, Barlund M, Schraml P, Leighton S, Torhorst J, Mihatsch MJ, Sauter G, Kallioniemi DE OP. SYS.: Microarrays del tejido fino para perfilar molecular del alto-rendimiento de procesamiento de los especímenes del tumor. Med Nacional 1998, 4:844-847.
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