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Herramientas de diseño y software superelegantes de Oligo:

Software, programas, y herramientas bioinformatic en línea para el diseño de cartillas y de oligonucleotides.

Recomendamos el siguiente:

Primero ministro Biosoft International Del Diseñador Del Arsenal. Software que puede diseñar las cartillas para las matrices de la DNA o del oligo.

Primero ministro Biosoft International Del Diseñador Del Faro.

OligoArray2.1 OligoArray 2.0 y la nueva versión 2.1 son las paquetes de software libres para las cuales compute los oligonucleotides específicos del gene
     construcción microarray del oligonucleotide de genoma-scale. Referencia [PubMed] Libre

Oligodb - Oligodb es un programa Web-basado para el diseño interactivo de los oligos de la DNA para perfilar de la transcripción y el hibridación de genes humanos. El programa del oligodb determina oligos usando datos humanos de la DNA-TRANSCRIPCIO'N de ENSEMBL. Refiérase [PubMed] [pdf]

OligoPicker - OligoPicker puede seleccionar hasta cinco puntas de prueba del oligo para cada uno de las secuencias de la DNA que usted proporciona para manchar microarray. Referencia [PubMed] Libre

PrimerQuest Libremente

genoma-wide automatizó el software superelegante de los servidores del buscador (BOQUETE ) que puede diseñar millares de pares superelegantes para amplificar un conjunto de los bastidores abiertos de la lectura (ORFs) que cubren un genoma entero. Libre

El ORGULLO GenomePRIDE del genoma es una herramienta superelegante del software del diseño que diseña las cartillas de PCR o los oligos largos basados en secuencias anotadas.
GenomePRIDE se ha utilizado para el diseño de muchos la DNA arrays/chips. Libre

Centro de Primer3 Whitehead Institute/MIT para la investigación del Genoma, libre

Primero ministro Superelegante Primero ministro Biosoft International.

PRIMEGENS- Primegens (diseño superelegante usando fragmentos específicos del gene) es un programa de computadora que usted utiliza fragmentos gene-especi'ficos seleccionados y después él diseña pares superelegantes para las amplificaciones de PCR. Referencia [PubMed]

Servidor de ProbeWiz - el servidor del CBS ProbeWiz WWW predice los pares óptimos de la cartilla de PCR para la generación de las puntas de prueba para las matrices de la DNA. Referencia [PubMed]

ProMide - ProMide es una colección de la comando-li'nea herramientas para la selección de la punta de prueba y el diseño de Microarray. Libre

Sarani - el oro de Sarani (diseñador de Oligo del Genoma) es un software para el diseño en grande automático de las puntas de prueba óptimas del oligonucleotide para los experimentos microarray. Los millares de secuencias del gene pueden ser analizados juntas y las mejores puntas de prueba disponibles del oligonucleotide con las características termodinámicas uniformes y la semejanza mínima a los genes no específicos pueden ser seleccionadas. Producto del hilo Genomics.

STACKdb - el STACKdb, la alineación y el consenso Knowledgebase de la etiqueta de la secuencia, es generado por las secuencias de proceso del EST y del mRNA obtenidas de Genbank con pasos de progresión del análisis de la tubería de un enmascarado que consiste en, el arracimar, de la alineación y de la variación. La base de datos de STACKdb es el usar creado filetea "stackPACK llamado". Genética eléctrica directa también disponible. Libre

OMP visuales - OMP visual escoge las cartillas y las puntas de prueba del oligo que no se cruzan cruzan por hibridacio'n con uno a y otras blancos. Utiliza el motor de OMP (oligonucleotide que modela la plataforma), basado en la investigación científica por el experto de la termodinámica de los ácidos nucleic, el Dr. Juan SantaLucia.  Software de la DNA, Inc..

WebPrimer Libremente

Primero ministro Biosoft International De la Cartilla De Xpression.