Ιστός Microarrays
Ιστός Microarrays μια εισαγωγή:
Ο ιστός microarrays (TMAs) χρησιμοποιείται για να αναλύσει την έκφραση των γονιδίων ταυτόχρονα στα πολλαπλάσια μεμονωμένα δείγματα ιστού σε μια φωτογραφική διαφάνεια. Τα TMAs αποτελούνται από τους μικρούς πυρήνες 0,6 - 3,0 χιλ. του ιστού από τις ομάδες δεδομένων παραφίνης ιστού χορηγών που παρατάσσονται σε μια υψηλή πυκνότητα σε μια φωτογραφική διαφάνεια.
Διορατικότητα τεχνολογίας: προσδιορισμός των biomarkers με την microarray τεχνολογία Ιένα μ Giltnane ιστού και του Δαβίδ L Rimm Nature την ογκολογία (2004) 1, 104-111 Clinical πρακτικής
Ο ιστός Microarrays έχει επιτρέψει η παραδοσιακή ανάλυση ότι ιστού των συμβατικών ιστολογικών ομάδων δεδομένων παραφίνης για να γίνει και υψηλός-ρυθμοαπόδοση.
Οι histochemical και μοριακές τεχνικές ανίχνευσης μπορούν να χρησιμοποιηθούν στις φωτογραφικές διαφάνειες TMA, και να επιτρέψουν έτσι σε TMAs για να είναι ισχυρά εργαλεία για να εξετάσουν την έκφραση γονιδίων που σχεδιάζει περίγραμμα στα κράτη ασθενειών σε ποικίλους ασθενείς και όρους ασθενειών.
Περιεχόμενο Microarray ιστού
Χαρακτηριστικά των σειρών ιστού
Χαρακτηριστικά του ιστού Microarrays:
- 50 - 500 ιστοί ή περισσότεροι μπορούν να αναλυθούν ανά ομάδα δεδομένων φωτογραφικών διαφανειών
- υψηλή ρυθμοαπόδοση
- σχετικά χαμηλότερο κόστος
- μπορέστε να λεκιαστείτε με ποικίλους λεκέδες όπως το χ & το ε που λεκιάζουν
- οι φωτογραφικές διαφάνειες μπορούν να αναλυθούν με μια ευρύς-ποικιλία των τεχνικών
- αυτοματοποιημένες ανάλυση και συλλογή δεδομένων με πολλές τεχνικές
Σύνθεση Microarray ιστού:
Ο ιστός Microarrays παράγεται χρησιμοποιώντας microtome που ιστός τμημάτων στα τμήματα 4 - 5 μικρόμετρων (δείτε το σχήμα 1 ανωτέρω). Αυτοί αφαιρούν τον πυρήνα τα τμήματα βιοψιών ιστού λαμβάνονται από τους συγκεκριμένους τομείς ενδιαφέροντος από τις παραφίνη-ενσωματωμένες ομάδες δεδομένων ιστού. Αυτοί οι cynlindrical πυρήνες του ιστού επαν-ενσωματώνονται τις παραταγμένες κενές λαμβάνουσες ομάδες δεδομένων. Χρησιμοποιώντας αυτήν την μέθοδο, περισσότεροι από 500 πυρήνες ιστού μπορούν να παραταχθούν σε μια ενιαία φωτογραφική διαφάνεια! Η κύρια ομάδα δεδομένων αναπτύχθηκε από Konenen και λοιποί.
Εφαρμογές του ιστού Microarrays:
- Immunohistochemistry
- Λέκιασμα: Χ & ε, HC, ISH,
- Κανονική υβριδοποίηση
- Φθορισμού κανονική υβριδοποίηση (ΨΑΡΙΑ)
- Κανονικό pcr
- RNA ή ανάλυση έκφρασης DNA
- Δοκιμή TUNEL για το apoptosis
- Μορφολογικός και κλινικός χαρακτηρισμός πολλών υπομονετικών ιστών
Πλεονεκτήματα των σειρών ιστού ή των τσιπ ιστού:
- Πειραματική ομοιομορφία
- Επιτρέπει την ενίσχυση (και τη συντήρηση) των λιγοστών δειγμάτων ιστού
- Διάσωση της έντασης του ήχου δοκιμής
- Μειώνει τον αριθμό φωτογραφικών διαφανειών που εξετάζονται (συμβατική παραφίνη ιστού φωτογραφικών διαφανειών)
- Υψηλός-ρυθμοαπόδοση
- Η ανάλυση μπορεί να αυτοματοποιηθεί και τα στοιχεία μπορούν να μηχανογραφηθούν
Τύποι ιστών Microarrays:
Cryo - ιστός Microarrays: Θρυο- TMAs χρησιμοποιεί τους παγωμένους ιστούς που ενσωματώνονται σε μια βέλτιστη τέμνουσα ένωση θερμοκρασίας. Αυτά τα cryo-TMAs λόγω στο πάγωμά τους είναι ανώτερα από σταθερούς τους formalin ιστούς για το RNA και την πρωτεϊνική ανάλυση. Επίσης, τα αντισώματα λειτουργούν πολύ betterl με τους παγωμένους ιστούς.
Ιστός Microarrays πολυ-όγκων : ο πολυ-όγκος TMAs ευθυγραμμίζει πολλούς διαφορετικούς τύπους ιστών στη φωτογραφική διαφάνεια. Η τεχνική χρησιμοποιήθηκε αρχικά από Kononen et το Al, το 1998. Το Kononen χρησιμοποίησε αυτόν τον τύπο του TMA για να ανιχνεύσει η έκφραση ότι 6 ενισχύσεων γονιδίων p53 εξετάστηκε επίσης στον ιστό καρκίνου του μαστού.
Ιστός Microarrays προόδου: Αυτός ο τύπος ιστού microarray εξετάζει τα διαφορετικά στάδια της προόδου όγκων (ή ασθενειών) μέσα σε ένα δεδομένο όργανο. Παραδείγματος χάριν, εξέταση των όγκων στο στήθος. Αυτές οι φωτογραφικές διαφάνειες μπορούν έπειτα να δοκιμαστούν για τους δείκτες ενδιαφέροντος, ή η βιοχημική ανάλυση των δειγμάτων μπορεί να γίνει.
Ιστός Microarrays πρόγνωσης: Τα δείγματα ασθενειών όπως οι βιοψίες όγκων μπορούν να ληφθούν από τους ασθενείς και να εξεταστούν. Αυτά τα δείγματα μπορούν να χρησιμοποιηθούν για τις κλινικές συνεχίσεις για να ελέγξουν την πρόοδο του ασθενή. Το στοιχείο αναλύεται έπειτα και συγκρίνεται με άλλα κλινικά στοιχεία.
Λογισμικό και βιοπληροφορική Microarray ιστού:
Περιέχει το ακόλουθο λογισμικό:
Τμα- Deconvoluter και Stainfinder. Το deconvoluter μετατρέπει τα ακατέργαστα σημειώνοντας φύλλα εργασίας από το τρισδιάστατο σχεδιάγραμμα Microarray ιστού σε μια 2$α ταξινομημένη σε πίνακες επιτραπέζια μορφή κατάλληλη για την περαιτέρω ανάλυση στοιχείων.
Ανάλυση στοιχείων σειράς ιστού : Λογισμικό στη δημιουργία μιας διαλογικής βάσης δεδομένων για την όψη εικόνας TMA και την είσοδο στοιχείων.
TAD: Το λογισμικό βάσεων δεδομένων σειράς ιστού για μεταφορτώνει.
TMAJ : σύνολο εργαλείων λογισμικού που χρησιμοποιούνται για να διαχειριστούν τα στοιχεία και τις πληροφορίες ιστού MicroArray (TMA) ..
Αρχικά έγγραφα αναφοράς Microarray ιστού:
Battifora χ: Η ομάδα δεδομένων ιστού multitumor (λουκάνικο): νέα μέθοδος για την immunohistochemical δοκιμή αντισωμάτων. Το εργαστήριο επενδύει το 1986, 55:244248.
Kononen j, Bubendorf λ, Kallioniemi Α, Barlund μ, Schraml π, Leighton s, Torhorst j, Mihatsch MJ, Sauter γ, Kallioniemi op: Ιστός microarrays για τη μοριακή σκιαγράφηση υψηλός-ρυθμοαπόδοσης των δειγμάτων όγκων. Εθνικό MED 1998, 4:844847.
![[أربيك]](http://www.microarraystation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
