Τύποι Microarray και πληροφορίες

Χρησιμοποίηση Microarrays

κατάλογος επιλογής

Μακροχρόνιες oligonucleotide σειρές

πρωτόκολλα
microarray βιοπληροφορική τσιπ
μάθετε
προμηθευτές
συζήτηση φόρουμ σειράς

Πρωτόκολλα DNA Microarray

 

Βιοπληροφορική DNA Microarray

Μάθετε για τα τσιπ DNA

Προμηθευτές και προϊόντα DNA Microarray

Φόρουμ σειράς DNA

Ειδήσεις DNA Microarray

Μακρύ oligonucleotide DNA Microarrays:

Οι μακροχρόνιες oligonucleotide σειρές δημιουργούνται χρησιμοποιώντας είτε την ink-jet εκτύπωση είτε τη ρομποτική εκτύπωση.

Οι αλγόριθμοι χρησιμοποιούνται προκειμένου να σχεδιαστούν τα μακριά oligos του ίδιου μεγέθους περίπου 60 νουκλεοτιδών (60-mers). Εντούτοις, αυτά τα μακρύτερα oligos είναι δυσκολότερο να επιλεχτούν δεδομένου ότι πρέπει να έχουν λίγη ομολογία το ένα στο άλλο.

Η ink-jet εκτύπωση αντλιών παράγει τις σειρές 60-mer. 100 σταγονίδια picoliter των αντιδραστηρίων είναι τυπωμένα επάνω σε μια υδροφοβική επιφάνεια που περιέχει το χημικά ενεργό hyrdoxyl - ομάδες OH. Τα μονομερή DNA phosphoramidite στα σταγονίδια αντιδρούν με τις ομάδες OH, με συνέπεια την ομοιοπολική σύνδεση.

Η φωτογραφική διαφάνεια μπορεί έπειτα να υβριδοποιηθεί με τους επονομαζόμενους ελέγχους DNA. Παρόμοιοι με άλλο DNA microarrays, πλένετε μετά από την υβριδοποίηση, ανιχνεύετε και αναλύετε τα προκύπτοντα στοιχεία.

Οι επιχειρήσεις παράγουν τακτικά τις μακροχρόνιες oligonucleotide σειρές με μεγαλύτερο από 25.000 διαφορετικούς ελέγχους.

 

Διαφορές και πλεονεκτήματα του μακριού oligonucleotide DNA Microarrays:

- Τα μακριά oligos μπορούν να διακρίνουν μεταξύ εναλλακτικά συνδεμένου mRNAs (αυτό είναι αρκετά σημαντικό δεδομένου ότι τα περισσότερα γονίδια έχουν την εναλλακτική λύση isoforms!)

- Τα μακριά oligos (60-mers) είναι ενιαία που προσαράσσουν που κάνουν το συνηθισμένο DNA τα microarray βήματα αλλοίωσης περιττά

- Τα μακριά oligos (60-mers) επιτρέπουν την καλύτερη ιδιομορφία στην microarray υβριδοποίηση DNA

- Εύκολα τροποποιημένος

- Προσαρμόσιμος