Τύποι Microarray και πληροφορίες

Χρησιμοποίηση Microarrays

κατάλογος επιλογής

Πληροφορίες για το DNA Microarrays

πρωτόκολλα
microarray βιοπληροφορική τσιπ
μάθετε
προμηθευτές
συζήτηση φόρουμ σειράς

Πρωτόκολλα DNA Microarray

 

Βιοπληροφορική DNA Microarray

Μάθετε για τα τσιπ DNA

Προμηθευτές και προϊόντα DNA Microarray

Φόρουμ σειράς DNA

Ειδήσεις DNA Microarray

DNA Microarrays, μια εισαγωγή:

Εισαγωγή σε Microarrays

  Η διαθεσιμότητα ολόκληρων των genomic ακολουθιών από πολλούς οργανισμούς (όπως το ανθρώπινο πρόγραμμα γονιδιώματος) έχει δημιουργήσει την ανάγκη για την υψηλή ανάλυση ρυθμοαπόδοσης των προτύπων έκφρασης γονιδίων.

Το DNA microarrays έχει ξεσηκώσει τη λειτουργική και genomic ανάλυση.

Η εξέλιξη του DNA Microarray:

Στη δεκαετία του '80, οι βακτηριακές αποικίες επισημάνθηκαν στις νάυλον μεμβράνες με τα διαφορετικό genomic ένθετα ή DNAS

Η δεκαετία του '90 οδήγησε στην εμφάνιση των ink-jet μεθόδων επισήμανσης που επέτρεψαν την κανονική σύνθεση των οληγο σημείων 60-mer στις φωτογραφικές διαφάνειες γυαλιού.

Το Affymetrix ανέπτυξε περαιτέρω το DNA microarrays που βασίστηκαν στα υψηλής πυκνότητας oligos 25-mer από τις ανθρώπινες ακολουθίες DNA.

Υπόβαθρο στο DNA Microarrays

Η βασική προϋπόθεση του DNA microarray είναι ότι τα δείγματα ή οι στόχοι RNA είναι υβριδοποιημένα γνωστά DNAS/oligo έλεγχοι στις σειρές.

Το Microarrays είχε ως σκοπό αρχικά να μετρήσει τα επίπεδα έκφρασης γονιδίων μερικών γονιδίων. Πρόσφατα, η υψηλή πυκνότητα microarrays έχει αναπτυχθεί που έχουν επιτρέψει τη σφαιρική ανάλυση της έκφρασης γονιδίων ή του transcriptome.  Αυτή η σφαιρική ανάλυση επιτρέπει σε μια για να καθορίσει την κυψελοειδή λειτουργία των γονιδίων, της φύσης και του κανονισμού των βιοχημικών διαβάσεων, και των ρυθμιστικών μηχανισμών στο παιχνίδι κατά τη διάρκεια ορισμένων κάνοντας σήμα όρων ή ασθενειών.

Κανονισμός της μεταγραφής και του DNA Microarrays

Το ανθρώπινο πρόγραμμα γονιδιώματος έχει επιτρέψει σε έναν απέραντο πλούτο των πληροφοριών για να μπεί στα χέρια μας. Εντούτοις, ένα τεράστιο πρόβλημα αναλύει τα νέα γονίδια και τις υποθετικές ρυθμιστικές λειτουργίες αυτών των γονιδίων. Η microarray ανάλυση DNA έχει επιτρέψει σε αυτά τα πρόσφατα σχολιασμένα γονίδια και τα νέα γονίδια για να εξεταστεί.  Οι νέες ρυθμιστικές διαβάσεις μπορούν να εξεταστούν χρησιμοποιώντας το DNA microarrays. Παραδείγματος χάριν, το νέο γονίδιο μπορεί να είναι ένας μεταγραφικός παράγοντας.  Το Microarrays μπορεί να εξετάσει την επίδραση που το γονίδιο έχει σε χιλιάδες γονίδια σε έναν χρόνο, υπό πολλούς όρους κατά τρόπο απλό και γρήγορο.

Εφαρμογές του DNA Microarrays

Το DNA microarrays έχει χρησιμοποιηθεί για να εξετάσει τις αλλαγές έκφρασης γονιδίων κάτω από τις ασθένειες όπως ο καρκίνος.  Ο όγκος που σχεδιάζει περίγραμμα χρησιμοποιώντας το DNA microarrays επιτρέπει την ανάλυση της ανάπτυξης και την πρόοδο τέτοιων σύνθετων ασθενειών. 

Η χρησιμοποίηση του DNA microarrays, ένα μπορεί να εξετάσει τους στόχους για την ανακάλυψη φαρμάκων και τα πιθανά διαγνωστικά και προγνωστικά biomarkers για πολλές σύνθετες ασθένειες.

Το DNA microarrays χρησιμοποιείται συνήθως για να ανιχνεύσει τους ιούς και άλλα παθογόνα από τα δείγματα αίματος και μπορεί έτσι να χρησιμοποιηθεί ως μέθοδος ανίχνευσης παθογόνων.

Το DNA microarrays έχει χρησιμοποιηθεί πιό πρόσφατα για να προσδιορίσει τους κληρονομικούς δείκτες, και επομένως έχει χρησιμοποιηθεί ως genotyping εργαλείο.

Τα τσιπ SNP βασισμένα στην microarray τεχνολογία DNA έχουν επιτρέψει την υψηλή σκιαγράφηση ρυθμοαπόδοσης των ενιαίων πολυμορφισμών νουκλεοτίδας χρησιμοποιώντας μια προσέγγιση τσιπ ή σειράς.  Αυτό έχει επιτρέψει στους πολυμορφισμούς για να δοκιμαστεί γρηγορότερα και επίσης το relavence τους την ασθένεια που καθορίζεται εύκολα.

Πλεονεκτήματα του DNA Microarrays

Το DNA microarrays είναι καλύτερο από άλλες σχεδιάζοντας περίγραμμα μεθόδους (όπως οι ΛΟΓΙΚΈΣ, SH, pcr μέθοδοι) δεδομένου ότι είναι:

- ευκολότερος να χρησιμοποιήσει

- είναι υψηλός-ρυθμοαπόδοση (μπορεί να αναλύσει χιλιάδες γονίδια ή δείκτες σε έναν χρόνο)

- παράγετε τα μεγάλα ποσά στοιχείων σε λίγο χρόνο

- μην απαιτήστε τη μεγάλης κλίμακας αλληλοuχία

- επιτρέψτε τον ποσοτικό προσδιορισμό χιλιάδων γονίδια από πολλά δείγματα